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干貨 | 實(shí)驗(yàn)室新寵!這個(gè)PCR試劑竟把實(shí)際上機(jī)時(shí)間壓到60分鐘內(nèi)?

2025-3-19  閱讀(277)

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各擴(kuò)增酶實(shí)際上機(jī)用時(shí)總時(shí)長(包含PCR儀升溫、降溫過程)。

 

10167ES擴(kuò)增3 kb片段上機(jī)時(shí)間僅需59 min!30循環(huán)下,6 kb片段上機(jī)僅需58 min!相比市面上其他產(chǎn)品,最高立省3.7小時(shí)

 

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實(shí)驗(yàn)材料:

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
  • DNA樣本:大腸桿菌菌落、大腸桿菌菌液、農(nóng)桿菌菌落、酵母菌落、小鼠基因組DNA、玉米基因組DNA、水稻基因組DNA。

  • 快速PCR試劑:2×Hieff® Ultra-Rapid II HotStart PCR Master Mix(Cat#10167ES)。

  • 其他試劑:RNase-free H2O或DEPC處理水、相關(guān)基因上下游引物(儲(chǔ)存濃度10 μM)。

  • 設(shè)備與耗材:移液器、PCR儀、冰盒、離心機(jī)、EP管、RNase-free離心管。

 

 

實(shí)驗(yàn)步驟:

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
01

試劑&樣本前期準(zhǔn)備

 

試劑解凍和混勻

 
 
    • 從冰箱中取出:

      從-20℃冰箱中取出含酶試劑,立即放入冰盒中(冰上操作)。

      避免將試劑直接放在室溫下解凍,以免溫度波動(dòng)影響酶的活性。

    • 緩慢解凍:

      讓試劑在冰上自然解凍,通常需要5-10分鐘。

      如果需要快速解凍,可以將試劑握在手中輕輕搖晃,但不要過度加熱。

    • 低速離心:

      PCR Mix在1×預(yù)混液中含有2 mM Mg2+和200 μM的dNTPs,使用前要充分解凍混勻。

      將試劑管短暫離心(5-10秒,1000 rpm左右),使管壁和管蓋上的液體集中到管底。

      離心后置于渦旋儀震蕩10 sec混勻,確保試劑均勻分布。

      混勻后的試劑應(yīng)繼續(xù)放在冰上,避免長時(shí)間暴露在室溫下。

      如溶解后,暫未使用,可暫時(shí)儲(chǔ)存于4度放置。

      Tips:混勻時(shí)盡量避免產(chǎn)生氣泡,氣泡可能會(huì)影響酶的活性或?qū)嶒?yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性。

     

    02

    模板稀釋(若需要)

    以下是針對(duì)不同模板,PCR反應(yīng)時(shí)推薦的使用量:

    用無菌超純水稀釋DNA或者線性化載體至目標(biāo)濃度。

    Tips:模板DNA在儲(chǔ)存的過程中會(huì)有一定程度的降解,儲(chǔ)存前測試的濃度不一定準(zhǔn)確,為了保證實(shí)驗(yàn)精度,在放置一段時(shí)間后,需重新測試DNA模板濃度。

     

    03

    不同模板擴(kuò)增1 kb目的片段比對(duì)測試

    • 以大腸桿菌菌落、農(nóng)桿菌菌落為模板:盡量使用新鮮長滿的平板,大腸桿菌、農(nóng)桿菌平板4度存放不得超過45天。

    • 以大腸桿菌菌液為模板:使用新鮮搖菌的大腸桿菌菌液。挑取單菌落至1 mL液體培養(yǎng)基中,37℃搖床180 rpm培養(yǎng)3-4 h,至菌液渾濁但偏澄清的狀態(tài),使用分光光度計(jì)測試OD600下的菌液濃度,OD600=0.5-0.6最佳。

      Tips:OD600不宜超過1.2,菌液太濃會(huì)抑制擴(kuò)增。

    • 以小鼠、玉米、水稻基因組DNA為模板:根據(jù)10167ES說明書中基因組添加量進(jìn)行樣本稀釋,本實(shí)驗(yàn)預(yù)計(jì)添加的樣本量為100 ng,將基因組DNA均稀釋為50 ng/μL。

    • 加樣順序:RNase-free H2O>引物>模板>PCR Mix。

      引物作為反復(fù)凍融使用的材料,在使用過程中易造成污染,導(dǎo)致非特異擴(kuò)增。所以建議引物作為ddH2O之后優(yōu)先添加的材料,防止因槍頭未更換等因素污染引物。

    • 菌落挑取方法:在環(huán)境中用10 μL槍頭蘸取菌落后,槍頭插入溶液中,移液器按鈕從第一檔按至第二檔打出,反復(fù)吹打三次,確保菌落加入反應(yīng)體系。(在透明的水中含有些微白色物質(zhì),即可確認(rèn)菌落已加至反應(yīng)體系中。)

    • 菌液加樣方法:加樣前需上下顛倒混勻,用200 μL槍頭吹打混勻。

    • PCR反應(yīng)體系:

     

     

    試劑混勻

     
    • 配制完成后,用桌面離心機(jī)瞬離所有試劑到管底,然后渦旋10 sec振蕩混勻,若期間有氣泡,要將氣泡輕輕指彈震裂,離心10 sec后立即上機(jī)。

    • 若暫時(shí)不能上機(jī),可于-20℃暫存1 h。

     

     

    各擴(kuò)增酶Mix PCR反應(yīng)程序

     

    <上下滑動(dòng)查看更多>

     

    10167ES反應(yīng)程序

     
     

     

     

    P*反應(yīng)程序

     
     

