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ELISA實戰(zhàn)案例分享——數(shù)據(jù)處理

閱讀:2994      發(fā)布時間:2020-4-27
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之前的幾期課堂講座給大家分享了ELISA實驗的原理,操作步驟以及實驗中的常見問題(感興趣的小伙伴可以去視頻專區(qū)收看),近期又收到部分小伙伴的反饋問題,主要集中在數(shù)據(jù)處理上。小編看了也覺得比較可惜,整個ELISA實驗做得不錯,可惜在后的數(shù)據(jù)處理上犯了錯誤,直接導(dǎo)致實驗結(jié)果出了大問題,可謂功虧一簣。接下跟著小編進(jìn)行一次實戰(zhàn)案例的分析,詳細(xì)了解一下愛必信ELISA試劑盒的數(shù)據(jù)處理過程吧~


話不多說,先上圖:

圖一. 客戶提供原始OD值圖(涉及未發(fā)表數(shù)據(jù),部分隱去,部分略作處理)

圖二. 客戶處理的標(biāo)準(zhǔn)曲線圖
 

客戶反饋,部分?jǐn)?shù)據(jù)OD出現(xiàn)負(fù)值,無法處理,覺得試劑盒有問題。小編接到這個case之后,簡單的看了一下客戶的數(shù)據(jù),就發(fā)現(xiàn)幾個明顯的數(shù)據(jù)處理問題,而根據(jù)客戶的原始OD數(shù)據(jù),初步判斷,試劑盒是正常的,并且實驗數(shù)據(jù)還比較可靠。不知道是否有聰明的小伙伴已經(jīng)從這個數(shù)據(jù)中發(fā)現(xiàn)了問題呢?沒關(guān)系,跟著小編一起來抽絲剝繭的詳細(xì)分析一下吧~
 

1. OD值出現(xiàn)負(fù)值

大量樣品孔的讀值為負(fù)數(shù),但接近零點(diǎn),小編看了一下客戶標(biāo)曲的0點(diǎn)OD值接近0,初步判斷客戶是用空白孔進(jìn)行校準(zhǔn),但空白孔由于操作污染等原因,OD值偏高,進(jìn)而導(dǎo)致樣品孔OD值為負(fù)。跟客戶溝通之后,確實是進(jìn)行了空白孔校準(zhǔn)。

溝通之后,確認(rèn)原始空白孔讀值為0.0962,明顯偏高,正常OD450的空白孔讀值應(yīng)為0.06左右。

在這里,小編建議有條件的小伙伴,盡量要用我們推薦的雙波長校正法,使用570或630nm波長進(jìn)行校正,OD450 - OD570/630即為校正后的OD值,可直接用于計算,也可根據(jù)數(shù)據(jù)質(zhì)量,再進(jìn)行空白校正。如沒有雙波長的酶標(biāo)儀,讀取OD450數(shù)據(jù)后,應(yīng)先判斷數(shù)據(jù)質(zhì)量,再進(jìn)行空白校正。
 

小編將空白校正進(jìn)行補(bǔ)回,得到的OD450原始數(shù)據(jù)如下:至此,樣品孔數(shù)據(jù)出現(xiàn)負(fù)值這一問題解決。

圖三. 經(jīng)還原處理的OD450原始數(shù)據(jù)圖


2. 標(biāo)曲擬合問題

處理完了負(fù)值問題,還有一個很明顯的問題就是,客戶的標(biāo)曲擬合問題。我們這款試劑盒(Mouse TNF alpha ELISA Kit,abs520010)標(biāo)曲高點(diǎn)是2000 pg/ml,客戶給我的截圖(圖二)只到250 pg/ml,再仔細(xì)研究一下,發(fā)現(xiàn)客戶的擬合方式用的竟然是直線擬合。跟客戶溝通之后,確認(rèn)原因,客戶選擇直線擬合,高點(diǎn)不符合擬合方式,R2值過低,所以客戶自己把上面高濃度的點(diǎn)去掉了,只選取到250 pg/ml,進(jìn)行直線擬合。在這里,小編強(qiáng)調(diào)一下, 愛必信ELISA試劑盒推薦擬合方式為四參數(shù)擬合,四參數(shù)擬合,四參數(shù)擬合,重要的事情說三遍。不要再用其他稀奇古怪的擬合方式進(jìn)行擬合啦。就像這個客戶犯的錯誤,雖然看似250 pg/ml以下的點(diǎn)可以用直線擬合,但是表達(dá)含量較高的樣品,OD值高時,就不符合他擬合的這條直線了,會導(dǎo)致結(jié)果出現(xiàn)嚴(yán)重偏差。由于0孔出現(xiàn)問題,小編在擬合標(biāo)曲時,將OD值低的孔作為空白孔,TNF-α在正常樣品中表達(dá)含量極低,可視為0,擬合曲線如下:

圖四. 四參數(shù)擬合的曲線圖及方程
 

回歸計算之后得到樣品濃度,部分無法計算出的樣品孔,表達(dá)含量低于0點(diǎn),按0計算即可。

本期ELISA實戰(zhàn)案例解析就到這里了,希望對各位小伙伴們有所幫助。大家在平時的實驗中遇到什么問題也可以聯(lián)系我們,小編匯總之后,盡力為大家解答~


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