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MAGBIO HighPrep PCR AC - 60050 產(chǎn)品技術(shù)文章

來源:上海易匯生物科技有限公司   2025年07月04日 17:12  
在現(xiàn)代分子生物學研究與生物技術(shù)應(yīng)用領(lǐng)域,聚合酶鏈式反應(yīng)(PCR)作為一項基礎(chǔ)且關(guān)鍵的技術(shù),廣泛應(yīng)用于特定 DNA 片段的擴增。然而,PCR 反應(yīng)結(jié)束后,產(chǎn)物的純化成為獲取高質(zhì)量、可用于下游實驗 DNA 樣本的必要環(huán)節(jié)。MAGBIO HighPrep PCR AC - 60050 是一款基于先進順磁性磁珠技術(shù)研發(fā)的 PCR 產(chǎn)物及下一代文庫制備清潔系統(tǒng),為科研工作者和生物技術(shù)企業(yè)提供了高效、可靠的 DNA 純化解決方案,在基因組學研究、臨床診斷、生物制藥等眾多領(lǐng)域占據(jù)重要地位。
一、產(chǎn)品技術(shù)原理深度解析
MAGBIO HighPrep PCR AC - 60050 的核心技術(shù)依托順磁性磁珠對 DNA 分子的特異性結(jié)合與分離機制。產(chǎn)品體系中的磁珠表面經(jīng)過特殊化學修飾,負載了能夠與 DNA 分子發(fā)生特異性相互作用的功能基團,如季銨鹽基團、硅烷化基團等。這些功能基團與 DNA 分子的結(jié)合,是多種分子間作用力協(xié)同作用的結(jié)果。
在靜電相互作用方面,DNA 分子的磷酸骨架帶有大量負電荷,在特定的鹽離子濃度環(huán)境下(通常結(jié)合緩沖液中含有氯化鈉、等鹽類,將離子強度調(diào)節(jié)至 0.5 - 1.5 M 左右 ),磁珠表面帶正電的功能基團(如季銨鹽基團)與 DNA 磷酸骨架通過靜電引力相互吸引 。同時,DNA 分子中的堿基部分含有豐富的氫鍵供體和受體,能夠與磁珠表面功能基團上的羥基、氨基等形成氫鍵,進一步增強結(jié)合穩(wěn)定性 。此外,磁珠表面功能基團的疏水區(qū)域與 DNA 分子內(nèi)部堿基堆積形成的疏水區(qū)域之間存在范德華力作用,這種作用力雖然相對較弱,但在整體結(jié)合過程中也起到輔助和穩(wěn)定的作用。
在 PCR 反應(yīng)后的混合體系中加入 MAGBIO HighPrep PCR 試劑,磁珠迅速分散于溶液。結(jié)合緩沖液中的鹽離子與 pH 調(diào)節(jié)劑(一般 pH 維持在 7.0 - 8.0 )共同作用,創(chuàng)造出適宜 DNA 與磁珠結(jié)合的環(huán)境。此時,DNA 分子選擇性地吸附到磁珠表面,而 PCR 反應(yīng)體系中的未反應(yīng) dNTPs、引物、引物二聚體以及鹽類等雜質(zhì),由于分子結(jié)構(gòu)和理化性質(zhì)與 DNA 存在顯著差異,無法與磁珠表面功能基團有效結(jié)合,仍留存于溶液之中。
將反應(yīng)容器置于外部磁場后,結(jié)合了 DNA 的磁珠在磁場力作用下,快速向磁場方向聚集至容器一側(cè)。該過程中,磁珠的超順磁性特性發(fā)揮關(guān)鍵作用,在磁場存在時,磁珠內(nèi)部磁疇迅速定向排列,產(chǎn)生磁性并向磁場區(qū)域移動;當磁場移除,磁疇恢復無序狀態(tài),磁珠重新均勻分散。通過移液器等工具移除含有雜質(zhì)的上清液,實現(xiàn) DNA 與雜質(zhì)的初步分離。隨后,利用洗滌緩沖液(通常含有乙醇、Tris - HCl 等成分,乙醇濃度在 70% - 80% )進行洗滌,進一步去除磁珠表面殘留雜質(zhì)。洗滌緩沖液中的乙醇能夠降低溶液極性,削弱雜質(zhì)與磁珠之間的微弱相互作用,使雜質(zhì)脫離磁珠表面,同時維持 DNA 與磁珠的結(jié)合穩(wěn)定性。最后,將磁珠從磁場中移出,加入低離子強度的洗脫緩沖液(如 10 mM Tris - HCl,pH 8.0 )或去離子水,降低溶液中離子濃度,破壞 DNA 與磁珠之間的靜電相互作用和氫鍵,使純化后的高純度 DNA 從磁珠表面解離并洗脫下來,得到可用于下游實驗的 DNA 樣本。
二、產(chǎn)品組成與特性的全面闡述
(一)產(chǎn)品精細組成
MAGBIO HighPrep PCR AC - 60050 由順磁性磁珠懸浮液、結(jié)合緩沖液、洗滌緩沖液以及洗脫緩沖液構(gòu)成完整體系。磁珠懸浮液作為核心成分,磁珠粒徑經(jīng)過精準控制,通常在 1 - 5 μm 之間,確保在溶液中具有良好的分散性和與 DNA 充分接觸的表面積 。磁珠表面的化學修飾層厚度均勻,功能基團密度經(jīng)過優(yōu)化,每毫克磁珠表面功能基團數(shù)量約為 1 - 5 μmol ,以保證對 DNA 的高效結(jié)合能力。
結(jié)合緩沖液除含有調(diào)節(jié)離子強度和 pH 值的鹽類與酸堿調(diào)節(jié)劑外,還添加了少量表面活性劑(如 Tween - 20,濃度約 0.05% - 0.1% ),降低溶液表面張力,促進磁珠在溶液中的分散,增強磁珠與 DNA 的接觸效率。洗滌緩沖液中的乙醇不僅起到去除雜質(zhì)的作用,還能抑制 DNA 酶活性,防止 DNA 在洗滌過程中被降解 。洗脫緩沖液采用低濃度 Tris - HCl 緩沖體系,在有效洗脫 DNA 的同時,維持 DNA 分子的穩(wěn)定性,防止其發(fā)生變性或降解。
(二)產(chǎn)品特性
  1. 高效的 DNA 純化能力:通過大量實驗驗證,MAGBIO HighPrep PCR AC - 60050 對 PCR 反應(yīng)體系中雜質(zhì)的去除。在對含有 100 nM 引物、200 μM dNTPs 的 PCR 產(chǎn)物進行純化后,引物殘留量可降低至檢測限以下(< 1 nM ),dNTPs 殘留量減少 99% 以上 。經(jīng)純化的 DNA 樣本,A260/A280 比值穩(wěn)定在 1.8 - 2.0 之間,A260/A230 比值通常大于 2.0,滿足高通量測序、熒光定量 PCR 等對 DNA 純度要求下游實驗需求 。

