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二手安捷伦气质联用仪进行清洗前要先准备好相关的工具及试剂，然后打开仪器，小心地拔开与离子源连接的电缆，拧松螺丝，取下离子源。取预杆之前先取下主四极杆,竖放在无尘纸上,再取下预杆待洗。注意整个操作过程一要小心谨慎，二要避免灰尘进入腔体。将离子源各组件分离，在离子源的所有组件中，灯丝、线路板和黑色陶瓷圈是不能清洗的。
该仪器主要有以下几种清洗方式：
方式一：
1、一般都是先用清水冲洗烘干后再用硫酸重铬酸钾洗液浸泡。
2、色谱样品瓶的洗法和做液相等其他是一样的，先使用酒精侵泡4个小时以上，然后超声半个小时，然后倒出酒精，使用水超声半个小时，用水冲洗后烘干就可以了。
方式二：
1、自来水冲洗几遍。
2、放入倒有纯水的烧杯中，超声15分钟。
3、换水，再超声15分钟。
4、泡在倒有无水乙醇的烧杯中。
5、之后取出自然风干。
方式三：
1、先用甲醇（色谱纯）浸泡，并超声清洗20分钟，后将甲醇倒干。
2、再将色谱样品瓶内注满水，超声清洗20分钟，后将水倒干。
3、后将色谱样品瓶烘干。
方式四：
1、倒干色谱样品瓶内试液。
2、全浸入95%酒精，超声洗2次后倒干，因为酒精易进入1.5mL的小瓶，且能与大多数有机溶剂互溶以达到。
3、倒入清水，超声洗2次。
4、倒干瓶内洗液，于110摄氏度烘1~2小时，不能于高温下烘烤。
5、冷却，保存
方式五：
1、如果费用足，每次用新的比较好。
2、如果要重复使用，清洗二手安捷伦气质联用仪的方法也很重要，首先用强氧化清洗液（重铬酸钾）浸泡24小时，然后用去离子水在超声波条件下清洗三次，后用甲醇清洗一下，烘干可使用。
3、瓶垫一要换成新的，是分析农残留时，定要换，否则会影响定量结果。
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