     

     

    N*反應(yīng)程序

     
     

     

     

    V*反應(yīng)程序

     
     

     

     

    T*反應(yīng)程序

     
     

     

    *推薦退火溫度:60°C,也可根據(jù)自身需要設(shè)立溫度梯度摸索引物退火的最適溫度。推薦退火時(shí)間設(shè)置為20 sec,可以在10-30 sec內(nèi)調(diào)節(jié)。但需注意退火時(shí)間過長可能導(dǎo)致擴(kuò)增產(chǎn)物在膠上呈彌散狀。

    **延伸速度設(shè)置可參考下表:本次擴(kuò)增目的片段均為1 kb左右,因此設(shè)置為1 sec/kb。

    如需提高產(chǎn)量可適當(dāng)延長延伸時(shí)間,不宜超過30 sec/kb。

    ***循環(huán)數(shù)可設(shè)置為30-35個(gè)循環(huán)。無需再增加循環(huán)數(shù)。因?yàn)檫^多的循環(huán)雖然能增加產(chǎn)物量,但會(huì)導(dǎo)致非特異性產(chǎn)物擴(kuò)增和假陽性的風(fēng)險(xiǎn)。

    Tips:隨著副產(chǎn)物的積累以及試劑的消耗,即使再增加循環(huán)數(shù),PCR產(chǎn)物量也不會(huì)再有明顯增加,出現(xiàn)擴(kuò)增無法持續(xù)的停滯現(xiàn)象。10167ES試劑可以抑制【擴(kuò)增無法持續(xù)的停滯現(xiàn)象】,無需再增加循環(huán)數(shù),即可獲得高得率的PCR產(chǎn)物。

     

     

    凝膠電泳

     

    配制1%瓊脂糖凝膠插小孔梳,PCR完成后,吸取6 μL反應(yīng)液上樣(翌圣PCR試劑已含有紅色示蹤染料,無需添加loading buffer,可直接上樣)。Marker使用GoldBand DL10,000 DNA Marker(10505ES),上樣4 μL。150 V電泳30 min,觀察電泳條帶。

    Tips:移液槍斜角45°懸空插入膠孔中,緩慢加樣,確保玫紅色的PCR產(chǎn)物沉入膠孔中。避免戳破膠孔底部,導(dǎo)致樣品滲漏??奢p微晃動(dòng)電泳槽觀察凝膠是否漏液。

     

     

    電泳結(jié)果

     

    注:1:大腸桿菌菌落;2:大腸桿菌菌液;3:小鼠基因組DNA;4:玉米基因組DNA;5:水稻基因組DNA;6:農(nóng)桿菌菌落。

     

    結(jié)果顯示,翌圣快速PCR試劑(10167ES)性能優(yōu)于市面上其他競品,擴(kuò)增速度快,檢出率高,擴(kuò)增產(chǎn)量高。

     

    04

    以酵母菌為模板擴(kuò)增3 kb目的片段比對(duì)測試

     

    樣本前處理

     
    • 用10 μL槍頭挑取酵母菌平板上的單菌落,在裝有50 μL無菌水的1.5 mL離心管中吹打三次,放入微波爐高火加熱5 min,立刻用鑷子夾取至-80℃冰箱冷卻,即獲得酵母菌前處理液。

    • 酵母菌前處理液可以放在4度保存7天。

    • 酵母菌平板在4度存放不得超過45天。

     

     

    PCR加樣

     
    • 加樣順序:RNase-free H2O>引物>酵母菌前處理液>PCR Mix。

    • 菌液加樣方法:盡量使用新鮮處理的酵母前處理液,加樣前需解凍,震蕩10 sec混勻。

    • PCR反應(yīng)體系:

     

     

    試劑混勻

     
    • 配制完成后,用桌面離心機(jī)瞬離所有試劑到管底,然后渦旋10 sec振蕩混勻,若期間有氣泡,要將氣泡輕輕指彈震裂,離心10 sec后立即上機(jī)。

    • 若暫時(shí)不能上機(jī),可于-20℃暫存1 h。

     

     

    PCR反應(yīng)程序

     
    • (同3.“各擴(kuò)增酶Mix PCR反應(yīng)程序"),本次擴(kuò)增目的片段為3 kb左右復(fù)雜模板,因此翌圣快速PCR(Cat#10167ES)延伸速度設(shè)置為1 sec/kb。

     

     

    凝膠電泳

     
    • 配制1%瓊脂糖凝膠插小孔梳,PCR完成后,吸取6 μL反應(yīng)液上樣。Marker使用GoldBand DL10,000 DNA Marker(10505ES),上樣4 μL。150 V電泳30 min,觀察電泳條帶。

     

     

    電泳結(jié)果

     

    結(jié)果顯示,翌圣快速PCR試劑(10167ES)酵母擴(kuò)增性能優(yōu)于市面上其他競品,擴(kuò)增速度快,檢出率高,擴(kuò)增產(chǎn)量高。

     

     

    產(chǎn)品推薦:

     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     

    產(chǎn)品定位

    名稱

    貨號(hào)

    規(guī)格

    快速PCR升級(jí),可菌P且適用復(fù)雜模板擴(kuò)增

    2×Hieff® Ultra-Rapid II HotStart PCR Master Mix

    10167ES03/08

    1 mL/5×1 mL

    1-7片段一步法定向連接,最快5分鐘完成重組反應(yīng)

    Hieff Clone® Universal II One Step Cloning Kit

    10923ES20/50

    20 T/50 T

    TOPO克隆-兼容TA/平末端

    Hieff Clone® Universal Zero TOPO TA/Blunt Cloning Kit

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