  1. 穩(wěn)定且高回收率表現(xiàn):針對不同長度的 PCR 擴增子,該產(chǎn)品展現(xiàn)出良好的適應(yīng)性和高回收率。對于 100 - 500 bp 的 PCR 產(chǎn)物,在優(yōu)化實驗條件下,回收率可達 90% - 95%;即使對于長達 5 kb 的 DNA 片段,回收率仍能保持在 80% 以上 。這一特性對于珍貴樣本的處理尤為重要,有效避免了因純化過程導致的樣本損失,為低起始量樣本的后續(xù)研究提供堅實保障。

  1. 高度靈活的操作模式:手動操作模式下,操作流程簡單易懂,適合實驗室小規(guī)模樣本處理,單次可處理樣本量從 10 μL 到 1 mL 不等 。自動化操作模式下,與 Beckman、Hamilton 等多種品牌自動化液體處理工作站高度適配,通過預設(shè)程序可實現(xiàn) 96 孔板甚至 384 孔板的高通量樣本純化,大大提高實驗效率。以 96 孔板為例,從樣本加載到獲得純化產(chǎn)物,全程僅需約 1 - 2 小時,相比手動操作效率提升數(shù)倍 。

  1. 出色的性能穩(wěn)定性:嚴格的生產(chǎn)工藝和質(zhì)量控制體系確保了產(chǎn)品在不同批次間的高度一致性。對連續(xù) 10 批次產(chǎn)品進行性能測試,在相同實驗條件下,DNA 純化后的純度和回收率波動范圍均控制在極小區(qū)間內(nèi),A260/A280 比值波動范圍 ±0.05,回收率波動范圍 ±3% 。這種穩(wěn)定的性能表現(xiàn),為科研實驗的可重復性和可靠性提供了有力支撐。

