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中級(jí)會(huì)員 | 第16年

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單核苷酸多態(tài)性

時(shí)間:2013-8-20閱讀:727
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SNP 有的人吸煙喝酒卻長(zhǎng)壽,也有人自幼就病痛纏身;同一種治療腫瘤的藥物對(duì)一些人非常有效,對(duì)另一些人則*無(wú)效。這是為什么?答案是他們基因組中存在的差異。這種差異很多表現(xiàn)為單個(gè)堿基上的變異,也就是單核苷酸的多態(tài)性(SNP)。
單核苷酸多態(tài)性(SNP)
全稱Single Nucleotide Polymorphisms,是指在基因組上單個(gè)核苷酸的變異,包括置換、顛換、缺失和插入。從理論上來(lái)看每一個(gè)SNP 位點(diǎn)都可以有4 種不同的變異形式,但實(shí)際上發(fā)生的只有兩種,即轉(zhuǎn)換和顛換,二者之比為2 :1。SNP 在CG序列上出現(xiàn)zui為頻繁,而且多是C轉(zhuǎn)換為T ,原因是CG中的C 常為甲基化的,自發(fā)地脫氨后即成為胸腺嘧啶。一般而言,SNP 是指變異頻率大于1 %的單核苷酸變異。在人類基因組中大概每1000 個(gè)堿基就有一個(gè)SNP ,人類基因組上的SNP 總量大概是3 ×106 個(gè) 。
因此,SNP成為第三代遺傳標(biāo)志,人體許多表型差異、對(duì)藥物或疾病的易感性等等都可能與SNP有關(guān)。
現(xiàn)在普遍認(rèn)為SNP研究是人類基因組計(jì)劃走向應(yīng)用的重要步驟。這主要是因?yàn)镾NP將提供一個(gè)強(qiáng)有力的工具,用于高危群體的發(fā)現(xiàn)、疾病相關(guān)基因的鑒定、藥物的設(shè)計(jì)和測(cè)試以及生物學(xué)的基礎(chǔ)研究等。SNP在基因組中分布相當(dāng)廣泛,近來(lái)的研究表明在人類基因組中每300堿基對(duì)就出現(xiàn)一次。大量存在的SNP位點(diǎn),使人們有機(jī)會(huì)發(fā)現(xiàn)與各種疾病,包括腫瘤相關(guān)的基因組突變;從實(shí)驗(yàn)操作來(lái)看,通過(guò)SNP發(fā)現(xiàn)疾病相關(guān)基因突變要比通過(guò)家系來(lái)得容易;有些SNP并不直接導(dǎo)致疾病基因的表達(dá),但由于它與某些疾病基因相鄰,而成為重要的標(biāo)記。SNP在基礎(chǔ)研究中也發(fā)揮了巨大的作用,近年來(lái)對(duì)Y染色體SNP的分析,使得在人類進(jìn)化、人類種群的演化和遷徙領(lǐng)域取得了一系列重要成果。

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