實時熒光探針PCR技術(shù)，又稱為qPCR，是一種結(jié)合了PCR擴增和熒光檢測的分子生物學(xué)技術(shù)。它能夠在PCR反應(yīng)進(jìn)行的同時，實時監(jiān)測特定DNA序列的擴增情況。該技術(shù)主要依賴于熒光標(biāo)記的探針，這些探針能夠特異性地結(jié)合到目標(biāo)DNA序列上。
在PCR循環(huán)中，隨著目標(biāo)DNA的指數(shù)級擴增，熒光信號也相應(yīng)增強。熒光信號的強度與擴增產(chǎn)物的量成正比，因此可以通過熒光信號的變化來實時監(jiān)測PCR反應(yīng)的進(jìn)程。實時熒光探針PCR技術(shù)通常使用兩種類型的熒光探針：TaqMan探針和SYBR Green。
SYBR Green是一種DNA染料，它能夠非特異性地結(jié)合到雙鏈DNA上，具有使用簡便，價格便宜等優(yōu)點而被廣泛使用。但其最大的缺點是缺乏特異性，即染料可以與任何dsDNA結(jié)合。因此，qPCR反應(yīng)中有非特異性擴增產(chǎn)物的出現(xiàn)會增加熒光值，影響定量結(jié)果的準(zhǔn)確性，而TaqMan探針法的出現(xiàn)很好地解決了染料法非特異性的問題，這也讓TaqMan探針法在檢測領(lǐng)域大放異彩！接下來，就讓我們了解一下TaqMan探針法qPCR在支原體檢測方面的應(yīng)用。
TaqMan探針是一種寡核苷酸探針，它含有一個熒光報告基團(tuán)和一個淬滅基團(tuán)。當(dāng)探針完整時，報告基團(tuán)發(fā)出的熒光被淬滅基團(tuán)吸收。在PCR擴增過程中，TaqMan探針與目標(biāo)DNA序列結(jié)合，Taq DNA聚合酶的5'到3'外切酶活性會切割探針，導(dǎo)致報告基團(tuán)和淬滅基團(tuán)分離，從而發(fā)出熒光信號。切割的熒光分子數(shù)與PCR產(chǎn)物的數(shù)量成正比，因此，通過檢測PCR反應(yīng)體系中的熒光強度可以達(dá)到檢測PCR產(chǎn)物擴增量的目的。
檢測機制與定量分析?
根據(jù)檢測方式不同，PCR試劑盒分為?常規(guī)PCR?和?實時熒光定量PCR?兩類：
常規(guī)PCR檢測
擴增后通過瓊脂糖凝膠電泳分析產(chǎn)物大小，定性判斷目標(biāo)片段是否存在。
實時熒光定量PCR（qPCR）
熒光標(biāo)記?：加入熒光探針（如TaqMan探針）或DNA結(jié)合染料（如SYBR Green）；
信號監(jiān)測?：每輪擴增后實時檢測熒光強度，通過?t值（熒光達(dá)到閾值所需循環(huán)數(shù)）定量起始模板量；
標(biāo)準(zhǔn)曲線法?：利用已知濃度的標(biāo)準(zhǔn)品建立Ct值與模板濃度的線性關(guān)系，計算樣品濃度
探針法qPCR在支原體檢測中的應(yīng)用
引物設(shè)計
針對支原體16S rRNA序列，下載后進(jìn)行序列比對，篩選支原體特異性的區(qū)段，尋找兩端特異中間保守的區(qū)段，設(shè)計引物。一般選擇多對正反向引物，和多條相對應(yīng)的探針引物。
內(nèi)參設(shè)計
同時為了保證實驗的有效性和穩(wěn)定性，往往還會設(shè)計一對內(nèi)參引物和內(nèi)參熒光探針，用于監(jiān)控每次反應(yīng)過程的穩(wěn)定性。
反應(yīng)模板
檢測時需取培養(yǎng)至少2~3天的細(xì)胞培養(yǎng)物，進(jìn)行核酸提取后，作為模板進(jìn)行qPCR反應(yīng)。
目前市場上優(yōu)秀的qPCR支原體檢測試劑盒可檢測支原體種類可達(dá)到39~180種以上，檢測靈敏度可達(dá)到10cfu/mL。
1高特異性：TaqMan探針通過與目標(biāo)DNA序列特異性結(jié)合，確保了檢測的高特異性。
2高靈敏度：該方法可以檢測極低濃度的核酸模板，靈敏度高。
3實時監(jiān)測：在PCR反應(yīng)過程中實時監(jiān)測熒光信號，可以準(zhǔn)確地定量分析。
4減少污染風(fēng)險：由于不需要后續(xù)處理，減少了PCR產(chǎn)物污染的風(fēng)險。
多重檢測能力：可以同時使用不同顏色的熒光標(biāo)記，進(jìn)行多重檢測。
5簡化操作：制作成預(yù)混液后，大大簡化操作步驟，易于標(biāo)準(zhǔn)化和自動化。TaqMan探針法qPCR應(yīng)用于支原體檢測的優(yōu)點
(空格分隔,最多3個,單個標(biāo)簽最多10個字符)
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