基于LC-MS的無標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)：高效鑒定與定量分析檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹

在生命科學(xué)研究中，全面、準(zhǔn)確地揭示dànbáizhì的表達(dá)變化對于理解生物過程和疾病機(jī)制至關(guān)重要。無biāojìdìng量dànbáizhì組學(xué)（Label-Free Quantitative Proteomics, LFQ）憑借其靈活性高、樣本需求少、成本較低等優(yōu)勢，正逐漸成為dànbáizhì定量分析的重要手段。液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)（LC-MS）作為核心平臺，為無biāojìdìng量提供了高通量、定量準(zhǔn)確的技術(shù)支撐。本文將系統(tǒng)介紹基于LC-MS的無biāojìdìng量dànbáizhì組學(xué)的基本原理、技術(shù)流程及其在高效鑒定與定量分析中的應(yīng)用優(yōu)勢。

一、無biāojìdìng量dànbáizhì組學(xué)概述

無biāojìdìng量方法通過直接比較不同樣本中肽段離子峰的強(qiáng)度或譜數(shù)，推測dànbáizhì的相對含量變化。常用的無biāojìdìng量策略包括基于峰面積積分（Intensity-based Quantification）和基于譜計數(shù)（Spectral Counting）。與biāojìdìng量（如TMT、iTRAQ）相比，無biāojìdìng量省去了昂貴的標(biāo)記步驟，適合樣本數(shù)量多、異質(zhì)性高的研究場景。

二、LC-MS在無biāojìdìng量中的核心作用

1、高分辨率分離與檢測

液相色譜（LC）能夠高效分離復(fù)雜dànbáizhì消化液中的多肽組分，極大提高了質(zhì)譜（MS）檢測的動態(tài)范圍與靈敏度。現(xiàn)代高分辨率質(zhì)譜儀，如Orbitrap和Q-TOF平臺，能夠提供亞ppm級的質(zhì)量準(zhǔn)確度和優(yōu)異的重復(fù)性，確保定量結(jié)果的可靠性。

2、數(shù)據(jù)采集模式：DDA與DIA

（1）數(shù)據(jù)依賴采集（DDA）：按預(yù)設(shè)規(guī)則選擇zuì強(qiáng)離子進(jìn)行MS/MS碎片分析，常用于初步鑒定；

（2）數(shù)據(jù)獨(dú)立采集（DIA）：對所有離子并行碎片化，提高了數(shù)據(jù)完整性和定量一致性，特別適合大規(guī)模無biāojìdìng量項目。

在百泰派克生物科技，我們靈活結(jié)合DDA和DIA策略，依據(jù)項目需求定制zuì佳實驗設(shè)計，確保獲得全面且jīngzhǔn的dànbáizhì定量數(shù)據(jù)。

三、基于LC-MS的無biāojìdìng量dànbáizhì組學(xué)標(biāo)準(zhǔn)流程

1、樣本制備與dànbáizhì消化

優(yōu)化蛋白提取、定量和酶切（如FASP、SP3方法）是保障數(shù)據(jù)質(zhì)量的dìyī步。百泰派克采用高效、低偏倚的樣本處理流程，兼顧不同樣本類型（如組織、血漿、細(xì)胞系）。

2、LC-MS分析

通過納升流LC系統(tǒng)（nanoLC）耦合高分辨率質(zhì)譜，采用優(yōu)化的梯度洗脫方案，提高肽段覆蓋率和定量精度。

3、數(shù)據(jù)處理與定量分析

利用優(yōu)良的分析軟件（如MaxQuant、DIA-NN、Spectronaut）進(jìn)行原始數(shù)據(jù)處理，結(jié)合歸一化算法（如LFQ Intensity、iBAQ、MSstats）實現(xiàn)jīngzhǔn定量。

4、生物信息學(xué)挖掘

進(jìn)一步進(jìn)行統(tǒng)計分析（如差異表達(dá)分析）、富集分析（GO、KEGG）及網(wǎng)絡(luò)分析（PPI），挖掘潛在的生物學(xué)意義。

