GPF-DIA和Direct DIA：哪個更適合大規(guī)模蛋白定量？檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹

在大規(guī)模dànbáizhì組學(xué)研究中，數(shù)據(jù)獨(dú)立采集（DIA, Data-Independent Acquisition）技術(shù)因其高通量、高重現(xiàn)性和數(shù)據(jù)完整性，已成為主流。然而，DIA的發(fā)展也催生了多種策略，其中以GPF-DIA（Gas Phase Fractionation DIA）與Direct DIA（直接DIA）zuì為常見。兩者在譜圖庫構(gòu)建方式、實(shí)驗(yàn)流程與適用場景上存在顯著差異。本文將系統(tǒng)比較這兩種DIA策略，幫助科研人員在不同研究需求下作出科學(xué)選擇。

一、什么是GPF-DIA？

GPF-DIA是一種通過氣相分級提升譜圖庫質(zhì)量的DIA策略。研究人員將混合樣本在質(zhì)譜m/z維度進(jìn)行分段采集（如每次覆蓋一個100–150 m/z的窗口），從而獲得更高的MS/MS覆蓋度。隨后，以這些高覆蓋度數(shù)據(jù)構(gòu)建實(shí)驗(yàn)樣本特異性的DIA譜圖庫，用于后續(xù)大批量樣本的定量分析。

? GPF-DIA的特點(diǎn)：

• 蛋白鑒定更深：適合發(fā)掘低豐度、差異性蛋白

• 譜圖庫質(zhì)量更高：針對目標(biāo)樣本構(gòu)建，具有高度代表性

• 定量準(zhǔn)確性更優(yōu)：尤其適合機(jī)制研究與生物標(biāo)志物挖掘

• 實(shí)驗(yàn)成本較高：需額外運(yùn)行多個氣相分級樣本，增加儀器時間與樣本消耗

二、什么是Direct DIA？

Direct DIA則wánquán跳過譜圖庫構(gòu)建步驟，直接利用軟件算法（如DIA-NN、Spectronaut）從原始DIA數(shù)據(jù)中進(jìn)行蛋白鑒定與定量。這種“譜庫自由"方式顯著簡化了實(shí)驗(yàn)流程，并具備良好的通量擴(kuò)展性。

? Direct DIA的特點(diǎn)：

• 流程更簡潔：無需分級與譜圖庫采集

• 更適合高通量項(xiàng)目：如臨床隊(duì)列研究、藥物篩選等

• 對樣本量要求低：適合樣本寶貴或難以批量制備的項(xiàng)目

• 鑒定深度略遜：對極低豐度蛋白的識別能力有限

三、GPF-DIA vs Direct DIA：核心指標(biāo)對比

四、如何選擇更適合的DIA策略？

選擇DIA策略的核心在于研究目標(biāo)與資源配置：

• 如果您關(guān)注的是蛋白鑒定深度與定量精度，如疾病機(jī)制解析、功能蛋白篩選或圖譜構(gòu)建，GPF-DIA更具優(yōu)勢。

• 若研究更強(qiáng)調(diào)樣本通量、數(shù)據(jù)處理效率與自動化能力，如大型臨床樣本隊(duì)列、藥效評估或多時間點(diǎn)干預(yù)實(shí)驗(yàn)，Direct DIA是更高效的選擇。

科學(xué)地根據(jù)項(xiàng)目需求選用DIA策略，不僅提升數(shù)據(jù)質(zhì)量，也能顯著優(yōu)化成本效益比。百泰派克生物科技提供多樣化DIA策略支持，滿足從基礎(chǔ)科研到臨床轉(zhuǎn)化的廣泛需求。不論您的研究聚焦于生物機(jī)制探索，還是臨床應(yīng)用開發(fā)，我們都可為您提供定制化蛋白組學(xué)解決方案。了解更多DIA策略選擇建議或獲取典型項(xiàng)目案例，歡迎聯(lián)系我們！

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù)，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù)，對蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達(dá) 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.技術(shù)優(yōu)良，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題?？稍趩渭?xì)胞層面上對多種指標(biāo)同時進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù)；

2.獲國家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

GPF-DIA和Direct DIA：哪個更適合大規(guī)模蛋白定量？檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