Orbitrap技術(shù)如何實(shí)現(xiàn)高精度C端肽測(cè)序？檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

在dànbáizhì組學(xué)研究中，C端肽的準(zhǔn)確定序?qū)τ诮馕鰀ànbáizhì翻譯后修飾、降解信號(hào)識(shí)別及新功能肽段發(fā)現(xiàn)具有重要意義。C端區(qū)域通常承載著多種功能性結(jié)構(gòu)，然而由于結(jié)構(gòu)異質(zhì)性強(qiáng)、信號(hào)弱和酶切限制等因素，C端肽的質(zhì)譜解析始終面臨挑戰(zhàn)。隨著Orbitrap質(zhì)譜技術(shù)的成熟，高精度C端肽測(cè)序已成為可能。本文將系統(tǒng)探討Orbitrap如何在C端肽識(shí)別中實(shí)現(xiàn)高分辨、低誤差與強(qiáng)覆蓋的綜合優(yōu)勢(shì)。

一、C端肽測(cè)序的挑戰(zhàn)與技術(shù)壁壘

C端肽作為dànbáizhì序列的末端區(qū)域，其解析難點(diǎn)主要體現(xiàn)在以下幾個(gè)方面：

• 酶切效率低：主流酶切策略主要面向N端鄰近的K/R位點(diǎn)，不利于C端片段的完整釋放；

• 肽段異質(zhì)性高：C端肽缺乏統(tǒng)一結(jié)構(gòu)特征，易產(chǎn)生長(zhǎng)度及修飾多樣的片段；

• 信號(hào)強(qiáng)度弱：在復(fù)雜樣本中，C端肽豐度低，常被背景信號(hào)干擾；

• 譜圖復(fù)雜性高：C端肽往往攜帶翻譯后修飾（如酰胺化、泛素化等），碎裂后譜圖特征不典型，影響序列還原。

因此，C端肽的識(shí)別不僅依賴硬件性能，更需要整體流程的協(xié)同優(yōu)化。

二、Orbitrap技術(shù)的關(guān)鍵優(yōu)勢(shì)

Orbitrap作為高分辨質(zhì)譜平臺(tái)，在C端肽測(cè)序中具備多項(xiàng)核心技術(shù)優(yōu)勢(shì)：

1、高分辨率與質(zhì)量精度

Orbitrap具備≥240,000的分辨率和亞ppm質(zhì)量精度，能夠有效分辨質(zhì)量接近的肽段異構(gòu)體，顯著提升肽段識(shí)別的特異性與準(zhǔn)確性。對(duì)于C端肽這種結(jié)構(gòu)不規(guī)則、修飾復(fù)雜的分子尤為關(guān)鍵。

2、多模式碎裂能力

Orbitrap支持HCD、ETD、EThcD等多種碎裂模式組合，特別是EThcD模式可在保留修飾信息的同時(shí)產(chǎn)生連續(xù)性更強(qiáng)的b/y/c/z離子系列，為C端結(jié)構(gòu)解讀提供豐富的信息維度。

3、廣譜數(shù)據(jù)采集能力

通過(guò)支持DIA和PRM等高覆蓋數(shù)據(jù)采集模式，Orbitrap可在不犧牲靈敏度的前提下兼顧肽段定性與定量，尤其適用于低豐度的C端肽檢測(cè)。

三、實(shí)現(xiàn)高精度C端肽測(cè)序的策略

1、酶切與樣本處理優(yōu)化

采用特異性更強(qiáng)的酶切策略是C端保留的關(guān)鍵。例如使用GluC、AspN等對(duì)C端區(qū)域識(shí)別能力更優(yōu)的蛋白酶，在特定反應(yīng)條件下可更有效釋放完整C端肽段。輔以yíméi二次消化或xiànshí反應(yīng)控制，可進(jìn)一步減少非特異性片段干擾。此外，采用選擇性富集策略（如疏水性分級(jí)、化學(xué)衍生化）可提升C端肽的檢測(cè)概率。

