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華南師范大學(xué)束文圣教授團(tuán)隊及其合作者揭示藍(lán)藻適應(yīng)不同環(huán)境的分子機制

閱讀:1377        發(fā)布時間:2020-9-29

近日,Nature旗下微生物生態(tài)學(xué)ding級期刊The ISME Journal(IF2019 = 9.18)在線發(fā)表了華南師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院生態(tài)科學(xué)研究所束文圣教授團(tuán)隊、中國科學(xué)院水生生物研究所宋立榮研究員課題組、暨南大學(xué)生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院韓博平教授課題組聯(lián)合研究題為“Comparative genomics reveals insights into cyanobacterial evolution and habitat adaptation”的研究論文。

藍(lán)藻是地球生物圈形成和環(huán)境塑造過程中起關(guān)鍵性作用的生物類群,是地球上重要的初級生產(chǎn)者。目前地球上已發(fā)現(xiàn)的藍(lán)藻多達(dá)兩千余種,類群廣泛分布于水生及陸生生態(tài)系統(tǒng),如海洋、河流、熱泉、稻田、沙漠極地等。然而,對于藍(lán)藻適應(yīng)不同環(huán)境的遺傳機制尚不清楚。束文圣教授團(tuán)隊及合作者利用650株藍(lán)藻菌株的基因組數(shù)據(jù)進(jìn)行遺傳進(jìn)化與比較分析來探究藍(lán)藻適應(yīng)海洋、淡水和陸地環(huán)境的遺傳機制。研究發(fā)現(xiàn):(1) 基因家族擴張是陸地藍(lán)藻適應(yīng)環(huán)境變化的普遍策略,而大多數(shù)海洋藍(lán)藻以基因家族收縮來適應(yīng)海洋環(huán)境的營養(yǎng)不足;(2) 鑒定得到數(shù)百種基因與特定環(huán)境顯著相關(guān),如光感應(yīng)、滲透壓調(diào)節(jié)和營養(yǎng)物質(zhì)運輸相關(guān)的基因在不同環(huán)境的藍(lán)藻基因組中豐度差異明顯,暗示這些基因在環(huán)境適應(yīng)過程中的重要功能;(3)水平基因轉(zhuǎn)移(HGT)是藍(lán)藻獲取適應(yīng)不同環(huán)境的功能基因的重要來源。本研究拓展了對藍(lán)藻基因組演化及其適應(yīng)不同環(huán)境的機制認(rèn)識。

華南師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院為該論文的di一完成單位和通訊單位。陳夢云博士為論文di作者,中國科學(xué)院水生生物研究所宋立榮研究員、暨南大學(xué)韓博平教授和束文圣教授為論文共同通訊作者。該研究得到國家自然科學(xué)基金重點項目和青年基金項目的資助。

 

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