Top-Down蛋白質測序：優(yōu)勢、應用與挑戰(zhàn)檢測技術服務詳情介紹

在dànbáizhì組學不斷向精細化與功能化拓展的當下，如何從整體層面解析dànbáizhì的結構與修飾，成為解析生物功能和疾病機制的關鍵。Top-Downdànbáizhì測序作為直接分析完整dànbáizhì分子的技術路徑，近年來在多種復雜生物體系中展現出dútè優(yōu)勢，是研究dànbáizhì異構體和翻譯后修飾（PTMs）bùkěhuòquē的工具之一。

一、Top-Downdànbáizhì測序技術概述

Top-Down方法以完整dànbáizhì為起點，跳過酶解步驟，直接通過高分辨質譜完成離子化、分離和碎裂，從而獲取序列信息與修飾狀態(tài)。這種策略可實現對dànbáizhì原始結構的全面保留，為解析復雜同種型（Proteoform）和識別共存修飾提供了必要手段。與基于肽段級別的測序方式相比，Top-Down避免了修飾信息丟失、位點重定位和同種型混淆等問題，更適用于jīngquè結構解析與功能研究。

二、Top-Downdànbáizhì測序技術優(yōu)勢解析

1、jīngquè識別同種型異構體

一個基因可編碼多個同種型蛋白，其差異可能來自替代剪接、起始位點變異或多種修飾的組合。Top-Down通過直接測序完整蛋白體，實現對異構體的高分辨識別與定量，為疾病相關變異體的發(fā)現提供更高靈敏度的技術路徑。

2、翻譯后修飾的完整解析

在肽段級別分析中，翻譯后修飾（如磷酸化、乙?；?、甲基化）易因酶切斷裂位點偏好性而發(fā)生偏差，造成修飾位置的不確定性。Top-Down可在不破壞修飾組合結構的前提下，完整記錄并定位多重修飾，尤其適用于信號通路中動態(tài)修飾的追蹤。

3、高結構保真度支持空間構象研究

Top-Down質譜可獲得更豐富的片段離子，支持推斷dànbáizhì的二級和三維結構特征。對于需要解析構象變化或受限空間修飾的研究場景，具備yōuyuè的信息覆蓋能力。

4、一站式定性定量能力

Top-Down技術不僅可提供dànbáizhì序列與修飾信息，還能在同一實驗中實現定量分析，尤其適用于對單一目標蛋白在不同狀態(tài)下的表達與修飾比較。

三、Top-Downdànbáizhì測序主要應用場景

1、疾病機制研究與生物標志物發(fā)現

在腫瘤、神經系統(tǒng)疾病、自身免疫等復雜病理狀態(tài)中，dànbáizhì異構體的表達變化往往早于轉錄組水平的改變。Top-Down能夠識別疾病相關的特異性Proteoform，為生物標志物篩選與jīngzhǔn治療靶點的確立提供數據支持。

2、細胞應答與修飾動態(tài)調控分析

細胞對刺激或藥物的應答常通過PTMs調控蛋白活性。Top-Down在不丟失共存修飾組合的前提下，捕捉細胞狀態(tài)轉變中的修飾圖譜變化，揭示調控機制。

3、生物制品結構驗證與質量控制

對于單克隆抗體、融合蛋白等復雜生物制劑，結構完整性直接影響其活性與穩(wěn)定性。Top-Down能識別剪切體、去糖化、脫?；任⑿∽儺悾瑵M足結構一致性審評標準，已逐步應用于生物藥開發(fā)與質量評估環(huán)節(jié)。

四、Top-Downdànbáizhì測序技術挑戰(zhàn)

1、高分辨儀器要求

完整dànbáizhì分析對質譜分辨率和碎裂效率提出jígāo要求，目前僅部分平臺具備覆蓋高質量碎片信息的能力，尚未形成普及化配置。

2、樣品預處理復雜度

完整dànbáizhì在富集與分離過程中易發(fā)生降解與聚集，分析前需優(yōu)化緩沖體系、去鹽策略與分離流程，對實驗設計提出更高門檻。

3、數據處理算法尚不成熟

Top-Down產生的碎片離子信息龐大且復雜，對數據庫搜索、修飾位點匹配及異構體鑒定算法的依賴程度遠高于其他方法。數據分析工具仍需持續(xù)迭代，才能支撐高通量研究需求。

隨著質譜硬件不斷進化（如ETD/ECD碎裂技術提升）、自動化樣品制備平臺落地，以及AI驅動的數據解析方法不斷優(yōu)化，Top-Downdànbáizhì測序的通量與穩(wěn)定性正在快速提升。該技術有望在dànbáizhì功能組學、疾病機制解析和生物制品開發(fā)中發(fā)揮更廣泛作用，并與其他組學手段形成互補協(xié)同，構建多維度生物信息解析體系。百泰派克生物科技聚焦前沿dànbáizhì組學技術，基于*的質譜平臺，搭建了適用于Top-Down分析的一體化流程。我們提供包括完整蛋白提取、前處理優(yōu)化、分離富集、質譜測定及數據注釋在內的定制化服務，適用于蛋白異構體研究與修飾圖譜繪制。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質譜的蛋白測序分析服務，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。

※服務優(yōu)勢：

1.采用目前世界上*的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫(yī)學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析，發(fā)現新的生物標記物;

2.體內體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質譜分析靈敏度高，實驗結果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統(tǒng)準確。

三、單細胞質譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統(tǒng)進行單細胞質譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質量譜，zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。

※服務優(yōu)勢：

1.技術*，*技術空白

采用金屬標記抗體技術，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題?？稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右，而流式質譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現了數量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規(guī)蛋白外，質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現

百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質譜技術，MALDI TOF，高效色譜分離技術，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析，到產品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質生物藥物分析服務，幫助生物醫(yī)藥生產商提高生物藥物品質。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質譜多組學優(yōu)質服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證，建立了完備的質量體系，數據冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術服務，支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產放行。

1.公司采用ISO9001質量控制體系，zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合*藥政法規(guī)的藥物質量研究服務；

3.業(yè)務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等；

4.七大質量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；

5.服務3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質的生物質譜分析服務!

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