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北京百泰派克生物科技有限公司
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全面了解抗體測序:從肽段識別到全長序列拼

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更新時間:2025-07-05 12:04:11瀏覽次數(shù):48次

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全面了解抗體測序:從肽段識別到全長序列拼接檢測技術(shù)服務(wù): 抗體測序(Antibody Sequencing)是獲取抗體氨基酸序列的關(guān)鍵技術(shù),廣泛應(yīng)用于抗體藥物開發(fā)、功能改造、結(jié)構(gòu)建模及zhuānlì保護(hù)等領(lǐng)域。該技術(shù)以高分辨率質(zhì)譜為核心,通過蛋白酶解和數(shù)據(jù)拼接重建出抗體輕鏈(LC)和重鏈(HC)的完整序列。本文將系統(tǒng)梳理抗體測序的核心流程、關(guān)鍵技術(shù)參數(shù)及應(yīng)用價值,幫助科研人員理解其科學(xué)原理與實際意

全面了解抗體測序:從肽段識別到全長序列拼接檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹

抗體測序(Antibody Sequencing)是獲取抗體氨基酸序列的關(guān)鍵技術(shù),廣泛應(yīng)用于抗體藥物開發(fā)、功能改造、結(jié)構(gòu)建模及zhuānlì保護(hù)等領(lǐng)域。該技術(shù)以高分辨率質(zhì)譜為核心,通過蛋白酶解和數(shù)據(jù)拼接重建出抗體輕鏈(LC)和重鏈(HC)的完整序列。本文將系統(tǒng)梳理抗體測序的核心流程、關(guān)鍵技術(shù)參數(shù)及應(yīng)用價值,幫助科研人員理解其科學(xué)原理與實際意義。


一、抗體測序的基本原理

抗體測序是通過dànbáizhì質(zhì)譜(proteomics)技術(shù),在無RNA模板的情況下,從蛋白層面直接解析抗體的氨基酸序列。相比核酸測序,它不受細(xì)胞狀態(tài)限制,特別適用于無細(xì)胞株樣品或RNA質(zhì)量受限的抗體來源。

其基本流程包括:


  • 蛋白酶解生成肽段;

  • LC-MS/MS獲取質(zhì)譜圖;

  • 應(yīng)用de novo算法重建肽段序列;

  • 拼接輕鏈與重鏈全長序列;

  • 對關(guān)鍵功能區(qū)域(如CDR)進(jìn)行注釋與驗證。


二、核心技術(shù)流程與優(yōu)化策略

1、多酶協(xié)同酶解


  • 目的:增加肽段冗余度,覆蓋變異區(qū)域

  • 常用蛋白酶:Trypsin、Lys-C、Chymotrypsin、Asp-N等

  • 優(yōu)勢:實現(xiàn)高覆蓋率、減少盲區(qū),尤其適用于CDR區(qū)域


2、高分辨率質(zhì)譜采集


  • 平臺:LC-MS/MS系統(tǒng),支持HCD、ETD等碎裂方式

  • 關(guān)鍵指標(biāo):質(zhì)量準(zhǔn)確度(<1 ppm)、分辨率、動態(tài)范圍

  • 效果:可解析低豐度肽段及翻譯后修飾,確保序列準(zhǔn)確性


3、De novo反演與數(shù)據(jù)庫比對結(jié)合


  • De novo測序:適用于未知抗體序列,通過碎片離子圖譜重建肽段

  • 數(shù)據(jù)庫匹配:提高框架區(qū)識別置信度

  • 結(jié)合優(yōu)勢:保障新序列識別能力,同時控制錯誤識別率


4、全長序列拼接與結(jié)構(gòu)建構(gòu)


  • 拼接依據(jù):肽段重疊、酶切位點邏輯、一致性檢查

  • 輔助建構(gòu):參考IgG結(jié)構(gòu)模板識別框架區(qū)與CDR區(qū)界限

  • 交叉驗證:必要時結(jié)合轉(zhuǎn)錄組或外部表達(dá)數(shù)據(jù)提高可靠性


三、質(zhì)量控制標(biāo)準(zhǔn)

