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多肽組裝中序列效應研究獲新進展
最近更新時間:2013-3-19
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多肽組裝中序列效應研究獲新進展
來自國家納米科學中心的研究人員利用STM技術在單分子水平上研究多肽的組裝及其調控,已經發(fā)表了一系列的工作。他們在2011年利用STM確認了淀粉樣多肽組裝和聚集的核心片段及折疊位點,對于研究非結晶蛋白的組裝結構提供了一種新穎的解析方法(Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2011, 108, 19605等),但是由于多肽在表面組裝構象的多樣性以及吸附穩(wěn)定性的差異,利用STM進行多肽中氨基酸序列的識別仍具有極大的挑戰(zhàn)性。
在本研究中,研究人員利用STM結合分子動力學模擬,研究了氨基酸殘基序列對嵌段模型多肽在固體表面的吸附構象穩(wěn)定性的影響,發(fā)現(xiàn)STM圖像中的襯度差異與模型多肽中的序列具有關聯(lián)性,同時分子動力學模擬發(fā)現(xiàn)不同氨基酸殘基與石墨表面的結合能差異與襯度差異也具有一致性,說明了多肽序列對組裝構象和組裝特性的影響,暗示了利用STM進行多肽序列識別的可能性。此研究有助于深入理解多肽組裝過程中側基結構、序列等對組裝過程、組裝驅動力以及組裝結構的影響。