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導(dǎo)  讀

*學(xué)術(shù)期刊 《Cell》及其子刊公布了“癌癥和腫瘤基因圖譜”（TCGA）的“升級(jí)版”——泛癌癥圖譜（PanCancer Atlas）的研究結(jié)果，相關(guān)結(jié)果以二十幾篇高水平論文呈現(xiàn)，美國(guó)國(guó)家衛(wèi)生研究院資助的科學(xué)家團(tuán)隊(duì)完成大規(guī)模癌癥基因組圖譜繪制，他們根據(jù)基因變異和表達(dá)的相似性，提出可以按照分子類型給癌癥進(jìn)行“歸類”。研究人員認(rèn)為，這將為癌癥診斷和治療提供新思路。

早在十幾年前就已開始的一項(xiàng)大規(guī)模研究工作 “PanCancer Atlas” 近日已全面完成，它為研究人員和臨床醫(yī)生提供了一種根據(jù)其基因組和分子特征全面了解癌癥的新方法。

PanCancer Atlas范圍非常廣，涵蓋了*學(xué)術(shù)期刊《Cell》及其子刊所發(fā)表的二十多篇科學(xué)論文。它代表癌癥基因組圖譜（TCGA）工作中的一個(gè)巨大里程碑。癌癥基因組圖譜（The Cancer Genome Atlas，TCGA）早已為*廣為知曉，這項(xiàng)計(jì)劃于2005年提出，旨在通過(guò)基因組學(xué)分析技術(shù)，將人類全部癌癥的基因組變異圖譜繪制出來(lái)，從而更好地了解癌癥發(fā)生和發(fā)展的機(jī)制。

該項(xiàng)目由國(guó)立衛(wèi)生研究院（NIH）的兩個(gè)研究機(jī)構(gòu)同時(shí)贊助，即國(guó)家癌癥研究所（NCI）和國(guó)家人類基因組研究所。

全美超過(guò)二十多個(gè)研究機(jī)構(gòu)的150多位研究人員參與了這項(xiàng)耗資3億美元的項(xiàng)目。“這個(gè)項(xiàng)目，是十多年開創(chuàng)性工作的結(jié)晶。”美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院院長(zhǎng)弗朗西斯科林斯博士說(shuō)。

從不同的角度看癌癥

癌癥是一種疾病，當(dāng)細(xì)胞由于其DNA的錯(cuò)誤編碼開始失控時(shí)，就會(huì)出現(xiàn)這種疾病。傳統(tǒng)的癌癥分類方法是根據(jù)它在體內(nèi)的起始位置 - 如乳腺癌，前列腺癌或胃癌。

PanCancer Atlas的這項(xiàng)工作是2012年在加利福尼亞圣克魯斯舉行的一次會(huì)議上由Pan-Cancer Initiative發(fā)起的。

那時(shí)，科學(xué)家們已經(jīng)注意到一些關(guān)于癌癥的有趣特征，使他們對(duì)疾病分類的傳統(tǒng)方式產(chǎn)生質(zhì)疑。一個(gè)有趣的特征是，盡管癌細(xì)胞開始于身體的不同部位，但有一些癌癥在分子水平上是相似的。另一個(gè)有趣的特征是，在同一組織中開始的癌癥在分子水平上可能非常不同，具有不同的“基因組譜”。

對(duì)研究人員&臨床醫(yī)生的影響

這些早期的分子形態(tài)促使研究人員調(diào)查每種癌癥基因組中的變化——DNA的完整組合——可能會(huì)驅(qū)動(dòng)某種疾病。

PanCancer Atlas是努力調(diào)查后的結(jié)果，將為改善各類癌癥的預(yù)防，檢測(cè)和治療鋪平道路。

正如Pan-Cancer Initiative協(xié)辦方Josh Stuart--加州大學(xué)圣克魯斯分校生物分子工程教授所說(shuō)：“了解一種癌癥如何與另一種形式的疾病相關(guān)，可能具有真正的臨床意義。”他也認(rèn)為，”在某些情況下，我們可以借鑒已知疾病的臨床實(shí)踐，并將其應(yīng)用于治療方案不明確的癌癥。“

從分子角度看，癌癥也為已被批準(zhǔn)用于其他具有癌癥分子特征的疾病的藥物開辟了道路。其中一個(gè)例子是在類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎中被激活的JAK / Stat分子途徑。研究人員發(fā)現(xiàn)，這個(gè)通路在一些新認(rèn)定的腫瘤組中上調(diào)。

PanCancer Atlas論文

三個(gè)PanCancer Atlas論文集中的每一個(gè)都是由熱點(diǎn)或綜述和論文引入的。在門戶的登錄頁(yè)上有明確的鏈接和相關(guān)文章。

*篇綜述介紹了“cell-of-origin patterns”這一類別，概述了研究人員如何通過(guò)基因表達(dá)，染色體異常和DNA改變使“molecular clustering”形成腫瘤群。它表明這些發(fā)現(xiàn)將使不同類型的癌癥得到更具體的治療。

第二篇綜述介紹了“oncogenic processes” 種類，并認(rèn)為這些發(fā)現(xiàn)將有助于研究人員確定他們應(yīng)該選擇哪些免疫療法和相應(yīng)治療方案的優(yōu)先順序。

除了給出一個(gè)廣泛的總結(jié)，該論文還描述了癌癥發(fā)展中三個(gè)關(guān)鍵過(guò)程的鑒定：①遺傳和獲得性突變; ②腫瘤基因組和表觀基因組如何影響基因和蛋白質(zhì)的表達(dá); ③腫瘤細(xì)胞與免疫系統(tǒng)之間的相互作用。

第三篇綜述整理了“signaling pathways”的類型，并總結(jié)了調(diào)節(jié)細(xì)胞周期，細(xì)胞生長(zhǎng)和細(xì)胞死亡的信號(hào)通路中基因組改變的發(fā)現(xiàn)。這篇論文強(qiáng)調(diào)了這些過(guò)程對(duì)于不同癌癥的相似性和差異性，并表明這些發(fā)現(xiàn)將有助于個(gè)性化用藥，還可以在聯(lián)合治療中開發(fā)新的治療方法。

“這個(gè)項(xiàng)目為癌癥研究人員提供了人類的途徑去了解腫瘤發(fā)生，發(fā)展以及從何而來(lái)等重要信息，從而優(yōu)化臨床試驗(yàn)和未來(lái)的治療方案。”

                                     ——弗朗西斯科林斯博士

參考文獻(xiàn)

Catharine Paddock et.al Why does cancer arise? Landmark study provides unique insight. (2018)