2、高分辨采集與目標(biāo)窗設(shè)定

在Orbitrap平臺(tái)中，采用DIA策略進(jìn)行全掃描采集，配合優(yōu)化的窗口設(shè)計(jì)與C端特異性肽段庫(kù)，可顯著提高數(shù)據(jù)采集的全面性和靶向性。對(duì)于高通量項(xiàng)目，PRM模式可實(shí)現(xiàn)對(duì)特定C端肽的jīngzhǔn監(jiān)測(cè)。

3、高質(zhì)量碎裂與譜圖解析

HCD與EThcD的碎裂組合能生成更豐富的離子類型，有助于重建非典型C端肽的結(jié)構(gòu)信息。Orbitrap的高信噪比和jīngzhǔn碎裂離子檢測(cè)能力，使得即使復(fù)雜修飾肽段也能實(shí)現(xiàn)穩(wěn)定鑒定。

4、數(shù)據(jù)庫(kù)與算法協(xié)同增強(qiáng)識(shí)別率

通過(guò)構(gòu)建C端特異性序列數(shù)據(jù)庫(kù)，并結(jié)合AI輔助的譜圖匹配與肽段打分系統(tǒng)，可進(jìn)一步提升C端肽的鑒定通量與準(zhǔn)確性。當(dāng)前的深度學(xué)習(xí)模型在識(shí)別非經(jīng)典碎裂模式中表現(xiàn)出明顯優(yōu)勢(shì)，已成為Cduāncèxùbùkěhuòquē的部分。

四、應(yīng)用于功能性C端研究的潛力

高精度C端肽測(cè)序廣泛應(yīng)用于以下研究方向：

• 蛋白降解路徑分析：C端序列決定蛋白酶識(shí)別位點(diǎn)，如PROTAC研究中的degron信號(hào)解析；

• 翻譯后修飾定位：包括C端酰胺化、磷酸化、泛素化等功能性修飾的jīngquè定位；

• 新肽段發(fā)現(xiàn)與抗原預(yù)測(cè)：對(duì)MHC-I類呈遞肽、免疫原性片段等的識(shí)別具有實(shí)際意義；

• 蛋白加工機(jī)制研究：揭示信號(hào)肽剪切、C端延伸等生物合成調(diào)控路徑。

在這些研究場(chǎng)景中，Orbitrap憑借其結(jié)構(gòu)解析能力和定量穩(wěn)定性，為科學(xué)發(fā)現(xiàn)提供了可靠的數(shù)據(jù)支撐。

C端肽測(cè)序正在成為dànbáizhì組學(xué)中不可忽視的新增長(zhǎng)點(diǎn)。Orbitrap技術(shù)通過(guò)高分辨、高精度和多維碎裂能力，為破解C端肽結(jié)構(gòu)信息提供了強(qiáng)有力的工具支持。在此基礎(chǔ)上，結(jié)合酶切優(yōu)化、數(shù)據(jù)采集策略和算法模型，C端肽的系統(tǒng)性識(shí)別已邁入可大規(guī)模應(yīng)用的階段。百泰派克生物科技基于*的Orbitrap質(zhì)譜平臺(tái)和完善的數(shù)據(jù)處理流程，構(gòu)建了高度可定制化的C端肽測(cè)序技術(shù)服務(wù)。如您有多肽測(cè)序相關(guān)研究需求，歡迎聯(lián)系我們的技術(shù)團(tuán)隊(duì)，獲取定制化技術(shù)建議與實(shí)驗(yàn)支持！

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測(cè)序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測(cè)序系統(tǒng)對(duì)dànbáizhì序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測(cè)序分析服務(wù)，包括對(duì)dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對(duì)于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測(cè)序法的dànbáizhì從頭測(cè)序服務(wù)，對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.采用目前世界上*的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測(cè)定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測(cè)定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測(cè)定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測(cè);

6.測(cè)序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測(cè)較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.技術(shù)*，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問(wèn)題?？稍趩渭?xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測(cè)51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測(cè)細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過(guò)我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測(cè)平臺(tái)

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測(cè)和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過(guò)CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù)；

2.獲國(guó)家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái)，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

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