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EUROSCARF 收集中心已建立，用于存放和交付基因組分析網(wǎng)絡(luò)中生成的生物材料。其中包括以下項(xiàng)目：BMBF（325 個(gè) ORF）、EUROFAN I（800 個(gè) ORF）和作為*酵母基因缺失項(xiàng)目（6000 個(gè) ORF）一部分的 EUROFAN II。當(dāng)可用時(shí)，含有缺失盒或互補(bǔ)基因的質(zhì)粒也有庫(kù)存。缺失菌株的遺傳背景因項(xiàng)目而異。在許多情況下，您可以選擇不同的遺傳背景。

德國(guó)酵母功能分析項(xiàng)目

在 BMBF（Bundesministerium für Bildung und Forschung）支持的德國(guó)酵母功能分析項(xiàng)目（1994-1997）期間，325 個(gè)基因已被刪除。 15 個(gè)實(shí)驗(yàn)室的合作致力于基因的缺失和缺失菌株的功能分析（Entian 等：Mol Gen Genet 262 (1999) 683-702）。所有缺失均在菌株 CEN.PK2 中完成。由于該項(xiàng)目的早期啟動(dòng)，大多數(shù)基因缺失是通過用營(yíng)養(yǎng)缺陷型標(biāo)記替換感興趣的基因來(lái)實(shí)現(xiàn)的。大約三分之一的缺失是通過 PCR 技術(shù)進(jìn)行的。出于這個(gè)原因，有多種轉(zhuǎn)化標(biāo)記可以用來(lái)替換基因。從這個(gè)項(xiàng)目 EUROSCARF 擁有交配類型和雜合二倍體菌株的單倍體菌株。只有雜合二倍體可用于必需基因。該項(xiàng)目貢獻(xiàn)的菌株可以通過登錄號(hào)中的前 B 后跟 4 位數(shù)字代碼和終端字母來(lái)識(shí)別。

EUROFAN I

除和初步分析六個(gè)基因 (sixpack)。 Wach 等人已經(jīng)制定了刪除策略。 (酵母 10 (1994) 1793-1808)。該策略基于 PCR 片段刪除相應(yīng)的開放閱讀框。缺失存在于三種不同的遺傳背景中。必須刪除 FY1679 背景中的所有開放閱讀框，與 S288C 同基因，S288C 是釀酒酵母基因組測(cè)序的來(lái)源。除了大多數(shù)基因的缺失之外，在 CEN.PK2 或 W303 中還產(chǎn)生了一組額外的缺失，以證明缺失盒是普遍使用的。在第一階段構(gòu)建的菌株通過登錄號(hào)中的 5 位數(shù)字代碼后跟對(duì)應(yīng)于菌株交配類型的終端字母來(lái)標(biāo)識(shí)。

根據(jù)EUROFAN I的指導(dǎo)方針，還收集了所有缺失質(zhì)粒。除此之外，對(duì)于大多數(shù)基因，還有用于互補(bǔ)缺失基因的質(zhì)粒。

*基因缺失項(xiàng)目（EUROFAN II）

在*范圍內(nèi)，歐洲和海外實(shí)驗(yàn)室聯(lián)合在 Saccharomyces 基因組缺失項(xiàng)目聯(lián)盟中（Winzeler 等人：Science 285 (1999) 901-906）。歐洲任務(wù)被標(biāo)記為 EUROFAN II。所有構(gòu)建的菌株將由 EUROSCARF 收集。缺失是在與 S288c（其 DNA 序列已確定的釀酒酵母菌株）同基因的遺傳背景中進(jìn)行的。 II期構(gòu)建的缺失菌株均在BY菌株系列的遺傳背景中。

這些菌株的 EUROSCARF 登錄號(hào)與 Saccharomyces 基因組刪除項(xiàng)目給出的記錄號(hào)僅通過前面的字母 Y 不同。