基于質(zhì)譜的定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析：技術(shù)原理與應(yīng)用檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

在后基因組時(shí)代，定量dànbáizhì組學(xué)已成為解析生命系統(tǒng)復(fù)雜性、理解疾病機(jī)制和發(fā)現(xiàn)生物標(biāo)志物的核心工具。特別是以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的定量dànbáizhì組學(xué)，因其靈敏度高、通量大、定量準(zhǔn)確等優(yōu)勢(shì)，廣泛應(yīng)用于基礎(chǔ)研究與生物醫(yī)藥開(kāi)發(fā)之中。本文將系統(tǒng)梳理質(zhì)譜定量dànbáizhì組學(xué)的核心技術(shù)原理、主流策略及其應(yīng)用場(chǎng)景。

一、什么是定量dànbáizhì組學(xué)？

dànbáizhì組學(xué)是指在給定生物體系中對(duì)dànbáizhì的全面研究，定量dànbáizhì組學(xué)則進(jìn)一步聚焦于dànbáizhì表達(dá)水平的動(dòng)態(tài)變化，通過(guò)比較不同條件下dànbáizhì豐度的變化，揭示潛在的生物學(xué)機(jī)制。在技術(shù)層面，質(zhì)譜（Mass Spectrometry, MS）已成為dànbáizhì組學(xué)分析的中樞工具，能夠在高通量的基礎(chǔ)上實(shí)現(xiàn)dànbáizhì的鑒定與定量。

二、質(zhì)譜定量dànbáizhì組學(xué)的主流策略

1、基于標(biāo)記的方法（Label-based）

標(biāo)記定量方法通過(guò)在樣本處理或肽段水平引入穩(wěn)定同位素標(biāo)簽，實(shí)現(xiàn)樣本間dànbáizhì豐度的比較。

（1）化學(xué)標(biāo)記（如TMT/iTRAQ）

• 使用同位素標(biāo)簽在多達(dá)16個(gè)樣本中實(shí)現(xiàn)多重定量。

• 定量精度高，適合大規(guī)模樣本比較。

• 需結(jié)合高分辨率質(zhì)譜平臺(tái)。

（2）代謝標(biāo)記（如SILAC）

• 通過(guò)細(xì)胞培養(yǎng)引入“輕/重"氨基酸，實(shí)現(xiàn)在細(xì)胞水平的內(nèi)源性標(biāo)記。

• 適合哺乳動(dòng)物細(xì)胞模型，定量準(zhǔn)確性好。

2、基于無(wú)標(biāo)記的方法（Label-free）

無(wú)標(biāo)記定量策略主要依賴于MS信號(hào)強(qiáng)度或譜圖計(jì)數(shù)，具有操作簡(jiǎn)便、成本低的優(yōu)點(diǎn)。

• 適合大樣本量、復(fù)雜體系的研究場(chǎng)景。

• 可擴(kuò)展性強(qiáng)，但對(duì)樣品處理和儀器穩(wěn)定性要求較高。

3、靶向定量方法（如PRM/MRM）

與全蛋白組分析不同，靶向定量關(guān)注特定dànbáizhì/肽段的jīngzhǔn檢測(cè)，常用于驗(yàn)證發(fā)現(xiàn)階段的候選分子。

• 靈敏度高，重復(fù)性強(qiáng)。

• 適用于臨床前研究與生物標(biāo)志物驗(yàn)證。

三、樣本類型與數(shù)據(jù)處理要點(diǎn)

※ 多樣的樣本類型支持

基于質(zhì)譜的定量dànbáizhì組學(xué)適用于多種生物樣本，包括：

• 細(xì)胞與組織提取物

• 血清/血漿等體液樣本

• 臨床病理切片或FFPE組織

不同樣本類型對(duì)前處理策略、蛋白提取效率及酶解條件的優(yōu)化提出挑戰(zhàn)，需根據(jù)研究目標(biāo)定制實(shí)驗(yàn)流程。

※ 數(shù)據(jù)處理與生物信息分析

原始質(zhì)譜數(shù)據(jù)需通過(guò)專用算法進(jìn)行處理，包括：

• 肽段匹配與dànbáizhì推斷

• 相對(duì)或juéduì定量計(jì)算

• 差異蛋白篩選與富集分析

進(jìn)一步可結(jié)合通路富集、PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建、轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合分析等手段，實(shí)現(xiàn)多層次數(shù)據(jù)挖掘。

四、應(yīng)用場(chǎng)景

1、疾病機(jī)制解析

• 比較疾病組與對(duì)照組的dànbáizhì表達(dá)譜，挖掘與病理過(guò)程相關(guān)的調(diào)控通路。

• 聯(lián)合代謝組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)，實(shí)現(xiàn)系統(tǒng)層面理解。

2、生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)

• 識(shí)別與疾病診斷/預(yù)后相關(guān)的特異性dànbáizhì。

• 為臨床轉(zhuǎn)化研究提供候選靶標(biāo)。

3、藥物靶點(diǎn)驗(yàn)證

• 通過(guò)靶向定量評(píng)估藥物對(duì)特定信號(hào)通路的干預(yù)效果。

• 支持新藥研發(fā)與jīngzhǔn醫(yī)學(xué)。

4、發(fā)育與環(huán)境響應(yīng)研究

• 探究不同發(fā)育階段、處理?xiàng)l件下蛋白表達(dá)動(dòng)態(tài)變化。

• 有助于基礎(chǔ)生物學(xué)機(jī)制的深入理解。

基于質(zhì)譜的定量dànbáizhì組學(xué)分析已成為現(xiàn)代生命科學(xué)研究的重要支柱。通過(guò)合理選擇定量策略、嚴(yán)控實(shí)驗(yàn)流程并輔以zhuānyè的數(shù)據(jù)分析，研究者可以從海量蛋白數(shù)據(jù)中提取具有生物學(xué)意義的信息。百泰派克生物科技基于優(yōu)良的質(zhì)譜平臺(tái)，融合標(biāo)準(zhǔn)化樣本處理流程與成熟的生物信息分析策略，為客戶提供高通量、高覆蓋、高重復(fù)性的定量蛋白組分析服務(wù)。

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測(cè)序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測(cè)序系統(tǒng)對(duì)dànbáizhì序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測(cè)序分析服務(wù)，包括對(duì)dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對(duì)于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測(cè)序法的dànbáizhì從頭測(cè)序服務(wù)，對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測(cè)定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測(cè)定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測(cè)定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測(cè);

6.測(cè)序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測(cè)較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.技術(shù)優(yōu)良，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問(wèn)題?？稍趩渭?xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測(cè)51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測(cè)細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過(guò)我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測(cè)平臺(tái)

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測(cè)和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過(guò)CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù)；

2.獲國(guó)家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái)，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

基于質(zhì)譜的定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析：技術(shù)原理與應(yīng)用檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