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超声波细胞破碎仪工作原理基于超声波在液体中的空化作用，换能器将电能量通过变幅杆在工具头顶部液体中产生高强度剪切力，形成高频的交变水压强，使空腔膨胀、爆炸将细胞击碎。另一方面由于超声波在液体中传播时产生剧烈地扰动作用，使颗粒产生很大的加速度，从而互相碰撞或与器壁互相碰撞而击碎。
以往所采用的仪器与方法进行采样，样本处理时间为10分钟，而使用D1000高效组织细胞破碎仪进行样本处理只需要30秒。除了缩短样本处理时间外，样品活性及得率也提高了数十倍以上。样本处理量从原来的每次100个，大幅提高到现在的每次1200个。同时，样本的生物安全性也得到了很大的提高和保证。
广泛应用在生物化学、医学制药、食品检测、环保监测等领域的破碎动植物组织、病毒、细菌和其它细胞结构以及在乳化、分离、均质等化学反应过程中。
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