一、Zymo甲基化試劑盒核心技術(shù)特點(diǎn)
1. 高效亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化
-轉(zhuǎn)化率>99%:采用優(yōu)化的亞硫酸鹽處理體系(如EZ DNA Methylation-Gold™),確保未甲基化胞嘧啶全部轉(zhuǎn)化為尿嘧啶,甲基化位點(diǎn)保留完整。
- 快速處理:全程僅需3小時(shí)(Lightning系列)至6小時(shí)(Gold系列),比傳統(tǒng)方法縮短50%時(shí)間。
2. 廣泛樣本兼容性
- DNA類型:適用于基因組DNA(≥50 pg)、FFPE樣本(需預(yù)修復(fù))、cfDNA(≥1 ng)。
- 污染物耐受:可處理含10% SDS或1%血紅蛋白的樣本(需配合Zymo Clean & Concentrator純化)。
3. 高靈敏度與重復(fù)性
- 檢測(cè)下限:甲基化頻率 0.1%(如用于腫瘤早篩的ctDNA檢測(cè))。
- 批間差異:CV <5%(基于NIST標(biāo)準(zhǔn)品驗(yàn)證)。
二、Zymo甲基化試劑盒與主流產(chǎn)品線對(duì)比
三、Zymo甲基化試劑盒典型應(yīng)用場(chǎng)景
1. 腫瘤表觀遺傳研究
- 早篩標(biāo)志物驗(yàn)證:檢測(cè)ctDNA中 SEPT9、SHOX2 等基因甲基化(靈敏度95%)。
- 甲基化分型:基于850K芯片數(shù)據(jù)構(gòu)建TCGA樣甲基化亞型(如膠質(zhì)瘤IDH1突變關(guān)聯(lián))。
2. 發(fā)育生物學(xué)
- 單細(xì)胞甲基化分析:配合Zymo PicoMethyl™ 試劑盒,處理單細(xì)胞DNA(適用于10-100個(gè)細(xì)胞)。
3. 植物表觀遺傳學(xué)
- 環(huán)境脅迫響應(yīng):檢測(cè) CpG島 和 CHH位點(diǎn) 甲基化動(dòng)態(tài)(需配合BS-Seq分析)。
四、Zymo甲基化試劑盒操作流程優(yōu)化建議
1. DNA質(zhì)量控制
- 使用Nanodrop檢測(cè)A260/A280(1.8-2.0),A260/A230 >1.8。
- FFPE樣本需先進(jìn)行 脫蠟修復(fù)(推薦Zymo FFPE DNA Kit)。
2. 轉(zhuǎn)化條件優(yōu)化
- 高溫變性步驟:98℃ 8分鐘(Gold系列)→ 95℃ 30秒(Lightning系列)。
- 轉(zhuǎn)化后純化:使用Zymo-Spin IC Column去除亞硫酸鹽殘留(回收率>90%)。
3. 下游兼容性
- PCR擴(kuò)增:推薦使用ZymoTaq™ PreMix(抗尿嘧啶干擾,擴(kuò)增效率提升30%)。
- NGS建庫(kù):配合Methyl-Seq Library Kit(UMI標(biāo)記,降低擴(kuò)增偏差)。
五、Zymo甲基化試劑盒與競(jìng)品性能對(duì)比
六、Zymo甲基化試劑盒用戶反饋與解決方案
- 常見問(wèn)題:
1. 轉(zhuǎn)化后DNA片段化 → 縮短變性時(shí)間至5分鐘,使用低熔點(diǎn)瓊脂糖包埋。
2. PCR擴(kuò)增失敗 → 增加2-4個(gè)熱啟動(dòng)循環(huán)(98℃ 10秒→60℃ 30秒)。
3. 批次間差異 → 使用同一批次轉(zhuǎn)化柱,避免不同溫度環(huán)境操作。
- 技術(shù)支持:提供 免費(fèi)實(shí)驗(yàn)方案優(yōu)化服務(wù)(48小時(shí)內(nèi)響應(yīng))。
【總結(jié)】
Zymo甲基化試劑盒在轉(zhuǎn)化效率、速度、小樣本兼容性 方面表現(xiàn)很好,尤其適合腫瘤液體活檢和單細(xì)胞表觀遺傳研究。
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