ABPP如何支持高通量化合物篩選？檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

在藥物發(fā)現(xiàn)的早期階段，研究者往往需要在數(shù)百甚至上千個(gè)候選化合物中篩選出具備良好活性、特異性和安全性的分子。然而，傳統(tǒng)篩選方法如酶活性抑制實(shí)驗(yàn)、結(jié)合親和分析等，雖然高通量，但缺乏靶點(diǎn)層面的直接功能讀數(shù)，無法提供分子在細(xì)胞或體內(nèi)“真實(shí)起作用"的證據(jù)。

活性位點(diǎn)探針dànbáizhì譜（Activity-Based Protein Profiling, ABPP）正在成為藥物篩選的重要輔助工具。其優(yōu)勢(shì)在于不僅能在復(fù)雜生物系統(tǒng)中驗(yàn)證靶點(diǎn)結(jié)合的功能效果，還能在全蛋白組尺度評(píng)估潛在脫靶風(fēng)險(xiǎn)，為高通量化合物篩選帶來qiánsuǒwèiyǒu的分辨率和可靠性。

一、什么是ABPP？為什么它適合用于高通量化合物篩選？

ABPP 是一種利用共價(jià)活性探針特異性標(biāo)記dànbáizhì活性位點(diǎn)，并通過高分辨率質(zhì)譜進(jìn)行檢測(cè)的技術(shù)。相比于蛋白組學(xué)，ABPP聚焦于“功能蛋白"——即那些在特定生物狀態(tài)中真正處于活躍狀態(tài)、發(fā)揮生物學(xué)效應(yīng)的酶類蛋白。

對(duì)于藥物篩選而言，ABPP可實(shí)現(xiàn)：

1、功能性靶點(diǎn)驗(yàn)證：判斷小分子是否真正影響目標(biāo)酶的活性；

2、脫靶譜監(jiān)測(cè)：分析分子是否誤傷其他酶類蛋白；

3、基于功能蛋白組的篩選維度：避免僅靠表達(dá)量或結(jié)構(gòu)親和力做判斷。

二、ABPP在高通量化合物篩選中的核心應(yīng)用場(chǎng)景

1、靶點(diǎn)抑制效果評(píng)估：競(jìng)爭(zhēng)型ABPP（Competitive ABPP）

ABPP的一項(xiàng)重要策略是競(jìng)爭(zhēng)結(jié)合實(shí)驗(yàn)，用于評(píng)估候選化合物是否與目標(biāo)蛋白活性位點(diǎn)發(fā)生相互作用。

實(shí)驗(yàn)原理如下：

（1）樣本（細(xì)胞或裂解液）先與化合物孵育；

（2）添加活性探針與酶結(jié)合；

（3）若化合物占據(jù)了活性位點(diǎn)，則探針結(jié)合減少；

（4）通過質(zhì)譜定量被探針標(biāo)記的蛋白，評(píng)估“抑制程度"。

優(yōu)勢(shì)： 直接驗(yàn)證功能性結(jié)合，不依賴表達(dá)量或假設(shè)機(jī)制。

2、脫靶效應(yīng)全面評(píng)估：功能蛋白組譜監(jiān)測(cè)

在藥物研發(fā)中，脫靶是臨床失敗的重要原因之一。ABPP可一次性檢測(cè)多個(gè)酶類蛋白活性，提供候選分子影響下的活性蛋白全景圖譜。

（1）能同時(shí)監(jiān)測(cè)幾十甚至上百個(gè)靶點(diǎn)級(jí)酶類；

（2）發(fā)現(xiàn)隱藏脫靶風(fēng)險(xiǎn)；

（3）輔助化合物結(jié)構(gòu)優(yōu)化和選擇性增強(qiáng)。

3、基于活性變化的候選分子篩選平臺(tái)

ABPP不僅用于驗(yàn)證已有化合物，也可用于構(gòu)建活性變化驅(qū)動(dòng)的篩選體系：

（1）利用高通量LC-MS/MS檢測(cè)化合物處理后活性蛋白圖譜；

（2）識(shí)別出能調(diào)節(jié)特定病理相關(guān)酶活性的分子；

（3）與表型數(shù)據(jù)聯(lián)動(dòng)，提升篩選精度。

應(yīng)用方向：適用于抗腫瘤、抗炎、神經(jīng)系統(tǒng)疾病等方向的功能性化合物篩選。

三、ABPP篩選流程如何開展？（推薦實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)）

四、百泰派克生物科技ABPP藥物篩選平臺(tái)

作為國(guó)內(nèi)lǐngxiān的dànbáizhì組學(xué)服務(wù)提供方，百泰派克生物科技已建立成熟的ABPP藥物篩選平臺(tái)，具備以下優(yōu)勢(shì)：

1、覆蓋多類型酶類探針庫(kù)（支持sīānsuān酶、半guāngānsuān酶、HDAC等）

2、競(jìng)爭(zhēng)型ABPP標(biāo)準(zhǔn)流程，適配高通量化合物評(píng)估

3、結(jié)合TMT/DIA定量技術(shù)，提升活性譜分辨率與數(shù)據(jù)可比性

4、提供脫靶譜圖、熱圖、通路分析、靶點(diǎn)建議一站式報(bào)告

5、高通量能力支持一次性篩選幾十個(gè)化合物組合

ABPP不僅能識(shí)別誰“表達(dá)"，更告訴我們誰“在工作"，為jīngzhǔn藥物設(shè)計(jì)提供堅(jiān)實(shí)依據(jù)。如果你正在尋找一套更智能、更可靠的候選分子篩選方式，歡迎聯(lián)系百泰派克生物科技，我們將為你定制基于ABPP的高通量化合物篩選解決方案，用“活性組"驅(qū)動(dòng)下一代藥物發(fā)現(xiàn)。

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測(cè)序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測(cè)序系統(tǒng)對(duì)dànbáizhì序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測(cè)序分析服務(wù)，包括對(duì)dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對(duì)于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測(cè)序法的dànbáizhì從頭測(cè)序服務(wù)，對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.采用目前世界上*的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測(cè)定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測(cè)定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測(cè)定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測(cè);

6.測(cè)序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測(cè)較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.技術(shù)*，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題?？稍趩渭?xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測(cè)51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測(cè)細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測(cè)平臺(tái)

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測(cè)和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù)；

2.獲國(guó)家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái)，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

ABPP如何支持高通量化合物篩選？檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