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北京百泰派克生物科技有限公司
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Top-Down蛋白質(zhì)組學(xué)在腫瘤標(biāo)志物發(fā)

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Top-Downdànbáizhì組學(xué)在腫瘤標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)中的五大應(yīng)用檢測技術(shù)服務(wù): 腫瘤標(biāo)志物作為癌癥診療的重要分子指標(biāo),長期依賴傳統(tǒng)蛋白組學(xué)技術(shù)的支持。然而,腫瘤本質(zhì)上是一種高度異質(zhì)性的疾病,其關(guān)鍵蛋白往往具有豐富的翻譯后修飾(PTMs)和變異異構(gòu)體(proteoforms)。這些精細(xì)分子特征常常在傳統(tǒng)Bottom-Updànbáizhì組學(xué)中被忽略,制約了腫瘤標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn)深度與jīngzhǔn度

Top-Down蛋白質(zhì)組學(xué)在腫瘤標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)中的五大應(yīng)用檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹

腫瘤標(biāo)志物作為癌癥診療的重要分子指標(biāo),長期依賴蛋白組學(xué)技術(shù)的支持。然而,腫瘤本質(zhì)上是一種高度異質(zhì)性的疾病,其關(guān)鍵蛋白往往具有豐富的翻譯后修飾(PTMs)和變異異構(gòu)體(proteoforms)。這些精細(xì)分子特征常常在Bottom-Updànbáizhì組學(xué)中被忽略,制約了腫瘤標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn)深度與jīngzhǔn度。Top-Downdànbáizhì組學(xué)是一種直接分析完整dànbáizhì(而非肽段)的質(zhì)譜技術(shù),能夠保留dànbáizhì的翻譯后修飾(PTMs)、剪接變體和dànbáizhì異構(gòu)體信息,通過直接分析完整dànbáizhì分子,實現(xiàn)dànbáizhì變體的全面解析,正成為破解腫瘤復(fù)雜性的重要工具。Bottom-Updànbáizhì組學(xué)雖然廣泛應(yīng)用于腫瘤研究,但其“肽段為基礎(chǔ)"的策略難以保留完整dànbáizhì的信息,如剪切異構(gòu)體、翻譯后修飾(PTMs)等,限制了其在jīngzhǔn標(biāo)志物解析中的表現(xiàn)。相比之下,Top-Downdànbáizhì組學(xué)技術(shù)通過直接分析完整dànbáizhì分子,可在保持原始結(jié)構(gòu)完整性的同時,jīngquè捕捉各種dànbáizhì異構(gòu)體。這使其在腫瘤標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)中展現(xiàn)出dútè優(yōu)勢。


一、解析dànbáizhì異構(gòu)體,揭示腫瘤異質(zhì)性本質(zhì)

Top-Down技術(shù)能直接分析dànbáizhì的全長序列和PTM組合,識別同源蛋白的不同變體(proteoforms)。例如,p53蛋白的不同磷酸化、乙?;揎棤顟B(tài)在腫瘤發(fā)生發(fā)展中具有wánquán不同的功能意義。Bottom-Up方法無法jīngzhǔn識別這些差異,而Top-Down方法則可區(qū)分并量化這些功能性變體,助力揭示腫瘤細(xì)胞表型背后的分子機制。


二、靶向低豐度蛋白,提升早期診斷靈敏度

許多具有潛力的腫瘤標(biāo)志物(如循環(huán)腫瘤細(xì)胞分泌的信號蛋白)豐度極低、異構(gòu)體多。Top-Downdànbáizhì組學(xué)結(jié)合高分辨質(zhì)譜與前處理富集策略,可在復(fù)雜背景下捕捉這些低豐度蛋白,尤其適用于血液、尿液等體液樣本,提升早期腫瘤篩查的特異性和靈敏度。


