因为COD的复杂性，自来水氧化消毒处理臭氧发生器主要发生在两个生物系统之间。这一过程的一个重要优点是不产生二次废物，正如用活性炭处理臭氧生物过程所取代。

除色：水为色，光被溶解物吸收，光被悬浮物反射。有色水主要分布在染料厂、纺织厂、食品厂、屠宰场等工业企业。许多行业已经开始使用臭氧，这是比氯更强、更安全的脱色方法。处理后水中BOD、COD、悬浮物（SS）值低时，主要用臭氧反应脱色，效果好?；Щ蛏镌ご砗?，废水中的臭氧氧化浓度在50~150毫克/升之间。颜色从90%减少到98%?；柩趿康氖淙爰跎僭?/font>45%（生化需氧量的值可能从5%增加到9%）。脱色效率取决于臭氧输入、输入色值、废水类型、温度和水质特征。低于30℃的温度为臭氧的溶解度提供了条件。臭氧设备的应用带来了巨大的资金投入，但其运行成本低于普通凝聚处理。除了化学处理的成本外，絮凝过程中产生的污泥还需要进一步处理和利用。一般来说，臭氧设备的投资可以根据设备的大小和其他规格在3~5年内回收。

改善混凝除浊：臭氧中溶解的有机极性和带电分子与多价铝和钙的反应。使用臭氧浓度在0.5pm以上的地表水，可降低浊度，改善沉淀性能，减少颗粒数。这种被称为臭氧预氧化的处理会破坏胶体的稳定性，减少透明过滤液产生所需的凝结量。臭氧能有效处理各种水处理问题。一般来说，臭氧处理水的问题越多，自来水氧化消毒处理臭氧发生器的成本越低，其它更常见的处理方法也是如此。