在自来水净化处理中，传统的标准净水系统（絮凝、沉淀和过滤系统）无法从符合水质标准的水厂供水。由于净水设施难以有效管理原水，因此需要额外的深水净化设备。自来水臭氧净化系统臭氧发生器的灭菌时间因型号和气味输出而异。臭氧发生器的消毒时间一般为25-40分钟。臭氧分子挥发时间太短，很难达到灭菌的目的。如果一个小时以上容易产生臭氧残留，需要开窗通风两个小时，使分子分散。方法之一是臭氧处理，但日本自来水国臭氧与有机物的反应产生副产物，所以臭氧不是单独使用，而是用于处理和活性炭的后期。在水的深度净化处理中，臭氧起着去除异味和色度的作用，其氧化能力比氯强得多，并能还原有机氯化合物等物质。臭氧作为一种水处理装置，在以下几个方面优于其他处理方法。具有良好的去除异味和颜色的效果。能去除薯蓣皂苷、2-MIB等的气味和色度。从腐殖质中，或去除因氯而产生气味的酚类。

自来水臭氧净化系统能提高有机物的生物降解性，使高分子材料分子量低，硫化物亲水，从而增加难降解有机物的生物降解性，提高颗粒活性炭的处理性能。用于自来水净水处理的臭氧发生器减少了对氯的需求。注氯前注入臭氧，可降低氯耗，对铁、锰有较强的氧化能力，可很好地满足净水需求。