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Cell:揭示DNA的三維包裝調(diào)節(jié)細(xì)胞身份機(jī)制

閱讀:892      發(fā)布時(shí)間:2017-10-16
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圖片來(lái)自Cell,doi:10.1016/j.cell.2017.09.018。

 

細(xì)胞如何保持它的身份(比如成為肌肉細(xì)胞或神經(jīng)細(xì)胞)的基本機(jī)制并沒(méi)有*得到理解。癌癥等多種疾病與細(xì)胞在成熟過(guò)程中選擇錯(cuò)誤的發(fā)育通路相關(guān)聯(lián)。在一項(xiàng)新的研究中,來(lái)自美國(guó)賓夕法尼亞大學(xué)佩雷爾曼醫(yī)學(xué)院和西奈山伊坎醫(yī)學(xué)院的研究人員提出干細(xì)胞分化為心肌細(xì)胞(以及其他的細(xì)胞類(lèi)型)的能力依賴于基因組中哪些區(qū)域被激活,而這是由DNA在細(xì)胞核中的位置控制著的。相關(guān)研究結(jié)果于2017年10月12日在線發(fā)表在Cell期刊上,論文標(biāo)題為“Genome-Nuclear Lamina Interactions Regulate Cardiac Stem Cell Lineage Restriction”。論文通信作者為賓夕法尼亞大學(xué)佩雷爾曼醫(yī)學(xué)院執(zhí)行副主任、科學(xué)家Jonathan A. Epstein博士和賓夕法尼亞大學(xué)佩雷爾曼醫(yī)學(xué)院心血管醫(yī)學(xué)助理教授Rajan Jain博士。

Jain說(shuō),“這項(xiàng)研究的基礎(chǔ)在于理解細(xì)胞對(duì)分子信號(hào)作出反應(yīng)而正確地變成一種細(xì)胞類(lèi)型的能力。我們想知道這是如何逐步實(shí)現(xiàn)的,這是因?yàn)槟軌蜃兂审w內(nèi)任何一種細(xì)胞類(lèi)型的干細(xì)胞會(huì)產(chǎn)生心肌細(xì)胞。”

這項(xiàng)研究也提示著了解控制干細(xì)胞在成熟期間如何快速地分化的方式對(duì)再生醫(yī)學(xué)產(chǎn)生重要的影響?;蚪M的一些區(qū)域是無(wú)法表達(dá)的,這是因?yàn)樗鼈儽痪o密地包裹在細(xì)胞核的內(nèi)膜(即核纖層)上。這些被隔離和沉默的DNA區(qū)域被稱(chēng)作核纖層蛋白結(jié)合區(qū)域(lamin associated domains, LAD)。這項(xiàng)研究提示著這些位于細(xì)胞核邊緣的特定DNA沉默區(qū)域有助確定細(xì)胞的身份。比如,如果LAD讓神經(jīng)元基因保持沉默而不會(huì)表達(dá)的話,那么這種細(xì)胞就不會(huì)成為神經(jīng)元。然而,如果心臟細(xì)胞基因被釋放出來(lái)而能夠表達(dá),就像在心臟發(fā)育過(guò)程中發(fā)生的那樣,那么這些細(xì)胞就變成心肌細(xì)胞。多年來(lái),細(xì)胞生物學(xué)家們就已知道在一些DNA在內(nèi)核膜附近發(fā)現(xiàn)到,但是這種定位的功能是不清楚的。Jain說(shuō),“我們的研究提示著細(xì)胞通過(guò)將變成另一種細(xì)胞類(lèi)型所必需的關(guān)鍵基因和程序儲(chǔ)存在難以接近的區(qū)域中,確定著它的身份。換言之,細(xì)胞保持它的身份是通過(guò)抑制它變成其他的身份實(shí)現(xiàn)的。”

這些研究人員發(fā)現(xiàn)一種被稱(chēng)作組蛋白去乙?;福℉dac3)的表觀遺傳酶將DNA附著到細(xì)胞核邊緣上。Jain說(shuō),“我們問(wèn)道:對(duì)DNA可接近性的精心控制會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞變成某種細(xì)胞類(lèi)型嗎?”當(dāng)他們?cè)谛呐K細(xì)胞分化期間移除干細(xì)胞中的Hdac3時(shí),它們釋放含有心臟特異性基因的DNA區(qū)域,允許這些基因被激活,從而導(dǎo)致過(guò)早過(guò)快的分化。

Epstein說(shuō),“這項(xiàng)研究的影響是深遠(yuǎn)的。控制細(xì)胞如何快速地分化為心肌細(xì)胞或其他的細(xì)胞類(lèi)型的能力對(duì)再生醫(yī)學(xué)產(chǎn)生重要的影響。”此外,在癌癥等很多疾病中,細(xì)胞表達(dá)它們?cè)谡G樾螘r(shí)不會(huì)表達(dá)的基因,從而改變了它們的身份。

這些研究也解決了干細(xì)胞和發(fā)育生物學(xué)中的一個(gè)經(jīng)典概念,即“感受性(competence)”---細(xì)胞以一種特定的方式對(duì)它的環(huán)境作出反應(yīng)的能力。比如,一些肺細(xì)胞對(duì)香煙煙霧作出反應(yīng)而發(fā)生癌變,而其他的肺細(xì)胞則不會(huì)。這些研究人員推測(cè)這種差異可能是因?yàn)閷?duì)香煙煙霧中的化學(xué)物質(zhì)作出反應(yīng)的基因是可接近的,或者在沒(méi)有反應(yīng)性的細(xì)胞中,這些相同的基因被鎖定在細(xì)胞核邊緣的沉默區(qū)域中而變得不可接近。

Jain、Epstein和其他人正在努力確定處于細(xì)胞核邊緣的基因組區(qū)域或者讓它們保持在那里的分子固定物發(fā)生的變化是否導(dǎo)致癌癥易感性。這種方法也可能應(yīng)用于因遺傳性的核纖層異常附著導(dǎo)致的其他疾病,如幾種肌肉萎縮癥類(lèi)型、心力衰竭和過(guò)早老化。

在未來(lái),這些研究人員計(jì)劃操縱DNA的空間結(jié)構(gòu)來(lái)誘導(dǎo)細(xì)胞獲得不同的身份,并且想知道這可能在與細(xì)胞身份喪失相關(guān)的人類(lèi)疾?。ò?/span>糖尿病、阿爾茨海默病、心力衰竭和癌癥)中發(fā)揮何種作用。他們也正在擴(kuò)大他們的研究來(lái)探究核纖層組分發(fā)生突變的患者。(生物谷 Bioon.com)侵刪

參考資料:

Andrey Poleshko, Parisha P. Shah, Mudit Gupta et al. Genome-Nuclear Lamina Interactions Regulate Cardiac Stem Cell Lineage Restriction. Cell, Published onile: October 12, 2017, doi:10.1016/j.cell.2017.09.018

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