巨噬细胞Macrophages是除粒细胞（嗜中性粒细胞、嗜酸性粒细胞和嗜碱性粒细胞）和树突状细胞（DC）之外的三种吞噬细胞类型之一。微生物一旦进入宿主，机体的第一道免疫防线就打开，这些吞噬细胞中的一种或者多种就会将其识别并吞噬破坏，这一过程称为吞噬作用。大多数病原体通过呼吸系统、肠粘膜、皮肤损伤或泌尿生殖道进入宿主。由于巨噬细胞聚集在粘膜下层组织中，它们通常是第一个遇到病原体的防御细胞。当某些吞噬细胞受体（通常是病原体*的碳水化合物或脂质结构）与病原体表面相互作用时，吞噬作用就开始了。

在第一次相互作用后，吞噬细胞质膜将病原体包围并内化在一个被称为吞噬体的大膜包裹的内吞囊泡中。然后吞噬体与一个或多个溶酶体融合，形成吞噬溶酶体，溶酶体是含有抗菌肽和酶的小囊泡。溶酶体内容物被释放到吞噬溶酶体中，吞噬溶酶体反过来经历酸化和酶促过程，生成高活性的一氧化氮和超氧化物自由基来杀死病原体。

关于噬细胞受体的两个例子是Dectin-1和甘露糖受体(CD206)。两者都是C型凝集素样家族的成员。Dectin-1由巨噬细胞和中性粒细胞表达，并与真菌细胞壁中常见的葡萄糖聚合物结合。CD206由巨噬细胞和DC表达，并与真菌、细菌和病毒共有的多种甘露糖基化配体结合。