四、基于LC-MS的無biāojìdìng量dànbáizhì組學(xué)的優(yōu)勢與挑戰(zhàn)

1、優(yōu)勢

（1）無標(biāo)記、成本可控：無需昂貴的標(biāo)記試劑，降低整體實驗費(fèi)用；

（2）樣本適應(yīng)性強(qiáng)：適合組織、體液、細(xì)胞等多種類型；

（3）靈活擴(kuò)展：便于增加樣本批次，無需預(yù)先計劃標(biāo)簽數(shù)；

（4）高通量與高重復(fù)性：特別是在高分辨質(zhì)譜支持下，能實現(xiàn)成百上千蛋白的jīngquè定量。

2、挑戰(zhàn)

（1）技術(shù)依賴性高：對樣本制備、儀器穩(wěn)定性及數(shù)據(jù)處理要求嚴(yán)格；

（2）數(shù)據(jù)量龐大，解析復(fù)雜：需要高效的計算平臺與zhuānyè的數(shù)據(jù)分析能力。

百泰派克生物科技依托優(yōu)良的儀器平臺與經(jīng)驗豐富的科研團(tuán)隊，從樣本準(zhǔn)備到數(shù)據(jù)解析提供一站式服務(wù)，助力客戶高效完成無biāojìdìng量dànbáizhì組學(xué)研究。

五、應(yīng)用場景示例

• 疾病生物標(biāo)志物篩選：通過不同組學(xué)樣本間dànbáizhì表達(dá)量差異，發(fā)現(xiàn)潛在生物標(biāo)志物；

• 機(jī)制研究：揭示信號通路變化，探索疾病發(fā)生發(fā)展的分子機(jī)制；

• 藥物作用機(jī)制解析：監(jiān)測藥物處理前后dànbáizhì表達(dá)譜變化，評估療效或副作用；

• 生物過程動態(tài)監(jiān)測：如干細(xì)胞分化、免疫應(yīng)答等動態(tài)事件中的dànbáizhì組變化。

百泰派克生物科技的無biāojìdìng量解決方案

百泰派克生物科技基于國際lǐngxiān的Orbitrap Exploris 480和timsTOF Pro平臺，結(jié)合自主優(yōu)化的LFQ工作流程，已成功為多家高校、醫(yī)院及生物醫(yī)藥企業(yè)提供高質(zhì)量的無biāojìdìng量dànbáizhì組學(xué)服務(wù)。我們的優(yōu)勢包括：

• 樣本適配廣泛（組織、血清、外泌體等）

• 高覆蓋率（單次分析可鑒定>6000蛋白）

• 高定量準(zhǔn)確性（CV≤20%）

• 個性化數(shù)據(jù)分析報告，支持SCI論文發(fā)表

基于LC-MS的無biāojìdìng量dànbáizhì組學(xué)正在以其dútè的優(yōu)勢推動生命科學(xué)研究不斷向前。隨著儀器性能與數(shù)據(jù)分析方法的持續(xù)進(jìn)步，其應(yīng)用領(lǐng)域?qū)⒏訌V闊。百泰派克生物科技致力于以zhuānyè的技術(shù)力量和優(yōu)質(zhì)的服務(wù)體驗，助力您的科研探索與創(chuàng)新突破。如果您正在尋找高效、可靠的無biāojìdìng量dànbáizhì組學(xué)合作伙伴，歡迎聯(lián)系我們，了解更多定制化服務(wù)方案！

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù)，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù)，對蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達(dá) 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實驗結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.技術(shù)優(yōu)良，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細(xì)胞層面上對多種指標(biāo)同時進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實現(xiàn)了數(shù)量級的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務(wù)。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù)；

2.獲國家CNAS實驗室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

基于LC-MS的無標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)：高效鑒定與定量分析檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