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深度測序和普通的二代測序有什么區(qū)別?有什么應用

閱讀:1750        發(fā)布時間:2020-10-23
  有兩種體細胞突變?nèi)菀妆缓鲆昩ai,一種是局限在特定組織的突變。舉例來說,如果突變只存在于大腦,而我們檢測的是血液,那就找不到這些致病突變。另一種致病性體細胞突變雖然發(fā)生在所有組織中,但是只影響一部分細胞,因此不容易被檢測到。
 
  普通的二代測序,全基因組或外顯子組測序是將DNA分成小片段,然后對各個片段多次讀取(一般是三十次)。然而,如果突變只發(fā)生在15-20%的細胞中,三十次讀取還不足以可靠地捕捉到它們,尤其是當突變只影響一個基因拷貝時。
 
  Walsh和博士后Saumya Jamuar通過“定向高覆蓋度測序”技術(shù),為158名腦部疾病的患者鑒定致病突變,這些患者的癥狀包括癲癇、智力障礙、語言障礙等。
 
  研究人員并沒有分析整個基因組或外顯子組(所有蛋白編碼基因),而是把注意力放在一系列已知或有嫌疑的基因上,并且大大提高了測序的深度。
 
  在一些疾病如唐氏綜合征中,嵌合突變相較于影響全身細胞的突變,產(chǎn)生的癥狀要輕一些。但是很少量的變異細胞就足以引發(fā)損害人身心健康的癥狀,在以往的研究中,為了從普通基因組中檢測到這些突變,研究人員就不得不增加測定的序列數(shù)量。而對少數(shù)候選基因區(qū)域進行的平均300次深度測序,就可以有效辨別被誤認為測序錯誤的突變。

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