單細(xì)胞測序是一種高效的檢測技術(shù)
閱讀:568 發(fā)布時間:2021-3-17
單細(xì)胞測序技術(shù)又稱“下一代“測序技術(shù)或深度測序技術(shù),可以一次性對幾十萬至幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測定,現(xiàn)已廣泛應(yīng)用在基因組測序、基因表達(dá)分析、非編碼小分子RNA鑒定、轉(zhuǎn)錄因子靶基因篩選及DNA甲基化等相關(guān)的研究領(lǐng)域。
測序技術(shù)的突出優(yōu)點(diǎn)是可以從細(xì)胞圖譜的角度,探測細(xì)胞特異性以及細(xì)胞間的差異,探索細(xì)胞間的協(xié)同運(yùn)作方式,研究組織異質(zhì)性問題,根據(jù)細(xì)胞層面的特征對疾病進(jìn)行深度刻畫,能有效地解決組織樣本無法破解的細(xì)胞異質(zhì)性難題,有助于發(fā)現(xiàn)新的細(xì)胞類型。
基于大量的單細(xì)胞基因表達(dá)數(shù)據(jù),該平臺還可進(jìn)行細(xì)胞表達(dá)特征聚類、亞群表達(dá)特征、標(biāo)志物篩選等方面的分析,是一種高效的細(xì)胞基因表達(dá)水平的檢測技術(shù),在發(fā)育與生殖、免疫、干細(xì)胞分化、腫瘤異質(zhì)性、神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育以及腦發(fā)育等研究領(lǐng)域中有著廣泛的應(yīng)用。
單細(xì)胞測序能為單細(xì)胞中每個轉(zhuǎn)錄本標(biāo)記特異性分子標(biāo)簽,實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞水平上基因表達(dá)譜的定量。同時,每個細(xì)胞也會被標(biāo)記特異性細(xì)胞標(biāo)簽,使得高通量平行建庫成為可能。結(jié)合單細(xì)胞分離技術(shù),單次實(shí)驗(yàn)可制備100-10000個單細(xì)胞文庫,用戶可根據(jù)需求定制引物,將檢測范圍集中在目標(biāo)基因,大幅降低后續(xù)測序成本。
測序的工作流程包括4個關(guān)鍵步驟:1) 單細(xì)胞制備,2)單細(xì)胞分離和文庫制備,3)測序和初級分析,4)數(shù)據(jù)可視化與解讀。在整個工作流程中,有一些影響結(jié)果并決定研究能否成功的實(shí)驗(yàn)注意事項(xiàng)和關(guān)鍵步驟。想要獲得準(zhǔn)確的數(shù)據(jù),得出有意義的結(jié)論,需要精心設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn),并按要求開展實(shí)驗(yàn)。
在上述步驟中,單細(xì)胞分離的過程往往會對單細(xì)胞測序的最終結(jié)果產(chǎn)生重大影響。單細(xì)胞分離過程太長或者分離時對細(xì)胞的損傷太大,都會導(dǎo)致細(xì)胞最終的活性狀態(tài)受到較大影響?;钚暂^差的細(xì)胞在后續(xù)的單細(xì)胞測序中,很難獲得較好的數(shù)據(jù)結(jié)果。
Namocell為單細(xì)胞測序提供了更好的單細(xì)胞分離解決方案。它能幫助用戶快速、高效、輕柔地分選單個目的細(xì)胞。儀器配備的散射光和熒光檢測系統(tǒng),可以精確識別用戶感興趣的目的細(xì)胞,減少后續(xù)其他細(xì)胞的數(shù)據(jù)干擾;快速分選單細(xì)胞,最快完成一塊96孔板的分選時間不到1min;系統(tǒng)內(nèi)部壓力不到2psi,分離過程輕柔,減少細(xì)胞在分選過程中的損傷,保證細(xì)胞活性。