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當(dāng)前位置:北京百泰派克生物科技有限公司>>檢測技術(shù)服務(wù)>>蛋白分析>> 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)識別與功能預(yù)測的整合解決方案
產(chǎn)品型號
品 牌百泰派克
廠商性質(zhì)其他
所 在 地北京市
更新時間:2025-06-22 10:04:06瀏覽次數(shù):72次
聯(lián)系我時,請告知來自 化工儀器網(wǎng)質(zhì)譜蛋白質(zhì)組學(xué)檢測技術(shù)服務(wù)
蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜檢測技術(shù)服務(wù)
質(zhì)譜蛋白質(zhì)測序檢測技術(shù)服務(wù)
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在后基因組時代,理解dànbáizhì的三維結(jié)構(gòu)和功能是揭示生命奧秘的關(guān)鍵環(huán)節(jié)。dànbáizhì不僅是細胞的基本執(zhí)行單元,其結(jié)構(gòu)和功能的解析亦是新藥研發(fā)、疾病機制研究以及jīngzhǔn醫(yī)療的核心基礎(chǔ)。目前,X射線晶體學(xué)、核磁共振(NMR)和冷凍電鏡(Cryo-EM)等經(jīng)典結(jié)構(gòu)生物學(xué)方法在精度方面具有顯著優(yōu)勢,但通常面臨周期長、實驗條件苛刻、對樣品純度和穩(wěn)定性依賴性強等挑戰(zhàn)。因此,構(gòu)建高通量、自動化的結(jié)構(gòu)識別與功能預(yù)測整合方案,正成為生命科學(xué)研究的關(guān)鍵方向。
一、dànbáizhì結(jié)構(gòu)識別:從序列走向結(jié)構(gòu)的科學(xué)路徑
dànbáizhì結(jié)構(gòu)分為四個層級:一級序列、二級結(jié)構(gòu)(α-螺旋、β-折疊等)、三級結(jié)構(gòu)(完整空間構(gòu)象)、四級結(jié)構(gòu)(多亞基復(fù)合體)。目前主流結(jié)構(gòu)識別路徑主要依賴以下幾類方法:
1、同源建模與模板比對
通過對比已知結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫中的同源蛋白序列,可推測目標蛋白的三維構(gòu)象。該方法依賴于目標蛋白與模板蛋白間的序列相似性,是結(jié)構(gòu)預(yù)測的“黃金起點"。
2、去模板建模(Ab Initio 方法)
當(dāng)缺乏可靠模板時,Ab Initio 模型基于物理化學(xué)原理和進化信息預(yù)測結(jié)構(gòu),盡管精度相對較低,但在未知結(jié)構(gòu)探索中具有bùkětìdài的價值。
3、深度學(xué)習(xí)輔助預(yù)測
近年來,AI 驅(qū)動的結(jié)構(gòu)預(yù)測工具取得重大突破,可在不依賴同源模板的前提下,基于多序列比對和殘基接觸預(yù)測,快速生成高置信度結(jié)構(gòu)模型。這標志著結(jié)構(gòu)生物信息學(xué)正從經(jīng)驗規(guī)則走向數(shù)據(jù)驅(qū)動的新范式。
二、dànbáizhì功能預(yù)測:從結(jié)構(gòu)走向生物學(xué)意義
結(jié)構(gòu)即功能。dànbáizhì的空間構(gòu)象直接決定其功能屬性,因此基于結(jié)構(gòu)的功能預(yù)測成為研究重點。整合多源信息的生物信息學(xué)工具正在重塑功能預(yù)測的效率與準確性。
1、活性位點與結(jié)構(gòu)域識別
結(jié)構(gòu)域(domain)是dànbáizhì的功能單元。通過結(jié)構(gòu)比對與已知結(jié)構(gòu)注釋,可以識別潛在的酶活性位點、結(jié)合口袋、轉(zhuǎn)運通道等關(guān)鍵區(qū)域。
2、分子對接與功能注釋
結(jié)合小分子對接、蛋白-蛋白互作預(yù)測等方法,可進一步推斷其潛在底物、配體或調(diào)控機制,支持藥物靶點篩選和功能驗證。
3、網(wǎng)絡(luò)與系統(tǒng)生物學(xué)整合
結(jié)構(gòu)和功能信息若脫離系統(tǒng)環(huán)境,將難以實現(xiàn)完整理解。因此,越來越多研究將結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果整合進dànbáizhì互作網(wǎng)絡(luò)、信號通路分析、以及多組學(xué)協(xié)同解釋中,實現(xiàn)由點到面的功能詮釋。
三、整合式解決方案:打通“序列-結(jié)構(gòu)-功能"閉環(huán)
為了提升結(jié)構(gòu)識別與功能預(yù)測的效率和可靠性,科研人員亟需一套系統(tǒng)化的解決方案,從序列輸入到功能注釋輸出,實現(xiàn)流程自動化、結(jié)果高可信。
※ 關(guān)鍵環(huán)節(jié)包括:
序列預(yù)處理與質(zhì)量控制:去除低質(zhì)量序列、剪裁信號肽、統(tǒng)一命名格式;
結(jié)構(gòu)預(yù)測引擎選擇與參數(shù)優(yōu)化:根據(jù)目標蛋白特性,選擇zuì適合的建模工具并設(shè)定優(yōu)化參數(shù);
結(jié)構(gòu)注釋與功能映射整合:結(jié)構(gòu)域識別、功能位點注釋、GO term 或 KEGG 通路關(guān)聯(lián);
多組學(xué)數(shù)據(jù)聯(lián)動:與轉(zhuǎn)錄組、代謝組或蛋白互作組數(shù)據(jù)聯(lián)動分析,提升功能注釋的上下文準確性;
可視化輸出與報告生成:自動生成結(jié)構(gòu)圖譜、功能注釋報告,便于項目交付與科研交流。
四、應(yīng)用場景與jiàzhítǐxiàn
