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上海源葉生物科技有限公司
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罕見病診斷的新思路
2015-4-11 閱讀(311)
罕見病的診斷和治療一直都是難題，而測(cè)序技術(shù)的出現(xiàn)則帶來了一絲曙光。一般來說，患者出現(xiàn)一些癥狀后，通常先看醫(yī)生，然后開展外顯子組測(cè)序，并借助研究人員，找到分子機(jī)制。然而，根據(jù)《美國醫(yī)學(xué)會(huì)雜志》（JAMA）上的一篇文章，這個(gè)順序現(xiàn)在反過來了。
文章講述了一個(gè)荷蘭男孩的故事。他叫Vincent Pieterse，出生在2002年底。在嬰兒時(shí)期，他似乎很健康，不過隨著他漸漸長(zhǎng)大，出現(xiàn)了學(xué)習(xí)障礙、輕微自閉癥、肌張力低下等癥狀，這表明他可能患有遺傳綜合征。不過，神經(jīng)系統(tǒng)疾病和染色體異常的檢測(cè)結(jié)果均為陰性，而家族中也沒有親戚有相同的癥狀。
在*莫展之時(shí)，他的父親Marc了解到外顯子組測(cè)序，并意識(shí)到這種方法能提供許多基因的信息。于是，他找到了荷蘭內(nèi)梅亨大學(xué)的Joris Veltman博士。在他的堅(jiān)持下，Veltman博士同意對(duì)Vincent及其父母進(jìn)行外顯子組測(cè)序。
測(cè)序發(fā)現(xiàn)Vincent編碼核糖體蛋白的基因上有一個(gè)de novo突變，但沒有數(shù)據(jù)表明這個(gè)突變?nèi)绾沃虏 arc查看了文獻(xiàn)，發(fā)現(xiàn)一種Diamond-Blackfan貧血（DBA）的癥狀與Vincent有些相似，不過Vincent并沒有貧血，他的突變也從未與DBA相關(guān)聯(lián)。
于是，Marc了這篇文章的作者 – 美國施耐德兒童醫(yī)院的Jeffrey Lipton博士。2014年秋季，研究人員確認(rèn)Vincent的RNA加工是正常的。不過Marc確認(rèn)他的兒子患有DBA，于是他給十幾名研究這種疾病的研究人員發(fā)了郵件，包括荷蘭Sanger Research and Landsteiner Laboratory的Alyson MacInnes博士。
Alyson談道：“之前是患者拿著一系列特征來到診所，進(jìn)行診斷，開展外顯子組測(cè)序，然后借助研究人員找到分子機(jī)制，而如今正相反?；颊吣弥怙@子組數(shù)據(jù)，研究人員，推測(cè)疾病的機(jī)制，再聯(lián)合醫(yī)生進(jìn)行診斷。"
與其他的DBA病例不同，Vincent的核糖體未發(fā)現(xiàn)異常，因此他的父親懷疑兒子患有一種新穎但相關(guān)的疾病ribosomopathy。在征得醫(yī)生的同意后，Marc將Vincent的亮氨酸送去檢測(cè)。對(duì)于Vincent這樣的病例，外顯子組測(cè)序能幫助醫(yī)生診斷，或至少指明正確的方向。
在JAMA的這篇文章中，作者Ricki Lewis 談到了外顯子組測(cè)序的崛起。如今，大約有幾萬人已經(jīng)進(jìn)行了外顯子組測(cè)序，不過通過它來診斷疾病的比例不是太高。根據(jù)加州大學(xué)洛杉磯分校的研究，在一個(gè)814名患者的隊(duì)列中，診斷率為25%。不過，隨著人類基因組的注釋逐步完善，這個(gè)比例有望提高。
此外，外顯子和基因組測(cè)序已進(jìn)入預(yù)防醫(yī)學(xué)領(lǐng)域。專家正在討論，用外顯子組和基因組測(cè)序來取代目前的新生兒篩查檢測(cè)，是否可行。有人預(yù)測(cè)，在未來5到10年，新生兒的基因組測(cè)序?qū)⒆兊贸Ｒ?guī)。
