Co-IP（免疫共沉淀，co-inmunoprecipitation）是經(jīng)典的利用抗體從樣品中捕獲靶蛋白及其互作蛋白、復(fù)合體的一項(xiàng)技術(shù)，能夠特異性富集所研究的目的蛋白。
免疫共沉淀Co-IP實(shí)驗(yàn)步驟
細(xì)胞轉(zhuǎn)染
1.鋪細(xì)胞，轉(zhuǎn)染細(xì)胞。本次轉(zhuǎn)染的兩個(gè)蛋白分別帶有FLAG和HA標(biāo)簽。
裂解細(xì)胞
2.去除培養(yǎng)基，PBS吹下細(xì)胞，離心去上清。將細(xì)胞沉淀轉(zhuǎn)移到1.5mlEP管中，PBS洗，離心去上清，加1ml裂解液。
3.冰上孵育40min，每10min震蕩一次。
4.超聲破碎細(xì)胞結(jié)構(gòu)和打斷染色質(zhì)。冰上操作。
這個(gè)功率和時(shí)間要你自己摸索，不同細(xì)胞不同機(jī)器都會(huì)有差別，一般的國(guó)產(chǎn)機(jī)器對(duì)10^7細(xì)胞用20%功率超聲4分鐘左右即可比較充分（超聲2秒，停2秒）。直到溶液相對(duì)比較清澈，沒(méi)有絲狀DNA。
5. 4度，12000 rpm/min離心10mins。
6.轉(zhuǎn)移上清(上清體積會(huì)有所增加，可能是因?yàn)榧?xì)胞溶解了)到新的預(yù)冷的試管中。取50ul上清作為input。
7.將剩余樣品分為兩份,其中一份加入FLAG(MOUSE)抗體1uL（轉(zhuǎn)染的蛋白帶有FLAG標(biāo)簽），一份加入相應(yīng)宿主的普通IgG(mouse),4℃輕搖過(guò)夜，使抗體和目標(biāo)蛋白充分結(jié)合。
抗體與beads的結(jié)合
8.將beads吸出至新管（每個(gè)107樣品準(zhǔn)備40ul beads懸液，約含20ul Protein A/G beads，細(xì)胞較少時(shí)可適當(dāng)減少，最少10ul懸液否則后續(xù)操作會(huì)很困難）用2倍體積(PBS+0.1%triton-100)洗滌3次，去上清。3000rpm離心1min基本可以充分沉淀，轉(zhuǎn)速時(shí)間可調(diào)。
9.用等體積的buffer重懸beads。
10.在每個(gè)樣品中加入20ul beads懸液，4℃輕搖2小時(shí)，使抗體和beads充分結(jié)合。
樣品的收集和洗滌
11.將IP過(guò)后的樣品離心 3000rpm 1min。
12.將上清轉(zhuǎn)移至新管 標(biāo)記為Flow through。
13.加入500ul (PBS+0.1%triton-100)洗滌beads 4℃輕搖5min 3000rpm 1min 棄上清。
14.洗滌三次，最后一次盡量去除上清。
樣品的洗脫
15.用30-100ul裂解液重懸beads，具體體積根據(jù)SDS-PAGE需求自定。
16.將樣品和input中加入合適體積的loading buffer混勻，必要時(shí)可以將Flow through進(jìn)行制樣檢測(cè)。
17.95℃-100℃熱變性10-15min，冷卻后凍存?zhèn)溆谩?/span>
18.SDS-PAGE和WB檢測(cè)。IP用的是FLAG抗體，檢測(cè)HA。
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