為了確保抗體測序結(jié)果具備科研和工程應(yīng)用價值,應(yīng)關(guān)注以下質(zhì)量指標(biāo):


  • 序列覆蓋率:全鏈應(yīng) >95%,CDR區(qū)全覆蓋

  • 拼接一致性:多酶數(shù)據(jù)交叉驗證,消除歧義肽段

  • CDR識別精度:jīngquè定位CDR1~CDR3,支持結(jié)構(gòu)建模

  • 完整性報告:包括酶解圖譜、拼接圖示、原始質(zhì)譜數(shù)據(jù)及FASTA格式輸出


四、抗體測序的典型應(yīng)用場景

1、抗體藥物研發(fā)

掌握全長抗體序列是親和力成熟、人源化改造、穩(wěn)定性增強(qiáng)等工程操作的前提。


2、雜交瘤抗體重組表達(dá)

對失活或不可擴(kuò)增的雜交瘤細(xì)胞進(jìn)行抗體測序,可實現(xiàn)重組表達(dá),提高生產(chǎn)一致性。


3、生物類似物開發(fā)

通過測序獲得參考抗體序列,有助于功能復(fù)現(xiàn)與結(jié)構(gòu)優(yōu)化,推動仿制藥開發(fā)。


4、zhuānlì注冊與知識產(chǎn)權(quán)保護(hù)

測序數(shù)據(jù)作為原始技術(shù)資料,支持抗體zhuānlì撰寫、注冊備案及技術(shù)交底。


5、學(xué)術(shù)研究與發(fā)表需求

對已有抗體產(chǎn)品進(jìn)行測序,有助于文獻(xiàn)中數(shù)據(jù)的可復(fù)現(xiàn)性與方法透明性。


抗體測序作為連接抗體發(fā)現(xiàn)與工程改造的關(guān)鍵橋梁,其準(zhǔn)確性直接影響科研效率與產(chǎn)業(yè)轉(zhuǎn)化成功率。通過優(yōu)化酶解策略、提升質(zhì)譜性能、強(qiáng)化拼接算法,科研人員能夠獲取完整可信的抗體序列,為結(jié)構(gòu)分析、功能優(yōu)化與藥物開發(fā)提供堅實基礎(chǔ)。百泰派克生物科技致力于為生命科學(xué)研究者提供高質(zhì)量、標(biāo)準(zhǔn)化、可驗證的抗體測序服務(wù)。如您在項目中面臨抗體序列缺失、功能區(qū)不明或zhuānlì支持需求,歡迎隨時聯(lián)系我們,獲取zhuānyè技術(shù)方案與一對一服務(wù)支持。


百泰派克生物科技特色項目


一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進(jìn)行分析,提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù),包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù),對蛋白序列進(jìn)行分析。


※服務(wù)優(yōu)勢:

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達(dá) 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。



二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù),助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。


※服務(wù)優(yōu)勢:

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析,發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法,適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高,實驗結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析,分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。



三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析,采用金屬元素標(biāo)記物(通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體)標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子,然后用流式細(xì)胞原理分離單個細(xì)胞,再用電感耦合等離子體質(zhì)譜(ICP-MS)分析單個細(xì)胞的原子質(zhì)量譜,zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號分子表達(dá)量。


※服務(wù)優(yōu)勢:

1.技術(shù)優(yōu)良,*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù),避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細(xì)胞層面上對多種指標(biāo)同時進(jìn)行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大,成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右,而流式質(zhì)譜技術(shù)一次(單樣本)就可分析至少10^5的細(xì)胞,實現(xiàn)了數(shù)量級的提高,且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景;

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外,質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾;

③可檢測細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。



四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析,可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標(biāo)。



五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù),MALDI TOF,高效色譜分離技術(shù),提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析,到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù),幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。



百泰派克生物科技七大檢測平臺

全面了解抗體測序:從肽段識別到全長序列拼




百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務(wù)。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則,通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證,建立了完備的質(zhì)量體系,數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,設(shè)備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù),支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù);

2.獲國家CNAS實驗室認(rèn)可,為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù);

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等;

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺,滿足您一站式服務(wù)需求;

5.服務(wù)3000+企業(yè),10000+客戶的選擇;

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!



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