免疫共沉淀（Co-Immunoprecipitation）是以抗體和抗原之間的專一性作用為基礎(chǔ)的用于研究蛋白質(zhì)相互作用的經(jīng)典方法。這是確定兩種蛋白質(zhì)在完整細胞內(nèi)生理性相互作用的有效方法。其原理是：當細胞在非變性條件下被裂解時，完整細胞內(nèi)存在的許多蛋白質(zhì)－蛋白質(zhì)間的相互作用就被保留了下來。假如用蛋白質(zhì)X的抗體免疫沉淀X，那么與X在體內(nèi)結(jié)合的蛋白質(zhì)Y也能沉淀下來。目前多用精制的proreinA預(yù)先結(jié)合固化在argarose的beads上，使之與含有抗原的溶液及抗體反應(yīng)后，beads上的proreinA就可以吸附抗原達到精制的目的。這樣的方法常用于測定兩種目標蛋白質(zhì)是否在體內(nèi)結(jié)合；也可用來確定一種特定蛋白質(zhì)的新的作用搭檔。

COIP免疫共沉淀的優(yōu)點

其優(yōu)點為：（1）相互作用的蛋白質(zhì)都是經(jīng)翻譯后修飾的，處于天然狀態(tài)；（2）蛋白的相互作用是在自然狀態(tài)下進行的，可以避免人為的影響；（3）可以分離得到天然狀態(tài)的相互作用蛋白復(fù)合物。缺點為：（1）可能檢測不到低親和力和瞬間的蛋白質(zhì)－蛋白質(zhì)相互作用；（2）兩種蛋白質(zhì)的結(jié)合可能不是直接結(jié)合，而可能有第三者在中間起橋梁作用；（3）必須在實驗前預(yù)測目的蛋白是什么，以選擇最后檢測的抗體，所以，若預(yù)測不正確，實驗就得不到結(jié)果，方法本身具有冒險性。

COIP免疫共沉淀注意事項

(1)細胞裂解采用溫和的裂解條件，不能破壞細胞內(nèi)存在的所有蛋白質(zhì)一蛋白質(zhì)相互作用，

多采用非離子變性劑(NP40 或Triton X-100)。 每種細胞的裂解條件是不一-樣的，通過經(jīng)驗確定。不能用高濃度的變性劑(0.2%SDS)， 細胞裂解液中要加各種酶抑制劑，如商品化的

cocktailer。

(2)確保共沉淀的蛋白是由所加入的抗體沉淀得到的，而并非外源非特異蛋白，單克隆抗

體的使用有助于避免污染的發(fā)生;.

(3)要確保抗體的特異性，即在不表達抗原的細胞溶解物中添加抗體后不會引起共沉淀;

(4)確定蛋白間的相互作用是發(fā)生在細胞中，而不是由于細胞的溶解才發(fā)生的，這需要進

行蛋白質(zhì)的定位來確定。