PMF vs MS/MS：多肽測序技術(shù)原理與應(yīng)用解析檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹

多肽測序技術(shù)多肽測序技術(shù)通過確定dànbáizhì氨基酸序列及翻譯后修飾，科研人員能夠深入解析生命過程，發(fā)現(xiàn)新的疾病標(biāo)志物，推進(jìn)藥物靶點(diǎn)開發(fā)。PMF vs MS/MS的多肽測序技術(shù)原理與應(yīng)用解析將助力科研人員在復(fù)雜樣品和jīngzhǔn研究中選擇zuì合適的策略。目前，隨著質(zhì)譜技術(shù)的發(fā)展，肽段分析的分辨率、靈敏度和通量不斷提升，肽指紋圖譜（Peptide Mass Fingerprinting, PMF）和串聯(lián)質(zhì)譜（Tandem MS, MS/MS）是當(dāng)前zuì常用的多肽測序策略，科研人員應(yīng)根據(jù)實(shí)驗(yàn)?zāi)繕?biāo)、樣品特性和研究需求選擇合適策略，或采用多技術(shù)整合，實(shí)現(xiàn)更高分辨率、更高通量的蛋白zhìzǔxué研究。

一、PMF與MS/MS技術(shù)原理概述

1、 Peptide Mass Fingerprinting（PMF）：基于肽段質(zhì)量的模式識別

PMF是質(zhì)譜多肽鑒定的經(jīng)典方法，主要依賴于dànbáizhì酶解后所得多肽的分子質(zhì)量指紋。具體流程包括：

（1） 酶解：將目標(biāo)蛋白用yídànbáiméi等特異性酶切割，生成多肽混合物

（2）質(zhì)譜分析：采用MALDI-TOF（基質(zhì)輔助激光解吸/電離-飛行時間）測定多肽分子質(zhì)量（m/z）

（3）數(shù)據(jù)庫比對：將實(shí)驗(yàn)中獲得的質(zhì)量指紋與理論數(shù)據(jù)庫中的酶解肽質(zhì)量進(jìn)行匹配，確定蛋白種類。

• 優(yōu)點(diǎn)：操作簡便、通量高、成本低，適用于單蛋白樣品的快速鑒定。

• 局限：無法提供序列信息，低豐度蛋白和復(fù)雜樣本中的多肽鑒定能力有限；翻譯后修飾（PTMs）無法直接識別。

2、Tandem Mass Spectrometry（MS/MS）：基于肽段碎片離子的序列解析

MS/MS采用串聯(lián)質(zhì)譜進(jìn)行多肽測序。其核心流程包括：

（1）酶解與分離：同樣*行酶切，通常采用LC（液相色譜）分離肽段

（2）質(zhì)譜檢測：在ESI（電噴霧電離）或MALDI源中，質(zhì)譜儀測定母離子（前體肽段）的m/z

（3）選擇母離子并解離：選定特定母離子后，在碰撞室中誘導(dǎo)其裂解，產(chǎn)生b、y等系列離子。

（4）檢測碎片離子：分析碎片離子的質(zhì)量與豐度，推導(dǎo)氨基酸序列，進(jìn)行數(shù)據(jù)庫搜索或de novo測序。

• 優(yōu)點(diǎn)：分辨率高、序列信息完整，可識別復(fù)雜混合物中低豐度蛋白，能夠定位修飾位點(diǎn)。

• 局限：對儀器要求高，操作復(fù)雜，數(shù)據(jù)分析耗時長。

二、技術(shù)對比分析：PMF vs MS/MS

從技術(shù)本質(zhì)來看，PMF適合于快速篩選和單蛋白樣品，而MS/MS則適合復(fù)雜樣品解析、修飾鑒定及新蛋白測序。科研人員可根據(jù)樣品類型、研究目的和設(shè)備條件，選擇合適策略。

三、應(yīng)用場景與技術(shù)進(jìn)展

1、 PMF的典型應(yīng)用

（1）蛋白純化后的快速鑒定：純化蛋白（如SDS-PAGE膠條回收）經(jīng)yídànbáiméi酶解后，利用MALDI-TOF-PMF匹配數(shù)據(jù)庫，快速確認(rèn)蛋白種類。

（2） dànbáizhì質(zhì)量控制與批次驗(yàn)證：在生物制藥中，常用于批次一致性檢測，保證產(chǎn)品質(zhì)量。

（3） 成本控制與高通量篩選：PMF因通量高、速度快，適合用于大量樣品初篩。

2、MS/MS的典型應(yīng)用

（1）蛋白zhìzǔxué研究：結(jié)合LC-MS/MS，可在復(fù)雜生物樣品（如血漿、組織）中，定性定量分析上千種蛋白；

（2）翻譯后修飾解析：定位磷酸化、糖基化、乙?；?、泛素化等關(guān)鍵修飾位點(diǎn)，揭示功能調(diào)控機(jī)制；

（3）新抗原和生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)：肽測序在腫瘤miǎnyìzhìliáo、新藥研發(fā)中用于發(fā)現(xiàn)新抗原或疾病相關(guān)肽段；

（4）de novo測序與物種特異蛋白解析：無需數(shù)據(jù)庫，直接解析未知蛋白序列。

四、未來趨勢與技術(shù)融合

隨著質(zhì)譜技術(shù)的進(jìn)步，PMF與MS/MS正在逐漸融合與互補(bǔ)：

1、高分辨MALDI-TOF/TOF：MALDI技術(shù)不僅可用于PMF，還能實(shí)現(xiàn)MS/MS碎片檢測，提升信息量；

2、LC-MALDI-MS/MS混合策略：將LC分離與MALDI檢測結(jié)合，兼顧分離效率與分析速度；

3、AI輔助多肽序列解析：引入深度學(xué)習(xí)模型，提高碎片圖譜解析精度，解決同分異構(gòu)體與復(fù)雜修飾肽段識別問題；

4、單細(xì)胞質(zhì)譜技術(shù)：推動單細(xì)胞水平的肽測序，為jīngzhǔn醫(yī)學(xué)提供更多維度的數(shù)據(jù)支持。

在肽測序領(lǐng)域，百泰派克生物科技依托*質(zhì)譜平臺（包括Orbitrap Fusion Lumos、Q-Exactive HF-X、MALDI-TOF/TOF），結(jié)合自主開發(fā)的樣品前處理和數(shù)據(jù)分析流程，提供從PMF到MS/MS的全流程多肽測序解決方案。為您快速PMF鑒定；高分辨MS/MS測序；多技術(shù)整合；全鏈路定制服務(wù)，以*的儀器平臺、完善的解決方案和zhuānyè的技術(shù)團(tuán)隊(duì)，為全球客戶提供jīngzhǔn、可靠的肽測序服務(wù)，共同推動蛋白組學(xué)與生物醫(yī)藥領(lǐng)域的創(chuàng)新發(fā)展。

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù)，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù)，對蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.采用目前世界上*的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達(dá) 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、蛋白zhìzǔxué

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC，提供定量蛋白zhìzǔxué、bǎxiàngdàn白zhìzǔxué、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種蛋白zhìzǔxué分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白zhìzǔxué服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.技術(shù)*，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細(xì)胞層面上對多種指標(biāo)同時進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù)；

2.獲國家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋蛋白zhìzǔxué、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

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