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都是薄膜过滤法，集菌仪做无菌结果要求无菌，微生物限度的话是可以有菌的，集菌仪上面放反复使用培养器的话是可以做纯化水微生物限度的。微生物限度检测仪是做微生物限度检测用的，就是一个密封的滤膜过滤装置，后取滤膜到平板培养基上进行培养，集菌仪也有密封滤膜过滤装置，过滤后可直接灌注培养基到滤膜背面，然后直接就可以培养了。

微生物限度检测装置采用不锈钢金属材料制成,将供试品注入微生物限度培养器内,通过检验仪自真空泵负压抽滤,将供试品中微生物截留在滤膜上,用取膜器取出滤膜,转移至配置好的固体培养基上,菌面朝上,平贴.盖上盖子形成封闭的培养盒,置相应的恒温培养处内培养并计数。