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液质联用仪的灵敏度高，通量性能好，优异的高流量性能、降低的离子抑制效应、自清洁离子源探针设计和可靠的接口设计，加速了分析速度；使用更简便。凭借多种优势，液质联用仪在许多领域都有广泛的应用。
1、液质联用技术在食品安全分析领域也起着重要的作用。液质联用技术不仅能够定性定量检测禽畜肉和农作物等食品中的药物残留，提供检测物质的结构信息而且精密度高、重现性好，能够排除假阳性检测结果。
2、液质联用技术在药物分析研究领域也有着重要的意义。
液质联用仪除了以上的用途，也可以用于药物发现、蛋白质组学、环境和食品安全、临床研究和法医毒理学等领域。
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