通過(guò)串聯(lián)質(zhì)譜法進(jìn)行肽從頭測(cè)序檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

在dànbáizhì組學(xué)研究中，基于數(shù)據(jù)庫(kù)的質(zhì)譜數(shù)據(jù)分析（Database Search）已成為主流。然而，隨著科研深入非模式物種、天然產(chǎn)物、抗體工程、新肽藥物等前沿領(lǐng)域，數(shù)據(jù)庫(kù)本身的缺失或不完整，限制了傳統(tǒng)方法的有效性。這時(shí)，一種不依賴數(shù)據(jù)庫(kù)、直接從質(zhì)譜數(shù)據(jù)中還原肽段氨基酸序列的方法——肽從頭測(cè)序（De novo peptide sequencing）顯得尤為關(guān)鍵。肽從頭測(cè)序的核心在于高質(zhì)量的串聯(lián)質(zhì)譜（MS/MS）數(shù)據(jù)采集與解讀。本文將圍繞“如何通過(guò)串聯(lián)質(zhì)譜進(jìn)行肽從頭測(cè)序"這一主題，深入探討相關(guān)技術(shù)原理及應(yīng)用場(chǎng)景等。

一、什么是肽從頭測(cè)序？為什么要用MS/MS？

肽從頭測(cè)序（De novo peptide sequencing）指在無(wú)數(shù)據(jù)庫(kù)依賴的前提下，通過(guò)分析肽段的MS/MS碎裂譜圖，逐個(gè)推斷氨基酸組成及其排列順序。這一過(guò)程wánquán基于質(zhì)譜數(shù)據(jù)中b離子與y離子系列的質(zhì)量差異。

而實(shí)現(xiàn)這一目標(biāo)的基礎(chǔ)，是高分辨率、高靈敏度的串聯(lián)質(zhì)譜技術(shù)（MS/MS）。通過(guò)對(duì)預(yù)先選擇的肽離子進(jìn)行碎裂并分析其產(chǎn)物離子，可以獲得高度特異性的片段信息，是目前進(jìn)行從頭測(cè)序zuì可靠的實(shí)驗(yàn)方式。

二、串聯(lián)質(zhì)譜法的原理與步驟

1、肽段獲得與離子化

樣本經(jīng)蛋白酶（如yídànbáiméi、LysC等）酶切后，得到短肽段，進(jìn)入質(zhì)譜進(jìn)行電噴霧離子化（ESI），轉(zhuǎn)化為帶電粒子。

2、一級(jí)質(zhì)譜篩選（MS1）

MS1用于檢測(cè)所有帶電肽段的質(zhì)量/電荷比（m/z），選擇目標(biāo)肽段進(jìn)入下一步碎裂分析。

3、碎裂與二級(jí)質(zhì)譜采集（MS/MS）

目標(biāo)肽段經(jīng)碰撞誘導(dǎo)解離（CID）、高能碰撞解離（HCD）或電子轉(zhuǎn)移解離（ETD）等方式碎裂，產(chǎn)生一系列b離子與y離子。這些碎片離子的m/z構(gòu)成了“碎裂圖譜"，是肽從頭測(cè)序的基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。

4、譜圖解釋與序列重建

利用算法對(duì)碎片譜圖進(jìn)行分析，根據(jù)相鄰離子的m/z差值推斷每個(gè)氨基酸，逐步構(gòu)建出完整肽段序列。

三、串聯(lián)質(zhì)譜在肽從頭測(cè)序中的優(yōu)勢(shì)

1、高通量：一次進(jìn)樣即可分析上千個(gè)肽段，適合復(fù)雜樣品。

2、高特異性：碎裂圖譜具有結(jié)構(gòu)特異性，適用于結(jié)構(gòu)未知的肽段。

3、兼容多種修飾：可識(shí)別磷酸化、乙?；?、氧化等翻譯后修飾（PTMs）。

4、支持低豐度分析：借助高靈敏儀器（如Orbitrap、timsTOF Pro），可解析低豐度信號(hào)。

四、典型應(yīng)用場(chǎng)景：從基礎(chǔ)研究到藥物開(kāi)發(fā)

1、單克隆抗體序列測(cè)定

許多雜交瘤細(xì)胞產(chǎn)生的抗體并無(wú)已知序列，從頭測(cè)序可用于解析輕鏈與重鏈CDR區(qū)域，為抗體人源化、藥物設(shè)計(jì)提供參考。

2、天然活性肽鑒定

在抗菌肽、神經(jīng)肽、植物防御肽等研究中，從頭測(cè)序有助于發(fā)現(xiàn)新型天然多肽藥物候選物。

3、非模式物種研究

對(duì)植物、昆蟲(chóng)、海洋生物等無(wú)完整蛋白數(shù)據(jù)庫(kù)的樣本，從頭測(cè)序是wéiyī的dànbáizhì序列還原手段。

4、新翻譯肽段發(fā)現(xiàn)（sORF）

從頭測(cè)序結(jié)合轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，可發(fā)現(xiàn)傳統(tǒng)注釋未涵蓋的短肽編碼區(qū)，推動(dòng)新機(jī)制研究。

百泰派克生物科技基于多年的dànbáizhì組平臺(tái)建設(shè)，已建立高通量、可驗(yàn)證、面向產(chǎn)業(yè)化的肽從頭測(cè)序解決方案，具體優(yōu)勢(shì)包括：

（1）gāoduān儀器平臺(tái)：配備Orbitrap Eclipse、timsTOF Pro 2等zuì新設(shè)備，確保高質(zhì)量MS/MS數(shù)據(jù)采集；

（2）智能化算法整合：引入DeepNovo、PEAKS與自研深度學(xué)習(xí)模型，提升識(shí)別準(zhǔn)確率；

（3）多酶策略與修飾識(shí)別：支持定制化多酶方案，適配各類復(fù)雜樣本與修飾類型；

（4）驗(yàn)證支持：可結(jié)合合成肽驗(yàn)證、功能測(cè)試等手段確認(rèn)序列正確性。

肽從頭測(cè)序，尤其是基于高分辨串聯(lián)質(zhì)譜法的策略，正成為揭示未知蛋白與功能肽段的關(guān)鍵手段。它不僅*數(shù)據(jù)庫(kù)搜索的空白，更在藥物研發(fā)、結(jié)構(gòu)生物學(xué)、合成生物等領(lǐng)域展現(xiàn)廣闊應(yīng)用潛力。

百泰派克生物科技將持續(xù)投入智能化蛋白組技術(shù)平臺(tái)建設(shè)，為科研客戶與生物醫(yī)藥企業(yè)提供更jīngzhǔn、高效的從頭測(cè)序服務(wù)。如您正在尋找zhuānyè的肽從頭測(cè)序方案，歡迎隨時(shí)聯(lián)系我們獲取技術(shù)咨詢與定制化解決方案。

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測(cè)序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測(cè)序系統(tǒng)對(duì)dànbáizhì序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測(cè)序分析服務(wù)，包括對(duì)dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對(duì)于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測(cè)序法的dànbáizhì從頭測(cè)序服務(wù)，對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測(cè)定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測(cè)定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測(cè)定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測(cè);

6.測(cè)序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測(cè)較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.技術(shù)優(yōu)良，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問(wèn)題?？稍趩渭?xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測(cè)51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測(cè)細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過(guò)我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測(cè)平臺(tái)

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測(cè)和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過(guò)CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù)；

2.獲國(guó)家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái)，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

通過(guò)串聯(lián)質(zhì)譜法進(jìn)行肽從頭測(cè)序檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