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羅氏實時熒光定量PCR儀(LightCycler®系統(tǒng))工作原理
實時熒光定量PCR(Quantitative PCR, qPCR)是一種結(jié)合PCR擴增和熒光檢測的技術(shù),能夠?qū)NA或RNA進行精確定量。羅氏(Roche)的LightCycler®系列儀器(如LightCycler® 480)采用閉管檢測方式,通過監(jiān)測PCR過程中熒光信號的變化,實現(xiàn)核酸的實時定量分析。其核心工作原理可分為以下幾個部分:
1. PCR擴增與熒光檢測的結(jié)合
實時熒光定量PCR在傳統(tǒng)PCR的基礎(chǔ)上引入熒光標記探針或染料,使擴增過程可以被實時監(jiān)測。羅氏LightCycler®系統(tǒng)的主要檢測方式包括:
(1) 基于熒光探針的檢測(如TaqMan探針)
探針結(jié)構(gòu):
探針兩端分別標記熒光報告基團(如FAM)和淬滅基團(如TAMRA或BHQ)。
探針與目標DNA序列互補結(jié)合。
工作原理:
在PCR延伸階段,Taq DNA酶發(fā)揮5'→3'外切酶活性,切割探針,使報告基團與淬滅基團分離。
報告基團釋放熒光信號,其強度與PCR產(chǎn)物量成正比。
(2) 基于DNA結(jié)合染料的檢測(如SYBR Green)
染料特性:SYBR Green可非特異性地結(jié)合雙鏈DNA,并在激發(fā)后發(fā)出熒光。
檢測方式:
每輪PCR循環(huán)后,檢測熒光強度,反映雙鏈DNA的累積量。
需配合熔解曲線分析(Melting Curve Analysis)驗證擴增特異性。
2. 光學檢測系統(tǒng)
羅氏LightCycler®儀器采用多通道熒光檢測,主要流程如下:
激發(fā)光源:LED或鹵素燈提供特定波長的激發(fā)光(如470nm、530nm等)。
熒光采集:
光學傳感器在每輪PCR循環(huán)后掃描各孔熒光信號。
支持多重檢測(如FAM、HEX、ROX、Cy5等不同熒光通道)。
信號處理:
軟件記錄熒光強度變化,生成擴增曲線(Amplification Plot)。
3. 定量分析原理
(1) 閾值循環(huán)數(shù)(Ct值)
Ct值(Threshold Cycle):熒光信號達到設(shè)定閾值所需的PCR循環(huán)數(shù)。
定量依據(jù):
初始模板量越高,Ct值越??;反之,Ct值越大。
通過標準曲線法(絕對定量)或ΔΔCt法(相對定量)計算目標核酸濃度。
(2) 標準曲線法(絕對定量)
使用已知濃度的標準品(如質(zhì)粒DNA)進行梯度稀釋并擴增。
繪制Ct值-log(起始拷貝數(shù))標準曲線。
根據(jù)待測樣本的Ct值,計算其初始模板量。
(3) 熔解曲線分析(特異性驗證)
適用情況:使用SYBR Green等非特異性染料時。
原理:
PCR結(jié)束后,緩慢升溫(如60°C→95°C),使雙鏈DNA解鏈。
監(jiān)測熒光信號隨溫度的變化,生成熔解曲線。
單一峰表示特異性擴增;多峰提示引物二聚體或非特異性產(chǎn)物。
4. 羅氏LightCycler®系統(tǒng)的技術(shù)特點
快速溫控:
采用Peltier半導(dǎo)體技術(shù),升降溫速率可達4.8°C/秒,縮短實驗時間。
多重檢測能力:
支持4–6色熒光通道,可同時檢測多個靶標(如病原體分型)。
閉管操作:
減少開蓋污染風險,提高檢測穩(wěn)定性。
5. 應(yīng)用示例
病毒載量檢測(如HIV、HBV):通過Ct值定量病毒RNA/DNA。
基因表達分析(qRT-PCR):比較不同樣本中mRNA的相對表達量。
突變檢測:結(jié)合高分辨率熔解曲線(HRM)分析SNP或點突變。
6. 注意事項
引物/探針設(shè)計:需確保特異性,避免交叉反應(yīng)。
防污染措施:使用UNG酶(尿嘧啶-DNA糖基化酶)降解殘留PCR產(chǎn)物。
儀器校準:定期進行光學校準和溫度驗證,保證數(shù)據(jù)準確性。
總結(jié)
羅氏實時熒光定量PCR儀通過熒光標記探針或染料實時監(jiān)測PCR擴增,結(jié)合多通道光學檢測和Ct值分析,實現(xiàn)核酸的精確定量。其核心技術(shù)優(yōu)勢在于快速溫控、多重檢測和閉管操作,適用于臨床診斷、科研及工業(yè)檢測等領(lǐng)域。實驗成功的關(guān)鍵在于優(yōu)化反應(yīng)體系、規(guī)范操作流程并定期維護儀器。