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轉(zhuǎn)化細(xì)胞的代謝過程

閱讀:216          發(fā)布時(shí)間:2018-3-28

轉(zhuǎn)化細(xì)胞分別描述基因的分子功能、參與的生物過程和所處的細(xì)胞位置。分子功能分析結(jié)果顯示:與PRRSV nsp11互作的宿主細(xì)胞蛋白具有結(jié)合能力和酶活性;生物過程分析結(jié)果顯示:與nsp11互作的宿主細(xì)胞蛋白主要參與細(xì)胞的代謝過程,蛋白質(zhì)的轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)錄后修飾、翻譯、運(yùn)輸過程、信號轉(zhuǎn)導(dǎo),RNA的代謝過程等;細(xì)胞位置分析結(jié)果顯示:與nsp11互作的宿主細(xì)胞蛋白主要分布于細(xì)胞質(zhì)、細(xì)胞膜、細(xì)胞核以及大分子復(fù)合體等部位。
COG (Clusters of Orthologous Groups of proteins)注釋: 對鑒定出的201個(gè)與PRRSV nsp11相互作用的宿主細(xì)胞蛋白進(jìn)行COG注釋,通過比對分析,預(yù)測這些蛋白可能發(fā)揮的功能,并對其功能進(jìn)行分類統(tǒng)計(jì)。結(jié)果顯示:與PRRSV nsp11互作的宿主細(xì)胞蛋白主要功能與蛋白質(zhì)的翻譯和修飾、RNA的加工和修飾以及信號轉(zhuǎn)導(dǎo)等密切相關(guān)。
KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)代謝通路注釋: KEGG是一個(gè)整合了基因組、化學(xué)和系統(tǒng)功能信息的數(shù)據(jù)庫。轉(zhuǎn)化細(xì)胞為了確定與PRRSV nsp11互作的宿主細(xì)胞蛋白所參與的主要生化過程和代謝通路,本研究利用KEGG數(shù)據(jù)庫對鑒定出的201個(gè)宿主細(xì)胞蛋白進(jìn)行pathway分類分析。結(jié)果顯示:與nsp11互作的宿主細(xì)胞蛋白主要參與核糖體代謝、碳代謝、剪切體代謝、氨基酸的生物合成以及病原的致病性等代謝通路。
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轉(zhuǎn)化細(xì)胞 

 

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