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Paxgene采集管在妊娠期間細胞動態(tài)的檢測中的應(yīng)用
閱讀：888發(fā)布時間：2023-10-27
人類血液是分子信息的豐富來源，可用于開發(fā)特定腫瘤和器官（例如胎盤）的非侵入性液體活檢，以預(yù)測疾病、其進展和對治療的反應(yīng)。近年來，隨著微陣列和RNA測序（RNA-Seq）等技術(shù)的普及，全基因組轉(zhuǎn)錄組分析被應(yīng)用于發(fā)現(xiàn)分子標(biāo)記，這些技術(shù)允許同時測量數(shù)以萬計的蛋白質(zhì)編碼和非蛋白質(zhì)。開發(fā)血液轉(zhuǎn)錄組標(biāo)記物以監(jiān)測整個懷孕期間的胎盤功能和產(chǎn)科并發(fā)癥的風(fēng)險需要準確量化基因表達。
來自美國韋恩大學(xué)醫(yī)學(xué)院和密歇根州立大學(xué)的研究團隊在Nature子刊Scientific Reports發(fā)表了題為“Targeted expression profiling by RNA - Seq improves detection of cellular dynamics during pregnancy and identifies a role for T cells in term parturition"的文章，比較了在外顯子水平探測轉(zhuǎn)錄組的Affymetrix人類轉(zhuǎn)錄組陣列（HTA 2.0）、具有珠蛋白還原的配對末端Illumina RNA-Seq以及一種新型全基因組靶向表達分析技術(shù) DriverMap，評估了這些方法在母體全血中定量源自胎盤單細胞基因組的細胞類型特異性特征表達的能力，并確定了這些特征是否能表明足月分娩。
由于器官和/或細胞類型特異性轉(zhuǎn)錄本在全血中低表達，因此RNA的完整性、穩(wěn)定性和RNA的豐度定量對下游實驗至關(guān)重要。本研究中使用的血液RNA采血管是PAXgene全血RNA管（BD，762165），該管中含有穩(wěn)定添加劑，可長時間維持細胞 RNA 完整性。
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