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SILAC
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更新時間:2025-05-26 21:00:08

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細胞培養(yǎng)條件下穩(wěn)定同位素標記技術(shù)(Stable isotope labeling with amino acids in cell culture,SILAC),利用含輕、中或重型同位素標記的必需氨基酸(主要是Lys和Arg)培養(yǎng)基培養(yǎng)細胞,來標記細胞內(nèi)新合成的蛋白質(zhì),一般培養(yǎng)5-6代,細胞中的蛋白質(zhì)將都被同位素標記。

背景簡介:SILAC( Stable Isotope  Labeling with   Amino acids in  Cell culture)技術(shù)是依據(jù)細胞生長對必需氨基酸的依賴原理,利用穩(wěn)定同位素標記( 13C,15N,2H)的必需氨基酸對細胞蛋白質(zhì)組進行代謝標記的方法;13C,15N,2H是穩(wěn)定同位素,沒有放射性,因此可以在常規(guī)條件下進行試驗。

Arg(R)、Lys(K)、Leu(L)是SILAC常用的氨基酸。將(13C,15N,2H)等穩(wěn)定同位素標記的R、K、L加入細胞培養(yǎng)基中,在細胞進行蛋白質(zhì)合成時,這些穩(wěn)定同位素標記的氨基酸自然被“摻入”到蛋白質(zhì)中。通過>6代的細胞增殖,整個細胞的蛋白質(zhì)組會被穩(wěn)定同位素氨基酸”標記”;

SILAC“標記”了蛋白質(zhì)與“未標記”的蛋白質(zhì)(普通培養(yǎng)基培養(yǎng))存在數(shù)目的質(zhì)量差異,該質(zhì)量差異在后續(xù)LC-MS的上等質(zhì)譜( MSl)中呈現(xiàn)一對同位素質(zhì)譜峰,通過質(zhì)譜峰的信號強度能實現(xiàn)對2組樣品中每一個蛋白質(zhì)表達水平的相對定量,終能確定蛋白質(zhì)表達水平差異(差異蛋白質(zhì)組學分析)和區(qū)分特異性和非特異性相互作用(蛋白質(zhì)相互作用分析);同時通過二級質(zhì)譜( MS/MS,MS2)實現(xiàn)對樣品中蛋白質(zhì)的鑒定。

SILAC技術(shù)結(jié)合LC-MS能同時實現(xiàn)對2組樣品中蛋白質(zhì)的定性和定量分析。實驗技術(shù)“高、大、上“,通過定墨信息能直接反映出樣品之間的蛋白質(zhì)表達水平差異,便于快速找到感興趣的目標分子。同時,利用SILAC技術(shù),能明顯提高文章的檔次。

SILAC氨基酸對照表:

 

 

SILAC實驗設(shè)計:

 

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