三、多位點修飾分析,賦能功能性標(biāo)志物篩選

在癌癥進展中,許多關(guān)鍵蛋白同時攜帶多種翻譯后修飾(如磷酸化、泛素化、甲基化等)。Top-Down策略可同時解析這些修飾的空間組合,有助于區(qū)分“修飾指紋"對蛋白功能的調(diào)控,從而篩選出更具功能意義和臨床價值的候選標(biāo)志物。


四、構(gòu)建Proteoform圖譜,助力亞型分類與個體化治療

通過Top-Downdànbáizhì組學(xué)構(gòu)建特定癌種的proteoform圖譜,有助于識別不同腫瘤亞型之間的關(guān)鍵分子差異。例如在乳腺癌研究中,不同proteoform模式已被用于區(qū)分ER陽性與HER2陽性亞型。這一策略為jīngzhǔn分型與靶向治療提供了分子依據(jù)。


五、結(jié)合AI算法,推動標(biāo)志物大規(guī)模發(fā)現(xiàn)與驗證

當(dāng)Top-Downdànbáizhì組數(shù)據(jù)與機器學(xué)習(xí)算法結(jié)合后,可在多組學(xué)背景中識別高價值生物標(biāo)志物特征。數(shù)據(jù)驅(qū)動的模型不僅提高了候選標(biāo)志物的識別效率,還提升了其跨平臺、跨人群的可重復(fù)性。隨著質(zhì)譜技術(shù)的通量提升,Top-Down策略正逐步向臨床轉(zhuǎn)化邁進。


Top-Downdànbáizhì組學(xué)在腫瘤標(biāo)志物研究中展現(xiàn)出結(jié)構(gòu)解析深度高、修飾識別能力強、異構(gòu)體區(qū)分精細(xì)等dútè優(yōu)勢。作為一家專注于前沿蛋白組技術(shù)的科研服務(wù)企業(yè),在百泰派克生物科技,我們整合高分辨率Orbitrap質(zhì)譜平臺、定制化富集方案與AI輔助分析流程,打造面向科研與臨床轉(zhuǎn)化的Top-Downdànbáizhì組學(xué)服務(wù)體系。期待與您共同推進腫瘤jīngzhǔn醫(yī)學(xué)的發(fā)展。


百泰派克生物科技特色項目


一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù),包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù),對蛋白序列進行分析。


※服務(wù)優(yōu)勢:

1.采用目前世界上先進的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。



二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù),助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。


※服務(wù)優(yōu)勢:

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析,發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法,適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高,實驗結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析,分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。



三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析,采用金屬元素標(biāo)記物(通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體)標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子,然后用流式細(xì)胞原理分離單個細(xì)胞,再用電感耦合等離子體質(zhì)譜(ICP-MS)分析單個細(xì)胞的原子質(zhì)量譜,zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號分子表達量。


※服務(wù)優(yōu)勢:

1.技術(shù)先進,填補技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù),避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細(xì)胞層面上對多種指標(biāo)同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大,成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右,而流式質(zhì)譜技術(shù)一次(單樣本)就可分析至少10^5的細(xì)胞,實現(xiàn)了數(shù)量級的提高,且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外,質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾;

③可檢測細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。



四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺進行免疫肽組學(xué)分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復(fù)的識別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標(biāo)。



五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù),MALDI TOF,高效色譜分離技術(shù),提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析,到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù),幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。



百泰派克生物科技七大檢測平臺

Top-Down蛋白質(zhì)組學(xué)在腫瘤標(biāo)志物發(fā)




百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務(wù)。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則,通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證,建立了完備的質(zhì)量體系,數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,設(shè)備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù),支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù);

2.獲國家CNAS實驗室認(rèn)可,為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù);

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等;

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺,滿足您一站式服務(wù)需求;

5.服務(wù)3000+企業(yè),10000+客戶的選擇;

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!



Top-Down蛋白質(zhì)組學(xué)在腫瘤標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)中的五大應(yīng)用檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹

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