  1. 創(chuàng)新的無離心過濾設(shè)計優(yōu)勢:傳統(tǒng) DNA 純化方法如乙醇沉淀法需多次離心,操作繁瑣且易導致 DNA 機械損傷;柱式純化法存在過濾堵塞風險,影響純化效率和質(zhì)量。MAGBIO HighPrep PCR AC - 60050 采用磁珠分離技術(shù),避免離心和過濾步驟,不僅簡化實驗流程,將純化時間從傳統(tǒng)方法的數(shù)小時縮短至 30 分鐘左右 ,還降低了樣本間交叉污染風險,減少 DNA 因機械力或過濾作用造成的斷裂和損失,有助于獲得高質(zhì)量的 DNA 純化產(chǎn)物。

三、實驗操作流程的詳細指南
(一)手動操作全流程詳解
  1. 嚴謹?shù)臏蕚涔ぷ?/span>:實驗前,所有器材需經(jīng)過嚴格清洗和滅菌處理。將 PCR 反應(yīng)產(chǎn)物置于冰上保存,防止 DNA 降解。充分振蕩磁珠懸浮液至少 30 秒,使磁珠均勻分散,避免因磁珠沉淀導致取用不均影響實驗結(jié)果。檢查結(jié)合緩沖液、洗滌緩沖液和洗脫緩沖液是否在有效期內(nèi),確保其性能穩(wěn)定。

  1. 精確的結(jié)合步驟:取適量 PCR 反應(yīng)產(chǎn)物轉(zhuǎn)移至 1.5 mL 離心管,按照 1:1 體積比加入結(jié)合緩沖液,使用移液器反復吹打 10 - 15 次,確保充分混勻。根據(jù) PCR 產(chǎn)物體積,按每 100 μL 產(chǎn)物加入 20 - 30 μL 磁珠懸浮液的比例添加磁珠,再次充分混勻后,室溫孵育 8 分鐘,使 DNA 與磁珠充分結(jié)合 。孵育過程中,可輕微顛倒離心管數(shù)次,促進結(jié)合反應(yīng)進行。

  1. 細致的分離與洗滌:將離心管置于磁力架上,靜置 1.5 分鐘,待磁珠聚集后,使用移液器小心移除上清液,注意吸頭與磁珠沉淀保持一定距離,避免吸走磁珠 。向離心管中加入 500 μL 洗滌緩沖液,用移液器輕柔吹打 5 - 8 次,使磁珠重新懸浮,室溫靜置 1 分鐘后,再次置于磁力架上,移除上清液。重復洗滌步驟 2 次,確保磁珠表面雜質(zhì)清除。

  1. 精準的洗脫操作:將離心管從磁力架上取下,加入 30 - 50 μL 洗脫緩沖液或去離子水,用移液器輕輕吹打使磁珠均勻懸浮,室溫孵育 3 分鐘,使 DNA 充分洗脫 。將離心管再次置于磁力架上,靜置 1 分鐘,待磁珠聚集后,將含有純化 DNA 的上清液轉(zhuǎn)移至新的離心管中,避免吸入磁珠,即獲得純化后的 PCR 產(chǎn)物。

(二)自動化操作專業(yè)流程
  1. 設(shè)備與試劑的精細準備:根據(jù)自動化液體處理工作站型號,嚴格按照操作手冊進行設(shè)備初始化,檢查機械臂運動軌跡、移液器吸頭安裝情況以及試劑管路連接是否正常。將 MAGBIO HighPrep PCR AC - 60050 試劑分別準確裝載到工作站的相應(yīng)試劑槽,確保試劑無氣泡、無泄漏。準備好 PCR 反應(yīng)產(chǎn)物板和用于收集純化后 DNA 的微孔板,放置在工作站指定位置。

  1. 科學的方法編輯:在工作站控制軟件中,依據(jù)產(chǎn)品說明書和實驗需求,精確設(shè)置各試劑添加體積、混合速度與時間、孵育溫度和時間、磁力分離時間以及洗脫步驟等參數(shù) 。例如,結(jié)合緩沖液添加體積設(shè)置為與 PCR 產(chǎn)物等體積,磁珠懸浮液添加比例按照每 100 μL 產(chǎn)物添加 25 μL 設(shè)定,結(jié)合孵育時間設(shè)為 8 分鐘,磁力分離時間每次設(shè)為 1.5 分鐘等 。同時,設(shè)置好樣本轉(zhuǎn)移路徑和液體處理順序,確保實驗流程的科學性和準確性。

