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分析仪在测量总有机碳 (Total Organic Carbon，TOC) 时，都必须处理无机碳 (Inorganic Carbon，IC)。IC是指CO2、HCO3-、CO32-里的碳。IC的来源包括溶解的石灰石和从空气中吸收的二氧化碳。几乎所有的样品水中都含有有机碳和无机碳，它们统称为总碳 (Total Carbon，TC)。

总碳（TC）= 有机碳（TOC）+ 无机碳（IC）

当样品中也含有无机碳时，分析仪就无法单独测量有机碳，因此大多数TOC分析仪就测量样品中的TC和IC，然后相减，差值即为TOC。

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