无菌均质器叫拍打式均质器，或无菌均质机，工作原理即将原始样本，与某种液体或溶剂放入均质袋，经本仪器的锤击板反复在样品均质袋上锤击，产生压力、引起振荡、加速混合、从而达到溶液中微生物成分处于均匀分布状态，主要用于从固体样品中提取细菌的过程，只需将样品和稀释液加入到无菌的样品袋中，然后将样品袋放入拍击式均质器中即可完成样品的处理，有效地分离被包含在固体样品内部和表面的微生物均一样品，确保无菌袋中混合全部的样品。处理后的样品溶液可以直接进行取样和分析，没有样品的变化和交叉污染的危险。

无菌均质器适用于脑、肾、肝、脾等动物组织及微生物的均质处理、化妆品的均质处理，特别适合于微生物检测样本的制备，样品无污染、无损伤、不升温、不需要灭菌处理，不需洗刷器皿的特点。无菌均质器在均质过程中，解脂酶活化，脂肪球表面积增加，会加快脂肪的解脂酸败，均质对蛋白质的影响表现在使酪蛋白胶粒变小，乳浆中一些蛋白质移到脂肪球上，补充增大了脂肪球表面积。由于均质前预热、高压等原因，使一些蛋白质变性，会降低蛋白质的稳定性。均质处理乳，凝乳酶作用形成凝乳质地较软，保水能力较大，脂肪球和酶蛋白胶粒变小，表面积增大，有利于消化酶作用。消化率、吸收率、蛋白质利用率都会增加，已广泛应用于食品、药品、临床、分子学、毒素及细菌检测等领域。