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醫(yī)療機(jī)構(gòu)高通量基因測序?qū)嶒?yàn)室設(shè)計(jì)布局建設(shè)
高通量測序檢測實(shí)驗(yàn)室也叫NGS實(shí)驗(yàn)室,是以高通量測序技術(shù)為檢測手段,來完成臨床疾病篩查、診斷或輔助診斷、腫瘤基因突變檢測等項(xiàng)目。
由于NGS技術(shù)對所檢測的核酸模板進(jìn)行大量擴(kuò)增,容易出現(xiàn)實(shí)驗(yàn)室污染導(dǎo)致檢測結(jié)果不準(zhǔn)確;且NGS實(shí)驗(yàn)要求高、影響因素多,實(shí)驗(yàn)過程處理不當(dāng)也會導(dǎo)致檢測結(jié)果異常。因此一個(gè)嚴(yán)格有序、規(guī)范的NGS實(shí)驗(yàn)室是非常必要的。
醫(yī)療機(jī)構(gòu)高通量基因測序?qū)嶒?yàn)室設(shè)計(jì)布局建設(shè)
高通量測序?qū)嶒?yàn)室設(shè)計(jì)要求
按照衛(wèi)計(jì)委《臨床基因擴(kuò)增檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室工作規(guī)范》的要求,原則上臨床基因擴(kuò)增檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室應(yīng)當(dāng)設(shè)置以下區(qū)域:試劑儲存和準(zhǔn)備區(qū)、標(biāo)本制備區(qū)、擴(kuò)增區(qū)、擴(kuò)增產(chǎn)物分析區(qū)。這4個(gè)區(qū)域在物理空間上必須是相互獨(dú)立的,各區(qū)域無論是在空間上還是在使用中,應(yīng)當(dāng)始終處于分隔狀態(tài),不能有空氣的直接相通。根據(jù)使用儀器的功能,區(qū)域可適當(dāng)合并。例如使用實(shí)時(shí)熒光PCR儀,擴(kuò)增區(qū)、擴(kuò)增產(chǎn)物分析區(qū)可合并;采用樣本處理、核酸提取及擴(kuò)增檢測為一體的自動化分析儀,則標(biāo)本制備區(qū)、擴(kuò)增區(qū)、擴(kuò)增產(chǎn)物分析區(qū)可合并。
臨床基因擴(kuò)增檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室的空氣流向可按照試劑儲存和準(zhǔn)備區(qū)→標(biāo)本制備區(qū)→擴(kuò)增區(qū)→擴(kuò)增產(chǎn)物分析區(qū)進(jìn)行,防止擴(kuò)增產(chǎn)物順空氣氣流進(jìn)入擴(kuò)增前的區(qū)域??砂凑諒脑噭﹥Υ婧蜏?zhǔn)備區(qū)→標(biāo)本制備區(qū)→擴(kuò)增區(qū)→擴(kuò)增產(chǎn)物分析區(qū)方向空氣壓力遞減的方式進(jìn)行??赏ㄟ^安裝排風(fēng)扇、負(fù)壓排風(fēng)裝置或其他可行的方式實(shí)現(xiàn)。如果條件允許,建議將NextSeq CN500測序儀所在的測序室工作溫度控制在18-22℃,濕度控制在65%以下。
高通量測序?qū)嶒?yàn)室的強(qiáng)電、弱電需求
弱電:
建議每個(gè)房間預(yù)留1網(wǎng)絡(luò)端口、1電話端口。并為高通量測序?qū)嶒?yàn)室配備獨(dú)享8M以上的網(wǎng)絡(luò)。
強(qiáng)電:
用電器分布大致如下:
試劑準(zhǔn)備間:冰箱、冰柜等;總功率≤5kw
樣本制備間:高速離心機(jī)、低速離心機(jī)、垂直混勻儀等;總功率≤10kw
擴(kuò)增間:PCR儀、熒光定量PCR儀等;總功率≤5kw
測序間:UPS電源(測序儀、服務(wù)器都與UPS電源連接);UPS接入功率6KW
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