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希伯來大學-3D水凝膠單細胞培養(yǎng)研究
這是微納立方第32篇微流控推文。
Bavli等人基于液滴微流控技術，研發(fā)了一種名為“CloneSeq"的高靈敏單細胞分析平臺，可用于3D細胞培養(yǎng)的全面表征，揭示了新的癌癥特異性亞群的存在，并于2021年在Dev. Cell期刊發(fā)表論文（影響引子12.861，論文鏈接見文末）。
（科學家和他們的微流控實驗平臺：為了實現穩(wěn)定又精確的微流體控制，獲取誤差最小的數據，他們采購了幾十個法國Fluigent的壓力泵、流量計和旋轉閥等部件，搭建了一套通用型微流控綜合實驗平臺）
Bavli等人的實驗大致可分為兩步：
第1步，在3D水凝膠中完成單細胞的封裝，并進行克隆擴增，流速范圍為8至34μL/min，每秒生成700個水凝膠微球。
（水凝膠單細胞封裝方案示意圖）
（單細胞封裝與克隆示意圖）
第2步，進行克隆分析，作者設計了另一種微流體方案來捕獲微滴中的克隆，并使用InDrops protocol對其進行條碼化。
（InDrops protocol的微流體方案）
（捕捉到的圖像：Single Clone和Barcode Bead被封裝于同一微滴）
實驗完成后，作者使用Fluigent十轉一閥門M-Switch清洗方案，自動完成實驗儀器和管路的清洗。
論文：Bavli, D. et al. CloneSeq: A highly sensitive analysis platform for the characterization of 3D-cultured single-cell-derived clones. Dev. Cell (2021).
DOI: 10.1016/j.devcel.2021.04.026