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技術(shù)文章

ZooSCAN浮游動(dòng)物圖像掃描分析系統(tǒng)操作指南

閱讀:1006          發(fā)布時(shí)間:2020-2-26

ZooSCAN浮游動(dòng)物圖像掃描分析系統(tǒng)主要用于對(duì)液體中的浮游動(dòng)物樣品進(jìn)行計(jì)數(shù)、大小測(cè)量、種類鑒定以及生物量測(cè)定。

ZooSCAN系統(tǒng)是由ZooSCAN、ZooProcessEcoTaxa等共同組成的,ZooSCAN是硬件部分,主要進(jìn)行浮游動(dòng)物樣品掃描,形成數(shù)字圖像。ZooProcessEcoTaxa是軟件部分,分別以標(biāo)準(zhǔn)化的程序處理原始圖像、對(duì)不同個(gè)體的形態(tài)參數(shù)進(jìn)行自動(dòng)測(cè)量和對(duì)圖像中的浮游動(dòng)物進(jìn)行自動(dòng)分類和計(jì)數(shù)。

ZooSCAN工作流程

1)掃描空白背景;2)掃描樣品,獲得原始圖片和元數(shù)據(jù)信息;3)使用ZooProcess軟件,標(biāo)準(zhǔn)化原始圖片,提取并測(cè)量圖片中不同個(gè)體的形態(tài)參數(shù);4) 通過對(duì)形態(tài)學(xué)參數(shù)的提取與分析,可進(jìn)一步獲得樣品的粒徑組成、生物學(xué)體積等信息;5)通過EcoTaxa上面已建立的圖像培訓(xùn)數(shù)據(jù)庫,針對(duì)已掃描的樣品圖像進(jìn)行浮游動(dòng)物的自動(dòng)識(shí)別,獲得不同類群浮游動(dòng)物的數(shù)量。

具體操作流程:

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