近日，一篇刊登在雜志Nature上題為“Whole-organism clone tracing using single-cell sequencing”的研究報告中，來自荷蘭烏德勒支大學醫(yī)學中心等機構的研究人員通過研究開發(fā)出了一種新方法，能夠利用單細胞測序來進行整個生物有機體的克隆跟蹤，文章中，研究人員描述了如何利用這種方法對條形碼斑馬魚細胞（barcoded zebrafish cells）進行了研究。
研究者表示，胚胎發(fā)育是高度復雜的有機體發(fā)育的一個重要階段，比如人類，僅有非常有限的胚胎祖細胞能夠成功制造出成年機體內(nèi)部所有類型的細胞，為了理解這一過程發(fā)生的機制，研究人員就需要新方法能夠測定克隆歷史的發(fā)生，同時還能在單細胞分辨率下進行細胞的識別；基于此，研究人員開發(fā)出了一種名為ScarTrace的新技術，該技術能夠添加熒光蛋白轉(zhuǎn)基因的串聯(lián)拷貝，從而就能在CRISPR-Cas9基因編輯的轉(zhuǎn)錄過程中有效識別所的“疤痕”。
利用這一技術，研究人員就能夠在編碼的斑馬魚細胞中追蹤克隆起源及細胞結(jié)果，更具體地說，研究者還能夠從多個位點來追蹤成體細胞，這些位點包括腎臟、眼睛等。研究者表示，當祖細胞開始分化增殖產(chǎn)生左眼或右眼組織時，這一技術就能足以研究整個過程，同時研究者還發(fā)現(xiàn)，斑馬魚皮膚和尾鰭中的細胞都來自于同一種祖細胞，此外研究人員還在魚鰭中識別出了免疫細胞以及其它類型血細胞的不同克隆來源。
zui后研究者表示，ScarTrace技術或有望幫助研究人員實現(xiàn)zui終的研究目標，即追蹤從單一細胞發(fā)育成為完整機體過程中所涉及的所有事件，目前研究人員正在同來自中國、英國和美國的科學家們進行合作，研究人員在文中詳細描述了他們基于單細胞測序方法所開發(fā)出的MAP-seq是如何發(fā)揮作用的。（生物谷）
原始出處：
Anna Alemany, Maria Florescu, Chloé S. Baron, et al. Whole-organism clone tracing using single-cell sequencing. Nature 28 March 2018, doi:10.1038/nature25969
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