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Nature:人體組織基因活性大規(guī)模破譯

閱讀:822      發(fā)布時(shí)間:2017-10-16
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我們能破譯所有人體組織的基因活性嗎?英國(guó)《自然》和《自然·遺傳學(xué)》雜志發(fā)表一系列基因組學(xué)論文,全面介紹了基因表達(dá)在人體不同組織和不同個(gè)體中的差異,這些發(fā)現(xiàn)為認(rèn)識(shí)健康組織中基因變異和基因表達(dá)的關(guān)聯(lián)帶來了新啟示,為揭示有關(guān)疾病分子的起源提供了新線索。

 

人類基因組編碼指令調(diào)控著基因表達(dá),基因表達(dá)因細(xì)胞類型的不同而存在差異,產(chǎn)生具有不同功能的多樣化組織;它們?cè)诓煌瑐€(gè)體中也存在差異。驅(qū)動(dòng)這些差異產(chǎn)生的序列一般處于基因組的非編碼區(qū)域,它們決定基因表達(dá)的方式和時(shí)間。但是,目前有關(guān)基因調(diào)控和基因表達(dá)在不同人體組織和個(gè)體中的差異的研究仍然有限。

 

基因型—組織表達(dá)(GTEx)研究聯(lián)盟收集并研究了來自449名生前健康的人類捐獻(xiàn)者的7000多份尸檢樣本,涵蓋44個(gè)組織(42種不同的組織類型),包括31個(gè)實(shí)體器官組織、10個(gè)腦分區(qū)、全血、兩個(gè)來自捐獻(xiàn)者血液和皮膚的細(xì)胞系,美國(guó)博德研究所科學(xué)家利用這些樣本,分析了基因表達(dá)在不同組織和個(gè)體中有何差異。他們采用了表達(dá)定量性狀遺傳位點(diǎn)(eQTL)作圖法,顯示大多數(shù)的人類基因受局部變異的影響,變異序列靠近受影響的基因。同時(shí)還鑒定出有93個(gè)基因的表達(dá)受到距離較遠(yuǎn)的變異的影響,包括位于不同染色體上的變異。

 

《自然》另一篇論文考察了罕見變異在基因表達(dá)中的作用,兩篇論文采用GTEx數(shù)據(jù),探討了與基因表達(dá)相關(guān)聯(lián)的基因變異如何能調(diào)節(jié)RNA編輯和X染色體失活現(xiàn)象。在《自然·遺傳學(xué)》的文章中,作者介紹了GTEx項(xiàng)目的擴(kuò)展,其為研究遺傳差異如何通過分子表型一步步影響人類健康提供了資源。

 

綜合而言,這些成果凸顯了源自不同個(gè)體和不同組織的數(shù)據(jù)對(duì)于鑒定人類疾病相關(guān)變異背后的基因和機(jī)制的價(jià)值。芝加哥大學(xué)科學(xué)家在評(píng)論文章中稱:各方齊心協(xié)力,克服了大規(guī)模獲取人體死后樣本所存在的倫理、法律和技術(shù)挑戰(zhàn),所生成的廣泛數(shù)據(jù),使人類向破譯基因組調(diào)控密碼又前進(jìn)了一步,而基因變異對(duì)于基因表達(dá)的影響正逐漸變得明晰起來。(生物谷Bioon.com)侵刪

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