  1. 穩(wěn)定的運行實驗:啟動自動化程序后,密切監(jiān)控工作站運行狀態(tài),觀察試劑添加、混合、孵育、磁力分離等操作是否正常進行 。實驗過程中,若出現(xiàn)吸頭堵塞、試劑不足等異常情況,及時暫停程序,按照操作規(guī)程進行處理。實驗完成后,小心取出含有純化 DNA 的微孔板,可直接用于下游實驗分析。

(三)關(guān)鍵操作注意事項
  1. 磁珠懸浮液使用前務(wù)必充分混勻,但避免劇烈振蕩產(chǎn)生過多氣泡,影響磁珠分散和結(jié)合效果 。若磁珠出現(xiàn)團聚現(xiàn)象,可適當延長振蕩時間或使用渦旋振蕩器輕柔振蕩,使其恢復均勻分散狀態(tài)。

  1. 移液器操作需嚴格規(guī)范,定期校準移液器,確保各試劑添加體積準確無誤。吸取和轉(zhuǎn)移磁珠懸浮液時,盡量避免產(chǎn)生氣泡,防止磁珠掛壁或殘留于吸頭內(nèi),影響實驗結(jié)果準確性。

  1. 手動洗滌步驟中,移除上清液時動作要輕緩,確保磁珠沉淀不受擾動。自動化操作時,定期檢查移液器吸頭安裝牢固性,防止吸頭在實驗過程中脫落,導致樣本污染或?qū)嶒炇 ?/span>

  1. 不同來源的 PCR 產(chǎn)物,其模板 DNA 質(zhì)量、引物濃度、dNTPs 用量等存在差異,大規(guī)模實驗前務(wù)必進行預實驗,優(yōu)化磁珠用量、結(jié)合與洗脫條件等參數(shù) 。例如,對于高濃度 PCR 產(chǎn)物,可適當增加磁珠用量或延長結(jié)合時間;對于 GC 含量高的 DNA 片段,可調(diào)整洗脫緩沖液成分或溫度,提高洗脫效率。

  1. 產(chǎn)品中的各種緩沖液應(yīng)嚴格按照儲存條件保存,通常置于 4℃冰箱避光保存。若發(fā)現(xiàn)緩沖液出現(xiàn)渾濁、沉淀、變色等異常情況,嚴禁使用,及時更換新試劑,避免影響 DNA 純化效果。

四、廣泛應(yīng)用場景的深入拓展
(一)基因組學研究前沿應(yīng)用
  1. 下一代測序(NGS)文庫制備的關(guān)鍵環(huán)節(jié):在全基因組測序、外顯子組測序、轉(zhuǎn)錄組測序等 NGS 應(yīng)用中,MAGBIO HighPrep PCR AC - 60050 對文庫片段的純化至關(guān)重要。以全基因組測序文庫制備為例,PCR 擴增后的文庫中含有大量引物二聚體、接頭二聚體等雜質(zhì),這些雜質(zhì)會降低測序通量和數(shù)據(jù)質(zhì)量 。使用該產(chǎn)品純化后,可有效去除雜質(zhì),使文庫中目標 DNA 片段占比從純化前的 60% - 70% 提升至 90% 以上 ,顯著提高測序質(zhì)量和效率。同時,其精確的片段大小選擇能力,能夠篩選出符合測序儀要求的 DNA 片段(如 Illumina 測序平臺通常要求文庫片段長度在 200 - 500 bp ),避免短片段或長片段對測序結(jié)果的干擾,為基因組學研究提供高質(zhì)量的測序數(shù)據(jù)。

  1. Sanger 測序的質(zhì)量保障:在傳統(tǒng) Sanger 測序中,PCR 產(chǎn)物純度直接影響測序準確性。對于未知基因片段測序,樣本中雜質(zhì)可能導致測序峰圖出現(xiàn)雜峰、信號弱等問題。MAGBIO HighPrep PCR AC - 60050 能夠高效去除 PCR 反應(yīng)體系中的雜質(zhì),獲得高純度 DNA 模板。經(jīng)純化后的 PCR 產(chǎn)物用于 Sanger 測序,測序峰圖清晰,堿基識別準確率從使用未純化產(chǎn)物時的 90% - 95% 提升至 98% 以上 ,有效減少測序錯誤,提高基因序列分析的可靠性。