靶點發(fā)現(xiàn)與驗證:預(yù)測蛋白結(jié)構(gòu)和功能位點,支持新靶點篩選;
突變功能研究:評估結(jié)構(gòu)變異對功能的影響,解釋疾病機制;
生物制劑設(shè)計:優(yōu)化蛋白穩(wěn)定性與活性,提升候選藥物成功率;
功能未知蛋白注釋:為高通量組學(xué)數(shù)據(jù)中的“灰色蛋白"賦予生物學(xué)意義。
dànbáizhì結(jié)構(gòu)識別與功能預(yù)測正逐步從“單點工具"走向“整合平臺",其科學(xué)價值和應(yīng)用潛力正在被不斷放大。百泰派克生物科技致力于提供高效、可靠的dànbáizhì結(jié)構(gòu)鑒定服務(wù),助力您更更深入地探索dànbáizhì世界的結(jié)構(gòu)奧秘與功能本質(zhì)。歡迎聯(lián)系我們,了解更多定制化服務(wù)方案。
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù),包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù),對蛋白序列進行分析。
※服務(wù)優(yōu)勢:
1.采用目前世界上*的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù),助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。
※服務(wù)優(yōu)勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析,發(fā)現(xiàn)新的生物標記物;
2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質(zhì)譜分析靈敏度高,實驗結(jié)果重復(fù)度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學(xué)分析,分析更系統(tǒng)準確。
百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進行單細胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內(nèi)部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質(zhì)譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質(zhì)量譜,zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細胞表面和內(nèi)部的信號分子表達量。
※服務(wù)優(yōu)勢:
1.技術(shù)*,*技術(shù)空白
采用金屬標記抗體技術(shù),避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題??稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數(shù)量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右,而流式質(zhì)譜技術(shù)一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現(xiàn)了數(shù)量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應(yīng)用前景大
①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外,質(zhì)譜流式細胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺進行免疫肽組學(xué)分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復(fù)的識別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù),MALDI TOF,高效色譜分離技術(shù),提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析,到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù),幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務(wù)。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則,通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認證,建立了完備的質(zhì)量體系,數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,設(shè)備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù),支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。
1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù);
2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù);
3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等;
4.七大質(zhì)量控制檢測平臺,滿足您一站式服務(wù)需求;
5.服務(wù)3000+企業(yè),10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!
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