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【展后速遞】創(chuàng)新型酶法甲基化產(chǎn)品eTAPS亮相P4引關(guān)注

2021-10-25  閱讀(318)

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2021年10月22日,第五屆國際腫瘤精準(zhǔn)醫(yī)療大會(huì)在北京朝陽悠唐假日酒店盛大開幕。翌圣生物攜創(chuàng)新型甲基化酶法轉(zhuǎn)化試劑盒eTAPS亮相大會(huì),引發(fā)行業(yè)關(guān)注。本次大會(huì)設(shè)有會(huì)場A:腫瘤早篩/輔助早診/分型/預(yù)后等技術(shù)創(chuàng)新與應(yīng)用以及會(huì)場B:腫瘤創(chuàng)新藥物療法與標(biāo)志物/伴隨研究的精準(zhǔn)開發(fā)轉(zhuǎn)化兩個(gè)分會(huì)場。結(jié)合當(dāng)下的腫瘤精準(zhǔn)醫(yī)療大環(huán)境,深度探討CDx模式,LDT合規(guī)化路徑,液體活檢,腫瘤早篩等熱點(diǎn)話題,吸引近600名觀眾齊聚現(xiàn)場,共話腫瘤精準(zhǔn)診療。



翌圣生物高級產(chǎn)品經(jīng)理徐正出席峰會(huì)并在腫瘤早診早篩分會(huì)場分享了主題為“eTAPS酶法轉(zhuǎn)化技術(shù)在甲基化檢測中的應(yīng)用"精彩演講,從上游原料商的角度分享了新型的甲基化轉(zhuǎn)化技術(shù)在未來早篩市場的應(yīng)用。首先從腫瘤早篩早檢是降低死亡率的重要路徑入手,引申到基于ctDNA的甲基化檢測是當(dāng)前主流的早篩技術(shù)路徑。進(jìn)而講述翌圣在甲基化檢測領(lǐng)域的的相關(guān)工作。

 

Bisulfite化學(xué)法轉(zhuǎn)化是目前甲基化檢測最主流的前處理方案

甲基化檢測中需要前處理的轉(zhuǎn)化,即區(qū)分甲基化的胞嘧啶以及非甲基化的胞嘧啶。目前主流方案是通過Bisulfite處理,轉(zhuǎn)化效率高達(dá)99%甚至以上,但是其也有最為明顯的不足,會(huì)對DNA造成劇烈的損傷,且最終的回收率往往不足10%,這在一些樣本中如cfDNA中應(yīng)用相對困難。此外,由于是將非甲基化的胞嘧啶轉(zhuǎn)化為尿嘧啶,這會(huì)導(dǎo)致最終的文庫出現(xiàn)堿基失衡的現(xiàn)象。



前人的探索:甲基化檢測的“陰"與“陽"

在這過程中,不少企業(yè)學(xué)者已經(jīng)基于此進(jìn)行探索,比如NEB公司的EM-Seq技術(shù),以及2019年發(fā)表的TAPS技術(shù)等。

 
EM-seq采用酶法轉(zhuǎn)化,但這也僅僅是降低了反應(yīng)的劇烈性,本質(zhì)上其與Bisulfite處理是同一種原理,不但未解決堿基失衡的問題,反而使得操作比Bisulfite更麻煩。此后也有學(xué)者提出了TAPS(TET-assisted pyridine borane sequencing)技術(shù),基本能解決傳統(tǒng)Bisulfite以及EM-seq的不足。但依舊存在自己的問題,比如轉(zhuǎn)化率不高,操作繁瑣以及難以適應(yīng)自動(dòng)化等問題。
 
基于此,目前翌圣開發(fā)的eTAPS轉(zhuǎn)化技術(shù)可作為未來理想的替換方案。通過定向進(jìn)化獲得高活性高質(zhì)量的eTeT1酶,以及對于流程的精簡優(yōu)化,目前可實(shí)現(xiàn)一次氧化,單管操作磁珠回收,可適配未來自動(dòng)化的需求。



目前基于內(nèi)部的評測體系,eTAPS轉(zhuǎn)化效率、DNA回收效率以及錯(cuò)誤率均優(yōu)于Bisulfite,可作為其理想的替換方案。未來基于eTAPS的應(yīng)用,還可延伸至三代測序領(lǐng)域。



 



當(dāng)然,基于eTAPS目前依舊缺乏足夠的終端應(yīng)用場景去進(jìn)行相關(guān)驗(yàn)證,目前也僅是走出了第一步,我們也希望同下游客戶一起共同開發(fā),推進(jìn)eTAPS在腫瘤早篩早診技術(shù)領(lǐng)域的應(yīng)用。

展區(qū)現(xiàn)場,翌圣生物相關(guān)技術(shù)負(fù)責(zé)人也想諸多的參觀者介紹了eTAPS目前相關(guān)的進(jìn)展與數(shù)據(jù),以及公司NGS相關(guān)產(chǎn)品完整的解決方案。




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未來,翌圣生物將深耕分子酶賽道,致力于成為生命科學(xué)工具類產(chǎn)業(yè)
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