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羅氏實時熒光定量PCR儀(LightCycler®系統(tǒng))工作原理

2025-6-10  閱讀(66)

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羅氏實時熒光定量PCR儀(LightCycler®系統(tǒng))工作原理

實時熒光定量PCR(Quantitative PCR, qPCR)是一種結(jié)合PCR擴增和熒光檢測的技術(shù),能夠?qū)NA或RNA進行精確定量。羅氏(Roche)的LightCycler®系列儀器(如LightCycler® 480)采用閉管檢測方式,通過監(jiān)測PCR過程中熒光信號的變化,實現(xiàn)核酸的實時定量分析。其核心工作原理可分為以下幾個部分:


1. PCR擴增與熒光檢測的結(jié)合

實時熒光定量PCR在傳統(tǒng)PCR的基礎(chǔ)上引入熒光標記探針或染料,使擴增過程可以被實時監(jiān)測。羅氏LightCycler®系統(tǒng)的主要檢測方式包括:

(1) 基于熒光探針的檢測(如TaqMan探針)

  • 探針結(jié)構(gòu)

    • 探針兩端分別標記熒光報告基團(如FAM)淬滅基團(如TAMRA或BHQ)。

    • 探針與目標DNA序列互補結(jié)合。

  • 工作原理

    • 在PCR延伸階段,Taq DNA酶發(fā)揮5'→3'外切酶活性,切割探針,使報告基團與淬滅基團分離。

    • 報告基團釋放熒光信號,其強度與PCR產(chǎn)物量成正比。

(2) 基于DNA結(jié)合染料的檢測(如SYBR Green)

  • 染料特性:SYBR Green可非特異性地結(jié)合雙鏈DNA,并在激發(fā)后發(fā)出熒光。

  • 檢測方式

    • 每輪PCR循環(huán)后,檢測熒光強度,反映雙鏈DNA的累積量。

    • 需配合熔解曲線分析(Melting Curve Analysis)驗證擴增特異性。


2. 光學檢測系統(tǒng)

羅氏LightCycler®儀器采用多通道熒光檢測,主要流程如下:

  1. 激發(fā)光源:LED或鹵素燈提供特定波長的激發(fā)光(如470nm、530nm等)。

  2. 熒光采集

    • 光學傳感器在每輪PCR循環(huán)后掃描各孔熒光信號。

    • 支持多重檢測(如FAM、HEX、ROX、Cy5等不同熒光通道)。

  3. 信號處理

    • 軟件記錄熒光強度變化,生成擴增曲線(Amplification Plot)。


3. 定量分析原理

(1) 閾值循環(huán)數(shù)(Ct值)

  • Ct值(Threshold Cycle):熒光信號達到設(shè)定閾值所需的PCR循環(huán)數(shù)。

  • 定量依據(jù)

    • 初始模板量越高,Ct值越??;反之,Ct值越大。

    • 通過標準曲線法(絕對定量)ΔΔCt法(相對定量)計算目標核酸濃度。

(2) 標準曲線法(絕對定量)

  1. 使用已知濃度的標準品(如質(zhì)粒DNA)進行梯度稀釋并擴增。

  2. 繪制Ct值-log(起始拷貝數(shù))標準曲線

  3. 根據(jù)待測樣本的Ct值,計算其初始模板量。

(3) 熔解曲線分析(特異性驗證)

  • 適用情況:使用SYBR Green等非特異性染料時。

  • 原理

    • PCR結(jié)束后,緩慢升溫(如60°C→95°C),使雙鏈DNA解鏈。

    • 監(jiān)測熒光信號隨溫度的變化,生成熔解曲線。

    • 單一峰表示特異性擴增;多峰提示引物二聚體或非特異性產(chǎn)物。


4. 羅氏LightCycler®系統(tǒng)的技術(shù)特點

  1. 快速溫控

    • 采用Peltier半導(dǎo)體技術(shù),升降溫速率可達4.8°C/秒,縮短實驗時間。

  2. 多重檢測能力

    • 支持4–6色熒光通道,可同時檢測多個靶標(如病原體分型)。

  3. 閉管操作

    • 減少開蓋污染風險,提高檢測穩(wěn)定性。


5. 應(yīng)用示例

  • 病毒載量檢測(如HIV、HBV):通過Ct值定量病毒RNA/DNA。

  • 基因表達分析(qRT-PCR):比較不同樣本中mRNA的相對表達量。

  • 突變檢測:結(jié)合高分辨率熔解曲線(HRM)分析SNP或點突變。


6. 注意事項

  • 引物/探針設(shè)計:需確保特異性,避免交叉反應(yīng)。

  • 防污染措施:使用UNG酶(尿嘧啶-DNA糖基化酶)降解殘留PCR產(chǎn)物。

  • 儀器校準:定期進行光學校準和溫度驗證,保證數(shù)據(jù)準確性。


總結(jié)

羅氏實時熒光定量PCR儀通過熒光標記探針或染料實時監(jiān)測PCR擴增,結(jié)合多通道光學檢測Ct值分析,實現(xiàn)核酸的精確定量。其核心技術(shù)優(yōu)勢在于快速溫控、多重檢測和閉管操作,適用于臨床診斷、科研及工業(yè)檢測等領(lǐng)域。實驗成功的關(guān)鍵在于優(yōu)化反應(yīng)體系、規(guī)范操作流程并定期維護儀器。


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