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利用超聲波DNA打斷儀進行NGS建庫有哪些優勢?

來源:方需科技(上海)有限公司   2023年06月05日 09:12  
超聲波DNA打斷儀,用于把DNA片段切斷建庫。建庫,即文庫制備,是指將樣本處理成可被測序儀讀取的DNA片段,該片段需滿足一定的長度,且在兩端都連接了指定的序列(錨定序列、測序引物序列、標簽序列等)。

超聲波DNA打斷儀通過壓電轉換器,將電信號轉變為高頻聲波信號,產生數百萬的水分子”空穴”,利用“空穴” 在幾微秒內變大、破裂產生的瞬時流體剪切力,通過等溫、非接觸的方式對樣品進行打斷、勻漿和混合。


超聲法優勢在于打斷的DNA片段更為集中且無偏好性,是目前NGS建庫中片段化的金標準。可在密閉容器、無菌、可超微量條件下進行破碎。相比傳統的探頭超聲波細胞粉碎機,該儀器具有一次可同時檢測多個樣品、實驗效率高、無需頻繁操作探頭、避免樣本交叉污染等優勢。儀器標配低溫恒溫裝置(雙循環恒溫裝置),便于樣品在4-10℃環境內工 作,使能量分布均勻,超聲作用。逐漸成為ChIP(染色質免疫共沉淀)和DNA剪切研究平臺必要的標準化工具。

 

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