百歐博偉生物:病原微生物如細菌、病毒、真菌等廣泛存在于土壤環(huán)境中,其嚴重威脅著公共衛(wèi)生安全。發(fā)展病原微生物快速檢測技術,對于減少病原菌擴散傳播、防控傳染性疾病、維護生物安全具有重要意義。
本文對病原微生物檢測技術的研究進展進行了綜述,包括顯色培養(yǎng)技術、基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜、分子生物學技術、拉曼光譜技術、流式細胞技術和生物傳感器等,并對其原理、應用及優(yōu)缺點進行了全面比較。最后,對病原微生物檢測技術的未來發(fā)展提出展望,旨在促進土壤環(huán)境病原微生物的快速檢測和生物風險防控。
總結與展望:
近年來,病原微生物感染引起的水傳、呼吸道、食源性傳染病等問題越來越嚴重,對環(huán)境包括土壤中的病原微生物進行快速檢測和識別,是有效控制各類傳染性疾病發(fā)生的關鍵性環(huán)節(jié)。環(huán)境中病原微生物的檢測技術,逐漸從傳統(tǒng)的培養(yǎng)方法,發(fā)展為現(xiàn)在的分子生物學技術、拉曼光譜技術、生物傳感器等快速檢測技術,從而可有效應對生物安全形勢面臨的各項挑戰(zhàn)。
對于未來發(fā)展,提出幾點展望:
1、發(fā)展土壤病原微生物快速檢測技術。
本文綜述的相關技術雖已部分實現(xiàn)臨床和環(huán)境病原微生物的快速檢測,但是仍存在諸多局限性,其研究主要聚焦人類致病菌,對土壤復雜環(huán)境以及土壤-植物體系的病原微生物的研究仍較少。未來病原微生物檢測技術需在保證精準性的前提下,向快速、靈敏、便攜的方向發(fā)展。
例如:擴寬分子生物學技術檢測范圍,實現(xiàn)多種土壤病原微生物的高通量分析,簡化預處理階段,降低成本;對于拉曼光譜技術,應建立土壤病原微生物的標準譜圖數(shù)據(jù)庫,并加強共享;對于流式細胞技術,研發(fā)針對土壤病原微生物的特異熒光探針,結合土壤微生物預處理技術,將檢測領域擴展到水體以外的土壤環(huán)境。
2、實現(xiàn)環(huán)境樣品采集、處理、檢測、分析一體化。
環(huán)境介質(zhì)中病原微生物濃度一般較低,不適合儀器設備直接進行檢測,大多需要預富集再進行后續(xù)步驟,樣品制備繁瑣、耗時,目前很少有樣品預富集-處理檢測一體化設備。實現(xiàn)采樣儀器與檢測設備的系統(tǒng)集成,對縮短環(huán)境中病原微生物的檢測時間,提升檢測效率,減少在傳統(tǒng)采樣過程中對病毒等氣載病原菌的損傷作用等,具有重要的意義。
3、多種技術相結合,充分發(fā)掘各技術的優(yōu)勢,補齊短板。
例如,未來拉曼光譜技術可結合微流控、人工智能、環(huán)境微生物大拉曼數(shù)據(jù)譜庫,并構建小型便攜的自動檢測系統(tǒng),實現(xiàn)真實環(huán)境中(空氣、水體、土壤、臨床)病原微生物的快速、準確、原位檢測。
4、在技術發(fā)展的基礎上,推動土壤等環(huán)境病原微生物的數(shù)據(jù)庫、風險評估和防控體系建立,具體包括:
①建立土壤等環(huán)境病原微生物大數(shù)據(jù)庫。加快推進我國環(huán)境病原菌識別網(wǎng)的建成,統(tǒng)籌各地疾控、醫(yī)院、科研單位等不同機構獲得的環(huán)境病原微生物相關信息,共享病原菌識別、基因組溯源、分子分型、抗生素耐藥性相關信息,以期實現(xiàn)環(huán)境中細菌性傳染病的快速溯源、監(jiān)測與防控;
②增設環(huán)境病原微生物的耐藥性檢測項目。在“One Health”框架下,推進環(huán)境病原微生物病原識別與抗生素耐藥性相關工作;
③加快建設適合我國國情的環(huán)境微生物定量風險評估系統(tǒng)。針對我國主要出現(xiàn)的優(yōu)勢菌株、相關疾病以及抗生素暴露情況,以問題為導向,構建基礎的環(huán)境微生物污染和劑量-反應關系等數(shù)據(jù)庫,建立適合我國人群特征、生活方式、優(yōu)勢菌株類型的環(huán)境微生物風險評估模型,以期實現(xiàn)對人體暴露于環(huán)境病原微生物以及抗生素耐藥菌的潛在風險評估,及時采取措施進行防控。
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