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脂质体挤出器主要应用于药剂产品粒径均一化，去除产品中的颗粒和沉淀，减小脂质体及乳剂粒径以便于无菌过滤，分子生物动力学研究。广泛应用于脂质体、脂肪乳、微乳、分子生物学等领域，其他任何需要匀化颗粒的。
通过动力端产生一定的压力，挤压样品通过聚碳酸酯膜（PC滤膜）与不锈钢微孔滤板，挤出后的样品，其粒径分布均匀，可达到纳米级。样品的粒径大小与挤出压力及PC滤膜的孔径有关。手动式脂质体挤出器为实验室脂质体制备的理想器材,采用密封的玻璃注射器，利用手动推力，使物料强制通过基体内部的薄膜，从而得到均匀的脂质体纳米粒。
脂质体挤出对滤膜的要求比较高，需要膜孔分布均匀、孔径基本保持一致，且孔径垂直更有利于纳米级脂质体的挤出制备。核打孔的聚碳酸酯膜可以满足上述要求。需要注意的是一般用于除菌的微孔滤膜膜孔分布和大小是很不均匀的，孔道是弯弯曲曲的，使用时注意区分。在选择挤出滤膜的孔径时，需先测定挤出前脂质体样品的粒径，并与最终所需达到的目标粒径相结合进行考虑，然后选择合适的滤膜孔径。比如原始样品粒径是400nm，目标粒径是100nm，可以先尝试用200nm挤出。如果挤出困难，换成400nm挤出，之后再依次用200nm，100nm，80nm挤出。
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