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中国科学院南京分院是中国科学院的派出机构，负责联络和协调中国科学院在苏赣两省的研究所，协助做好各单位领导干部队伍建设，指导党建、纪检和监察工作，负责苏赣两省的院地合作和中科院院士联络。1950年中国科学院接管原中央研究院在南京的科研单位，成立中国科学院华东办事处。1978年11月，经国务院批准建立中国科学院南京分院。
资源环境领域有：南京地质古生物研究所、南京土壤研究所、南京地理与湖泊研究所3家单位，所需科学研究资料，竞标挑选。在竞标中南京华威测绘仪器有限公司为南京地理与湖泊研究所提供天宝高精度GIS采集设备，用于林业、农业、湖泊等野外数据采集，内业用相应的处理软件加以分析，为科学研究提供第一手资料。
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