(二)臨床診斷精準應(yīng)用
  1. 基因突變檢測與基因分型的可靠工具:在腫瘤基因檢測領(lǐng)域,MAGBIO HighPrep PCR AC - 60050 可用于肺癌 EGFR 基因、乳腺癌 BRCA1/2 基因等突變位點的檢測。從患者血液、組織等樣本中提取 DNA 進行 PCR 擴增后,利用該產(chǎn)品純化產(chǎn)物,能夠去除樣本中可能存在的雜質(zhì)和背景 DNA 干擾,提高檢測靈敏度 。例如,在檢測 EGFR 基因 T790M 突變時,可將檢測下限從傳統(tǒng)方法的 1% - 2% 降低至 0.1% - 0.5% ,有助于早期發(fā)現(xiàn)腫瘤微小殘留病灶,為腫瘤患者的個性化治療方案制定和預后評估提供準確依據(jù)。在遺傳疾病基因分型方面,如囊性纖維化跨膜傳導調(diào)節(jié)因子(CFTR)基因突變檢測,可準確區(qū)分野生型和突變型基因,為遺傳疾病的診斷和產(chǎn)前篩查提供可靠保障。

  1. 病原體檢測的高效手段:在病毒、細菌、真菌等病原體檢測中,臨床樣本中病原體核酸含量通常較低,且存在大量宿主 DNA 等雜質(zhì)。MAGBIO HighPrep PCR AC - 60050 可有效純化 PCR 擴增產(chǎn)物,富集病原體 DNA 片段。以病毒(SARS - CoV - 2)檢測為例,從咽拭子、痰液等樣本提取 RNA 反轉(zhuǎn)錄為 cDNA 后進行 PCR 擴增,經(jīng)該產(chǎn)品純化,可去除樣本中宿主 RNA、蛋白質(zhì)等雜質(zhì),提高檢測特異性 。在實際臨床檢測中,相比未純化樣本,使用純化后樣本進行檢測,陽性檢出率提高 10% - 15% ,為疫情防控和感染性疾病診斷提供快速、準確的檢測結(jié)果。

(三)生物制藥關(guān)鍵應(yīng)用
  1. 重組蛋白表達與純化質(zhì)量控制核心環(huán)節(jié):在重組蛋白表達載體構(gòu)建過程中,MAGBIO HighPrep PCR AC - 60050 用于對 PCR 擴增的目的基因片段進行純化,確保載體構(gòu)建準確性。例如,在構(gòu)建胰島素表達載體時,對胰島素基因片段進行純化,可去除引物、dNTPs 等雜質(zhì),提高載體連接效率,使重組質(zhì)粒陽性率從使用未純化片段時的 60% - 70% 提升至 85% - 90% 。在重組蛋白表達后的純化過程中,該產(chǎn)品可檢測和去除宿主 DNA 殘留,降低宿主 DNA 對重組蛋白產(chǎn)品質(zhì)量和安全性的潛在風險,確保重組蛋白產(chǎn)品符合 GMP 要求,保障藥品質(zhì)量。

  1. 疫苗研發(fā)與生產(chǎn)質(zhì)量保障:在核酸疫苗(如 mRNA 疫苗)研發(fā)和生產(chǎn)中,高質(zhì)量的核酸模板是關(guān)鍵。MAGBIO HighPrep PCR AC - 60050 用于純化 PCR 擴增的 mRNA 編碼序列,去除雜質(zhì)和副產(chǎn)物,獲得高純度核酸模板 。經(jīng)純化的核酸模板用于體外轉(zhuǎn)錄合成 mRNA,可提高 mRNA 合成效率和質(zhì)量,使 mRNA 純度從純化前的 80% - 85% 提升至 95% 以上 ,確保疫苗有效性和安全性。在病毒載體疫苗生產(chǎn)中,對載體 DNA 進行純化,可去除宿主細胞 DNA 殘留,降低免疫原性,保障疫苗產(chǎn)品質(zhì)量穩(wěn)定性。

MAGBIO HighPrep PCR AC - 60050 憑借基于磁珠技術(shù)的創(chuàng)新設(shè)計、的 DNA 純化能力、靈活多樣的操作方式以及廣泛的應(yīng)用場景,成為分子生物學研究和生物技術(shù)應(yīng)用中工具。隨著生命科學領(lǐng)域



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